全ゲノム配列決定と in Vitro および in Vivo モデルを使用した遺伝性網膜ジストロフィーのメカニズム
「全ゲノムシーケンシングおよびインビトロおよびインビボモデルを使用した遺伝性網膜ジストロフィーの遺伝的欠損変動性と病因メカニズムの理解」
遺伝性網膜ジストロフィー (IRD) は、不均一でまれな疾患の大規模なグループであり、不可逆的な両側性の視力喪失と失明を引き起こす可能性があります。 IRD の遺伝的基盤を特徴付けると、網膜損傷の発生の根底にある病因を理解するのに役立ちます。 疾患を引き起こす遺伝子の分子同定の進歩にもかかわらず、未解決の IRD は全症例の約 40% を占めています。
この研究の目的は、全ゲノム配列決定 (WGS) を使用して IRD の遺伝率の欠落を解決し、分子診断なしで臨床的に十分に特徴付けられた患者の遺伝的原因を特定することです。
網膜機能の発達または維持に役割を果たす新規遺伝子の同定は、新しい治療アプローチの開発につながり、より迅速な診断と患者管理の改善に有利に働くでしょう。
調査の概要
詳細な説明
IRD はまれな神経変性疾患であり、遺伝的に異質な状態であり、同じ家族の罹患者の間でも幅広い症状が見られます。 これらの障害は、大幅に重複する広範囲の表現型を示し、大きく 3 つの主なグループに分けることができます。 「黄斑」または「中央」ジストロフィーとして知られる、主に黄斑に関係するもの。そして、錐体 - 桿体または桿体 - 錐体ジストロフィーに見られるように、中心と周辺の両方に影響を与えるもの。 全体として、IRD の発生率は 1:2000 で、約世界中で 200 万人の患者がおり、患者は次第に視覚障害を持っています。 影響を受けた個人は、視力測定、視野評価、網膜電図記録 (ERG)、自己蛍光による構造イメージング、スペクトル領域光コヒーレンストモグラフィー (OCT)、および OCT 血管造影によってフォローアップできます。 これらの革新的で非侵襲的なツールによって正確な臨床診断に到達できますが、特定の表現型を確認するには遺伝子検査が必要であり、分離分析は遺伝パターンに対処できます。 遺伝子発見アプローチにより、眼の発達、光受容体の生存、光伝達機構、レチノイドサイクル、網膜酵素機能、または細胞構造に関与する約 280 の異なる遺伝子の変異が、これらの変性疾患の原因であることが明らかになりました (RetNet. 入手可能: https://sph.uth.edu/retnet/) であり、遺伝パターンは常染色体優性、劣性、または X 連鎖である可能性があります。
遺伝子/ゲノム診断の成功率を向上させるために、マルチ遺伝子パネルに焦点を当てたターゲット シーケンスから全エクソーム シーケンス (WES) および全ゲノムのシーケンス (WGS) に至るまで、新しいシーケンス技術が調査されています。 IRD の遺伝的不均一性のため、表現型を正確に特徴付け、治療的に有益な戦略の可能性を高めるために、臨床診断と分子診断の一致が必要な目標です。
主な課題は、疾患をコードする新規遺伝子を特定することです。 この極端な遺伝的不均一性は、分子診断の検出失敗の約 30% を占めています。 WES または WGS を調査する可能性があるため、遺伝子発見のためのより広い窓が開かれます。
研究の種類
入学 (予想される)
連絡先と場所
研究連絡先
- 名前:Viviana Cordeddu, PhD
- 電話番号:3441 +39-06-4990
- メール:viviana.cordeddu@iss.it
研究連絡先のバックアップ
- 名前:Elena Toschi, MD
- 電話番号:6554 +39-06-4990
- メール:elena.toschi@iss.it
研究場所
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-
-
Rome、イタリア、00161
- 募集
- Istituto Superiore di Sanità-Dpt. Oncology and Molecular Medicine
-
コンタクト:
- Viviana Cordeddu, PhD
- 電話番号:3441 +39-06-4990
- メール:viviana.cordeddu@iss.it
-
コンタクト:
- Emilia Stellacci, MS
- 電話番号:3197 +39-06-4990
- メール:emilia.stellacci@iss.it
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副調査官:
- Lucia Ziccardi, MD-PhD
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参加基準
適格基準
就学可能な年齢
健康ボランティアの受け入れ
受講資格のある性別
サンプリング方法
調査対象母集団
説明
包含基準:
- -遺伝性の疑いのある網膜および視神経ジストロフィーの患者。
- -少なくとも12か月の臨床追跡調査を受けた発端者。
- 診断された病状について現在までに知られている遺伝子の分子遺伝学的検査による決定的な分子診断の患者。
除外基準:
- -遺伝的起源が証明されていない臨床診断を受けた患者。
- 両親または二親等の血縁者のサンプルが入手できない患者。
- 患者自身および/または彼の家族にとって臨床的に関連し、検証され、実行可能な偶発的なものを含む、得られた遺伝学的結果の通知を拒否する患者。
研究計画
研究はどのように設計されていますか?
デザインの詳細
コホートと介入
グループ/コホート |
介入・治療 |
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IRDに罹患している発端者、および分子診断を受けていない罹患および/または罹患していない近親者。
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全ゲノムシーケンシングは、ターゲットリシーケンシングおよび/または臨床エクソームシーケンシングの検査が陰性であった患者で実施されます。
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IRDに罹患している発端者、および分子診断を受けていない罹患および/または罹患していない近親者。
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全ゲノムシーケンシングは、ターゲットリシーケンシングおよび/または臨床エクソームシーケンシングの検査が陰性であった患者で実施されます。
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IRDに罹患している発端者、および分子診断を受けていない罹患および/または罹患していない近親者。
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全ゲノムシーケンシングは、ターゲットリシーケンシングおよび/または臨床エクソームシーケンシングの検査が陰性であった患者で実施されます。
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IRDに罹患している発端者、および分子診断を受けていない罹患および/または罹患していない近親者。
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全ゲノムシーケンシングは、ターゲットリシーケンシングおよび/または臨床エクソームシーケンシングの検査が陰性であった患者で実施されます。
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IRDに罹患している発端者、および分子診断を受けていない罹患および/または罹患していない近親者。
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全ゲノムシーケンシングは、ターゲットリシーケンシングおよび/または臨床エクソームシーケンシングの検査が陰性であった患者で実施されます。
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IRDに罹患している発端者、および分子診断を受けていない罹患および/または罹患していない近親者。
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全ゲノムシーケンシングは、ターゲットリシーケンシングおよび/または臨床エクソームシーケンシングの検査が陰性であった患者で実施されます。
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IRDに罹患している発端者、および分子診断を受けていない罹患および/または罹患していない近親者。
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全ゲノムシーケンシングは、ターゲットリシーケンシングおよび/または臨床エクソームシーケンシングの検査が陰性であった患者で実施されます。
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IRDに罹患している発端者、および分子診断を受けていない罹患および/または罹患していない近親者。
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全ゲノムシーケンシングは、ターゲットリシーケンシングおよび/または臨床エクソームシーケンシングの検査が陰性であった患者で実施されます。
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IRDに罹患している発端者、および分子診断を受けていない罹患および/または罹患していない近親者。
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全ゲノムシーケンシングは、ターゲットリシーケンシングおよび/または臨床エクソームシーケンシングの検査が陰性であった患者で実施されます。
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IRDに罹患している発端者、および分子診断を受けていない罹患および/または罹患していない近親者。
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全ゲノムシーケンシングは、ターゲットリシーケンシングおよび/または臨床エクソームシーケンシングの検査が陰性であった患者で実施されます。
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IRDに罹患している発端者、および分子診断を受けていない罹患および/または罹患していない近親者。
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全ゲノムシーケンシングは、ターゲットリシーケンシングおよび/または臨床エクソームシーケンシングの検査が陰性であった患者で実施されます。
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IRDに罹患している発端者、および分子診断を受けていない罹患および/または罹患していない近親者。
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全ゲノムシーケンシングは、ターゲットリシーケンシングおよび/または臨床エクソームシーケンシングの検査が陰性であった患者で実施されます。
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IRDに罹患している発端者、および分子診断を受けていない罹患および/または罹患していない近親者。
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全ゲノムシーケンシングは、ターゲットリシーケンシングおよび/または臨床エクソームシーケンシングの検査が陰性であった患者で実施されます。
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IRDに罹患している発端者、および分子診断を受けていない罹患および/または罹患していない近親者。
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全ゲノムシーケンシングは、ターゲットリシーケンシングおよび/または臨床エクソームシーケンシングの検査が陰性であった患者で実施されます。
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IRDに罹患している発端者、および分子診断を受けていない罹患および/または罹患していない近親者。
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全ゲノムシーケンシングは、ターゲットリシーケンシングおよび/または臨床エクソームシーケンシングの検査が陰性であった患者で実施されます。
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IRDに罹患している発端者、および分子診断を受けていない罹患および/または罹患していない近親者。
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全ゲノムシーケンシングは、ターゲットリシーケンシングおよび/または臨床エクソームシーケンシングの検査が陰性であった患者で実施されます。
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全ゲノムシーケンシングは、ターゲットリシーケンシングおよび/または臨床エクソームシーケンシングの検査が陰性であった患者で実施されます。
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全ゲノムシーケンシングは、ターゲットリシーケンシングおよび/または臨床エクソームシーケンシングの検査が陰性であった患者で実施されます。
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IRDに罹患している発端者、および分子診断を受けていない罹患および/または罹患していない近親者。
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全ゲノムシーケンシングは、ターゲットリシーケンシングおよび/または臨床エクソームシーケンシングの検査が陰性であった患者で実施されます。
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IRDに罹患している発端者、および分子診断を受けていない罹患および/または罹患していない近親者。
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全ゲノムシーケンシングは、ターゲットリシーケンシングおよび/または臨床エクソームシーケンシングの検査が陰性であった患者で実施されます。
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IRDに罹患している発端者、および分子診断を受けていない罹患および/または罹患していない近親者。
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全ゲノムシーケンシングは、ターゲットリシーケンシングおよび/または臨床エクソームシーケンシングの検査が陰性であった患者で実施されます。
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IRDに罹患している発端者、および分子診断を受けていない罹患および/または罹患していない近親者。
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全ゲノムシーケンシングは、ターゲットリシーケンシングおよび/または臨床エクソームシーケンシングの検査が陰性であった患者で実施されます。
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IRDに罹患している発端者、および分子診断を受けていない罹患および/または罹患していない近親者。
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全ゲノムシーケンシングは、ターゲットリシーケンシングおよび/または臨床エクソームシーケンシングの検査が陰性であった患者で実施されます。
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IRDに罹患している発端者、および分子診断を受けていない罹患および/または罹患していない近親者。
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全ゲノムシーケンシングは、ターゲットリシーケンシングおよび/または臨床エクソームシーケンシングの検査が陰性であった患者で実施されます。
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この研究は何を測定していますか?
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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IRDにおける遺伝的欠損病原性バリアントの理解
時間枠:2年
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臨床表現型の原因となる遺伝的変異の同定
|
2年
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二次結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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IRDにおける遺伝子発見
時間枠:2年
|
IRDの原因となる新規疾患遺伝子の同定。
|
2年
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その他の成果指標
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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機能研究による新たに同定されたバリアントの病原性の評価。
時間枠:3年
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In vivo および in vitro モデルによる新しいバリアントの機能特性評価
|
3年
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協力者と研究者
捜査官
- 主任研究者:Viviana Cordeddu, PhD、Istituto Superiore di Sanità
出版物と役立つリンク
一般刊行物
- Cremers FPM, Boon CJF, Bujakowska K, Zeitz C. Special Issue Introduction: Inherited Retinal Disease: Novel Candidate Genes, Genotype-Phenotype Correlations, and Inheritance Models. Genes (Basel). 2018 Apr 16;9(4):215. doi: 10.3390/genes9040215.
- Ziccardi L, Cordeddu V, Gaddini L, Matteucci A, Parravano M, Malchiodi-Albedi F, Varano M. Gene Therapy in Retinal Dystrophies. Int J Mol Sci. 2019 Nov 14;20(22):5722. doi: 10.3390/ijms20225722.
- Cordeddu V, Redeker B, Stellacci E, Jongejan A, Fragale A, Bradley TE, Anselmi M, Ciolfi A, Cecchetti S, Muto V, Bernardini L, Azage M, Carvalho DR, Espay AJ, Male A, Molin AM, Posmyk R, Battisti C, Casertano A, Melis D, van Kampen A, Baas F, Mannens MM, Bocchinfuso G, Stella L, Tartaglia M, Hennekam RC. Mutations in ZBTB20 cause Primrose syndrome. Nat Genet. 2014 Aug;46(8):815-7. doi: 10.1038/ng.3035. Epub 2014 Jul 13.
- Musacchia F, Ciolfi A, Mutarelli M, Bruselles A, Castello R, Pinelli M, Basu S, Banfi S, Casari G, Tartaglia M, Nigro V; TUDP. VarGenius executes cohort-level DNA-seq variant calling and annotation and allows to manage the resulting data through a PostgreSQL database. BMC Bioinformatics. 2018 Dec 12;19(1):477. doi: 10.1186/s12859-018-2532-4.
研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (実際)
一次修了 (予想される)
研究の完了 (予想される)
試験登録日
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (実際)
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
詳しくは
本研究に関する用語
キーワード
その他の研究ID番号
- ISS20-5656c541c257
個々の参加者データ (IPD) の計画
個々の参加者データ (IPD) を共有する予定はありますか?
IPD プランの説明
医薬品およびデバイス情報、研究文書
米国FDA規制医薬品の研究
米国FDA規制機器製品の研究
この情報は、Web サイト clinicaltrials.gov から変更なしで直接取得したものです。研究の詳細を変更、削除、または更新するリクエストがある場合は、register@clinicaltrials.gov。 までご連絡ください。 clinicaltrials.gov に変更が加えられるとすぐに、ウェブサイトでも自動的に更新されます。
全ゲノムシーケンシングの臨床試験
-
University of PennsylvaniaSequenom, Inc/Laboratory Corporation of America Holdings完了
-
San Francisco Veterans Affairs Medical Center募集