- ICH GCP
- Реестр клинических исследований США
- Клиническое испытание NCT05793515
Механизмы наследственных дистрофий сетчатки с использованием полногеномного секвенирования и моделей in vitro и in vivo
«Понимание генетической недостающей изменчивости и патогенетических механизмов наследственных дистрофий сетчатки с использованием полногеномного секвенирования и моделей in vitro и in vivo»
Наследственные дистрофии сетчатки (IRDs), большая группа гетерогенных и редких заболеваний, могут привести к необратимой двусторонней потере зрения и слепоте. Характеристика генетических основ ИРЗ поможет понять патогенез, лежащий в основе развития повреждения сетчатки. Несмотря на успехи в молекулярной идентификации генов, вызывающих заболевание, нерешенные ИРЗ составляют около 40% всех случаев.
Целью данного исследования является определение отсутствующей наследственности при ИРЗ с использованием полногеномного секвенирования (WGS) для выявления генетических причин у клинически хорошо охарактеризованных пациентов без молекулярного диагноза.
Идентификация новых генов, играющих роль в развитии или поддержании функции сетчатки, приведет к разработке новых терапевтических подходов и будет способствовать более быстрой диагностике и улучшению лечения пациентов.
Обзор исследования
Статус
Вмешательство/лечение
Подробное описание
ИРЗ представляют собой редкие нейродегенеративные и генетически гетерогенные состояния с широким спектром проявлений, даже среди пораженных членов одной семьи. Эти заболевания демонстрируют широкий спектр фенотипов со значительным перекрытием, которые можно в целом разделить на три основные группы: заболевания, в основном поражающие периферию, такие как пигментный ретинит (РП) и хороидеремия; те, которые в первую очередь затрагивают макулу, известные как «макулярные» или «центральные» дистрофии; и те, которые поражают как центр, так и периферию, как это наблюдается при дистрофиях палочек-колбочек или палочек-колбочек. В совокупности ИРЗ имеют заболеваемость 1: 2000, затрагивая ок. 2 миллиона человек во всем мире и пациенты с прогрессирующим нарушением зрения. Зараженные лица могут отслеживаться с помощью измерения остроты зрения, оценки поля зрения, записи электроретинографии (ЭРГ), структурной визуализации с аутофлуоресценцией, оптической когерентной томографии в спектральной области (ОКТ) и ОКТ-ангиографии. Хотя с помощью этих инновационных и неинвазивных инструментов можно поставить точный клинический диагноз, генетическое тестирование необходимо для подтверждения конкретного фенотипа, а сегрегационный анализ может выявить характер наследования. Подходы к открытию генов показали, что за эти дегенеративные заболевания ответственны мутации около 280 различных генов, участвующих в развитии глаз, выживании фоторецепторов, механизмах фототрансдукции, ретиноидном цикле, ферментативной функции сетчатки или клеточной структуре (RetNet. Доступно по адресу: https://sph.uth.edu/retnet/), а тип наследования может быть аутосомно-доминантным, рецессивным или сцепленным с Х-хромосомой.
Чтобы повысить вероятность успеха генетической/геномной диагностики, были изучены новые технологии секвенирования, начиная от целевого секвенирования, ориентированного на мультигенные панели, и заканчивая секвенированием всего экзома (WES) и секвенированием всего генома (WGS). Из-за генетической гетерогенности ИРЗ совпадение клинического и молекулярного диагноза является необходимой целью для точного определения фенотипа и повышения вероятности терапевтически выгодных стратегий.
Основная задача состоит в идентификации новых генов, кодирующих заболевания. На эту крайнюю генетическую гетерогенность приходится около 30% неудачных попыток молекулярной диагностики. С возможностью исследования WES или WGS открываются более широкие окна для открытия генов.
Тип исследования
Регистрация (Действительный)
Контакты и местонахождение
Места учебы
-
-
-
Rome, Италия, 00161
- Istituto Superiore di Sanità-Dpt. Oncology and Molecular Medicine
-
-
Критерии участия
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
Принимает здоровых добровольцев
Метод выборки
Исследуемая популяция
Описание
Критерии включения:
- Пациенты с дистрофией сетчатки и зрительного нерва предположительно наследственной природы.
- Пробанды с клиническим наблюдением не менее 12 месяцев.
- Пациенты с неубедительным молекулярным диагнозом с помощью молекулярно-генетических тестов на гены, известные на сегодняшний день для диагностированной патологии.
Критерий исключения:
- Пациенты с клиническим диагнозом не доказанного генетического происхождения.
- Пациенты, у которых отсутствуют образцы родителей или родственников второй степени родства.
- Пациенты, которые отказываются быть проинформированными о полученных генетических результатах, включая случайные, клинически значимые, подтвержденные и требующие принятия мер для самого пациента и/или его семьи.
Учебный план
Как устроено исследование?
Детали дизайна
Когорты и вмешательства
Группа / когорта |
Вмешательство/лечение |
|---|---|
|
FB_001
Пробанд, пораженный ИРЗ, и больные и/или здоровые родственники без молекулярной диагностики.
|
Полногеномное секвенирование будет проводиться у пациентов с отрицательным результатом теста на целевое повторное секвенирование и/или клиническое секвенирование экзома.
|
|
FB_002
Пробанд, пораженный ИРЗ, и больные и/или здоровые родственники без молекулярной диагностики.
|
Полногеномное секвенирование будет проводиться у пациентов с отрицательным результатом теста на целевое повторное секвенирование и/или клиническое секвенирование экзома.
|
|
FB_003
Пробанд, пораженный ИРЗ, и больные и/или здоровые родственники без молекулярной диагностики.
|
Полногеномное секвенирование будет проводиться у пациентов с отрицательным результатом теста на целевое повторное секвенирование и/или клиническое секвенирование экзома.
|
|
FB_004
Пробанд, пораженный ИРЗ, и больные и/или здоровые родственники без молекулярной диагностики.
|
Полногеномное секвенирование будет проводиться у пациентов с отрицательным результатом теста на целевое повторное секвенирование и/или клиническое секвенирование экзома.
|
|
FB_005
Пробанд, пораженный ИРЗ, и больные и/или здоровые родственники без молекулярной диагностики.
|
Полногеномное секвенирование будет проводиться у пациентов с отрицательным результатом теста на целевое повторное секвенирование и/или клиническое секвенирование экзома.
|
|
FB_006
Пробанд, пораженный ИРЗ, и больные и/или здоровые родственники без молекулярной диагностики.
|
Полногеномное секвенирование будет проводиться у пациентов с отрицательным результатом теста на целевое повторное секвенирование и/или клиническое секвенирование экзома.
|
|
FB_007
Пробанд, пораженный ИРЗ, и больные и/или здоровые родственники без молекулярной диагностики.
|
Полногеномное секвенирование будет проводиться у пациентов с отрицательным результатом теста на целевое повторное секвенирование и/или клиническое секвенирование экзома.
|
|
FB_008
Пробанд, пораженный ИРЗ, и больные и/или здоровые родственники без молекулярной диагностики.
|
Полногеномное секвенирование будет проводиться у пациентов с отрицательным результатом теста на целевое повторное секвенирование и/или клиническое секвенирование экзома.
|
|
FB_009
Пробанд, пораженный ИРЗ, и больные и/или здоровые родственники без молекулярной диагностики.
|
Полногеномное секвенирование будет проводиться у пациентов с отрицательным результатом теста на целевое повторное секвенирование и/или клиническое секвенирование экзома.
|
|
FB_0010
Пробанд, пораженный ИРЗ, и больные и/или здоровые родственники без молекулярной диагностики.
|
Полногеномное секвенирование будет проводиться у пациентов с отрицательным результатом теста на целевое повторное секвенирование и/или клиническое секвенирование экзома.
|
|
FB_0011
Пробанд, пораженный ИРЗ, и больные и/или здоровые родственники без молекулярной диагностики.
|
Полногеномное секвенирование будет проводиться у пациентов с отрицательным результатом теста на целевое повторное секвенирование и/или клиническое секвенирование экзома.
|
|
FB_0012
Пробанд, пораженный ИРЗ, и больные и/или здоровые родственники без молекулярной диагностики.
|
Полногеномное секвенирование будет проводиться у пациентов с отрицательным результатом теста на целевое повторное секвенирование и/или клиническое секвенирование экзома.
|
|
FB_0013
Пробанд, пораженный ИРЗ, и больные и/или здоровые родственники без молекулярной диагностики.
|
Полногеномное секвенирование будет проводиться у пациентов с отрицательным результатом теста на целевое повторное секвенирование и/или клиническое секвенирование экзома.
|
|
FB_0014
Пробанд, пораженный ИРЗ, и больные и/или здоровые родственники без молекулярной диагностики.
|
Полногеномное секвенирование будет проводиться у пациентов с отрицательным результатом теста на целевое повторное секвенирование и/или клиническое секвенирование экзома.
|
|
FB_0015
Пробанд, пораженный ИРЗ, и больные и/или здоровые родственники без молекулярной диагностики.
|
Полногеномное секвенирование будет проводиться у пациентов с отрицательным результатом теста на целевое повторное секвенирование и/или клиническое секвенирование экзома.
|
|
FB_0016
Пробанд, пораженный ИРЗ, и больные и/или здоровые родственники без молекулярной диагностики.
|
Полногеномное секвенирование будет проводиться у пациентов с отрицательным результатом теста на целевое повторное секвенирование и/или клиническое секвенирование экзома.
|
|
FB_0017
Пробанд, пораженный ИРЗ, и больные и/или здоровые родственники без молекулярной диагностики.
|
Полногеномное секвенирование будет проводиться у пациентов с отрицательным результатом теста на целевое повторное секвенирование и/или клиническое секвенирование экзома.
|
|
FB_0018
Пробанд, пораженный ИРЗ, и больные и/или здоровые родственники без молекулярной диагностики.
|
Полногеномное секвенирование будет проводиться у пациентов с отрицательным результатом теста на целевое повторное секвенирование и/или клиническое секвенирование экзома.
|
|
FB_0019
Пробанд, пораженный ИРЗ, и больные и/или здоровые родственники без молекулярной диагностики.
|
Полногеномное секвенирование будет проводиться у пациентов с отрицательным результатом теста на целевое повторное секвенирование и/или клиническое секвенирование экзома.
|
|
FB_0020
Пробанд, пораженный ИРЗ, и больные и/или здоровые родственники без молекулярной диагностики.
|
Полногеномное секвенирование будет проводиться у пациентов с отрицательным результатом теста на целевое повторное секвенирование и/или клиническое секвенирование экзома.
|
|
FB_0021
Пробанд, пораженный ИРЗ, и больные и/или здоровые родственники без молекулярной диагностики.
|
Полногеномное секвенирование будет проводиться у пациентов с отрицательным результатом теста на целевое повторное секвенирование и/или клиническое секвенирование экзома.
|
|
FB_0022
Пробанд, пораженный ИРЗ, и больные и/или здоровые родственники без молекулярной диагностики.
|
Полногеномное секвенирование будет проводиться у пациентов с отрицательным результатом теста на целевое повторное секвенирование и/или клиническое секвенирование экзома.
|
|
FB_0023
Пробанд, пораженный ИРЗ, и больные и/или здоровые родственники без молекулярной диагностики.
|
Полногеномное секвенирование будет проводиться у пациентов с отрицательным результатом теста на целевое повторное секвенирование и/или клиническое секвенирование экзома.
|
|
FB_0024
Пробанд, пораженный ИРЗ, и больные и/или здоровые родственники без молекулярной диагностики.
|
Полногеномное секвенирование будет проводиться у пациентов с отрицательным результатом теста на целевое повторное секвенирование и/или клиническое секвенирование экзома.
|
|
FB_0025
Пробанд, пораженный ИРЗ, и больные и/или здоровые родственники без молекулярной диагностики.
|
Полногеномное секвенирование будет проводиться у пациентов с отрицательным результатом теста на целевое повторное секвенирование и/или клиническое секвенирование экзома.
|
|
FB_0026
Пробанд, пораженный ИРЗ, и больные и/или здоровые родственники без молекулярной диагностики.
|
Полногеномное секвенирование будет проводиться у пациентов с отрицательным результатом теста на целевое повторное секвенирование и/или клиническое секвенирование экзома.
|
|
FB_0027
Пробанд, пораженный ИРЗ, и больные и/или здоровые родственники без молекулярной диагностики.
|
Полногеномное секвенирование будет проводиться у пациентов с отрицательным результатом теста на целевое повторное секвенирование и/или клиническое секвенирование экзома.
|
|
FB_0028
Пробанд, пораженный ИРЗ, и больные и/или здоровые родственники без молекулярной диагностики.
|
Полногеномное секвенирование будет проводиться у пациентов с отрицательным результатом теста на целевое повторное секвенирование и/или клиническое секвенирование экзома.
|
|
FB_0029
Пробанд, пораженный ИРЗ, и больные и/или здоровые родственники без молекулярной диагностики.
|
Полногеномное секвенирование будет проводиться у пациентов с отрицательным результатом теста на целевое повторное секвенирование и/или клиническое секвенирование экзома.
|
|
FB_0030
Пробанд, пораженный ИРЗ, и больные и/или здоровые родственники без молекулярной диагностики.
|
Полногеномное секвенирование будет проводиться у пациентов с отрицательным результатом теста на целевое повторное секвенирование и/или клиническое секвенирование экзома.
|
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Понимание генетически отсутствующих патогенетических вариантов при ИРЗ
Временное ограничение: два года
|
Идентификация генетических вариантов, вызывающих клинический фенотип
|
два года
|
Вторичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Открытие генов в IRD
Временное ограничение: два года
|
Идентификация генов новых заболеваний, ответственных за IRD.
|
два года
|
Другие показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Оценка патогенности вновь выявленного(ых) варианта(ов) с помощью функциональных исследований.
Временное ограничение: три года
|
Функциональная характеристика новых вариантов на моделях in vivo и in vitro
|
три года
|
Соавторы и исследователи
Спонсор
Следователи
- Главный следователь: Viviana Cordeddu, PhD, Istituto Superiore di Sanità
Публикации и полезные ссылки
Общие публикации
- Cremers FPM, Boon CJF, Bujakowska K, Zeitz C. Special Issue Introduction: Inherited Retinal Disease: Novel Candidate Genes, Genotype-Phenotype Correlations, and Inheritance Models. Genes (Basel). 2018 Apr 16;9(4):215. doi: 10.3390/genes9040215.
- Ziccardi L, Cordeddu V, Gaddini L, Matteucci A, Parravano M, Malchiodi-Albedi F, Varano M. Gene Therapy in Retinal Dystrophies. Int J Mol Sci. 2019 Nov 14;20(22):5722. doi: 10.3390/ijms20225722.
- Cordeddu V, Redeker B, Stellacci E, Jongejan A, Fragale A, Bradley TE, Anselmi M, Ciolfi A, Cecchetti S, Muto V, Bernardini L, Azage M, Carvalho DR, Espay AJ, Male A, Molin AM, Posmyk R, Battisti C, Casertano A, Melis D, van Kampen A, Baas F, Mannens MM, Bocchinfuso G, Stella L, Tartaglia M, Hennekam RC. Mutations in ZBTB20 cause Primrose syndrome. Nat Genet. 2014 Aug;46(8):815-7. doi: 10.1038/ng.3035. Epub 2014 Jul 13.
- Musacchia F, Ciolfi A, Mutarelli M, Bruselles A, Castello R, Pinelli M, Basu S, Banfi S, Casari G, Tartaglia M, Nigro V; TUDP. VarGenius executes cohort-level DNA-seq variant calling and annotation and allows to manage the resulting data through a PostgreSQL database. BMC Bioinformatics. 2018 Dec 12;19(1):477. doi: 10.1186/s12859-018-2532-4.
Даты записи исследования
Изучение основных дат
Начало исследования (Действительный)
Первичное завершение (Действительный)
Завершение исследования (Действительный)
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
Первый опубликованный (Действительный)
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (Действительный)
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
Последняя проверка
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Ключевые слова
Дополнительные соответствующие термины MeSH
Другие идентификационные номера исследования
- ISS20-5656c541c257
Планирование данных отдельных участников (IPD)
Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?
Описание плана IPD
Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы
Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.
Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.
продукт, произведенный в США и экспортированный из США.
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .