Tato stránka byla automaticky přeložena a přesnost překladu není zaručena. Podívejte se prosím na anglická verze pro zdrojový text.

Mechanismy dědičných retinálních dystrofií využívající sekvenování celého genomu a modely in vitro a in vivo

30. března 2023 aktualizováno: Viviana Cordeddu, Istituto Superiore di Sanità

„Pochopení genetické chybějící variability a patogenetických mechanismů dědičných retinálních dystrofií pomocí sekvenování celého genomu a modelů in vitro a in vivo“

Dědičné retinální dystrofie (IRD), velká skupina heterogenních a vzácných poruch, mohou vést k nevratné bilaterální ztrátě zraku a slepotě. Charakterizace genetických základů IRD pomůže pochopit patogenezi, která je základem rozvoje poškození sítnice. Navzdory pokrokům v molekulární identifikaci genů způsobujících onemocnění tvoří nevyřešené IRD asi 40 % všech případů.

Cílem této studie je vyřešit chybějící dědičnost u IRD pomocí sekvenování celého genomu (WGS) k identifikaci genetických příčin u klinicky dobře charakterizovaných pacientů bez molekulární diagnózy.

Identifikace nových genů, které hrají roli ve vývoji nebo udržování funkce sítnice, povede k vývoji nových terapeutických přístupů a podpoří rychlejší diagnostiku a zlepšení léčby pacientů.

Přehled studie

Detailní popis

IRD jsou vzácné neurodegenerativní a geneticky heterogenní stavy se širokým spektrem prezentací, a to i mezi postiženými členy stejné rodiny. Tyto poruchy vykazují širokou škálu fenotypů s významným překrýváním, které lze široce rozdělit do tří hlavních skupin: ty, které postihují především periferii, jako je retinitis pigmentosa (RP) a choroideremie; ty, které primárně zahrnují makulu, známé jako „makulární“ nebo „centrální“ dystrofie; a ty, které postihují jak centrum, tak periferii, jak je vidět u dystrofie typu kužel-tyč nebo tyčinka-kužel. Dohromady mají IRD výskyt 1:2000, což má dopad na cca. 2 miliony lidí na celém světě a pacienti jsou progresivně zrakově postižení. Postižení jedinci mohou být sledováni měřením zrakové ostrosti, hodnocením zorného pole, elektroretinografickými záznamy (ERG), strukturálním zobrazením s autofluorescencí, optickou koherentní tomografií ve spektrální oblasti (OCT) a OCT angiografií. I když lze pomocí těchto inovativních a neinvazivních nástrojů dosáhnout přesné klinické diagnózy, k potvrzení specifického fenotypu je nezbytné genetické testování a segregační analýza se může zabývat vzorem dědičnosti. Přístupy k objevování genů objasnily, že za tato degenerativní onemocnění jsou zodpovědné mutace asi 280 různých genů zapojených do vývoje očí, přežití fotoreceptorů, fototransdukčních mechanismů, retinoidního cyklu, enzymatické funkce sítnice nebo buněčné struktury (RetNet. Dostupné na: https://sph.uth.edu/retnet/) a vzor dědičnosti může být autozomálně dominantní, recesivní nebo X-vázaný.

Ke zlepšení úspěšnosti genetické/genomické diagnostiky byly prozkoumány nové technologie sekvenování, počínaje cíleným sekvenováním zaměřeným na multigenové panely až po sekvenování celého exomu (WES) a sekvenování celého genomu (WGS). Vzhledem ke genetické heterogenitě IRD je shoda klinické a molekulární diagnózy nezbytným cílem pro přesnou charakterizaci fenotypu a pro zvýšení šance na terapeuticky přínosné strategie.

Velký problém spočívá v identifikaci nových genů kódujících tato onemocnění. Tato extrémní genetická heterogenita představuje asi 30 % selhání detekce molekulární diagnostiky. S možností vyšetřování WES nebo WGS se otevírají širší okna pro objev genů.

Typ studie

Pozorovací

Zápis (Očekávaný)

120

Kontakty a umístění

Tato část poskytuje kontaktní údaje pro ty, kteří studii provádějí, a informace o tom, kde se tato studie provádí.

Studijní kontakt

Studijní záloha kontaktů

Studijní místa

      • Rome, Itálie, 00161
        • Nábor
        • Istituto Superiore di Sanità-Dpt. Oncology and Molecular Medicine
        • Kontakt:
        • Kontakt:
        • Dílčí vyšetřovatel:
          • Lucia Ziccardi, MD-PhD

Kritéria účasti

Výzkumníci hledají lidi, kteří odpovídají určitému popisu, kterému se říká kritéria způsobilosti. Některé příklady těchto kritérií jsou celkový zdravotní stav osoby nebo předchozí léčba.

Kritéria způsobilosti

Věk způsobilý ke studiu

5 let až 80 let (Dítě, Dospělý, Starší dospělý)

Přijímá zdravé dobrovolníky

Ne

Pohlaví způsobilá ke studiu

Všechno

Metoda odběru vzorků

Vzorek nepravděpodobnosti

Studijní populace

Pacienti muži a ženy ve věku 5 až 80 let trpící degenerací sítnice nebo zrakového nervu dědičné povahy. Pacienti budou náborováni na IRCSS Fondazione Bietti v Římě a podstoupí oftalmologická vyšetření a instrumentální testy. Kandidáti jsou klinicky dobře charakterizovanou skupinou pacientů s očními dystrofiemi, včetně IRD, které jsou již klinicky sledovány po dobu alespoň 12 měsíců a bez přesvědčivé molekulární diagnózy.

Popis

Kritéria pro zařazení:

  • Pacienti s dystrofií sítnice a zrakového nervu s podezřením na dědičnou povahu.
  • Probandi s klinickým sledováním minimálně 12 měsíců.
  • Pacienti s neprůkaznou molekulární diagnózou pomocí molekulárně-genetických testů na dosud známé geny pro diagnostikovanou patologii.

Kritéria vyloučení:

  • Pacienti s klinickou diagnózou bez prokázaného genetického původu.
  • Pacienti, jejichž vzorky rodičů nebo příbuzných druhého stupně nejsou k dispozici.
  • Pacienti, kteří odmítají být informováni o získaných genetických výsledcích, včetně náhodných klinicky relevantních, validovaných a použitelných pro samotného pacienta a/nebo jeho rodinu.

Studijní plán

Tato část poskytuje podrobnosti o studijním plánu, včetně toho, jak je studie navržena a co studie měří.

Jak je studie koncipována?

Detaily designu

Kohorty a intervence

Skupina / kohorta
Intervence / Léčba
FB_001
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
FB_002
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
FB_003
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
FB_004
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
FB_005
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
FB_006
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
FB_007
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
FB_008
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
FB_009
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
FB_0010
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
FB_0011
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
FB_0012
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
FB_0013
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
FB_0014
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
FB_0015
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
FB_0016
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
FB_0017
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
FB_0018
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
FB_0019
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
FB_0020
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
FB_0021
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
FB_0022
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
FB_0023
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
FB_0024
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
FB_0025
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
FB_0026
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
FB_0027
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
FB_0028
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
FB_0029
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
FB_0030
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.

Co je měření studie?

Primární výstupní opatření

Měření výsledku
Popis opatření
Časové okno
Pochopení genetických chybějících patogenetických variant u IRD
Časové okno: dva roky
Identifikace genetických variant způsobujících klinický fenotyp
dva roky

Sekundární výstupní opatření

Měření výsledku
Popis opatření
Časové okno
Objev genů v IRD
Časové okno: dva roky
Identifikace nových chorobných genů odpovědných za IRD.
dva roky

Další výstupní opatření

Měření výsledku
Popis opatření
Časové okno
Posouzení patogenity nově identifikované varianty (variancí) pomocí funkčních studií.
Časové okno: tři roky
Funkční charakterizace nových variant pomocí in vivo a in vitro modelů
tři roky

Spolupracovníci a vyšetřovatelé

Zde najdete lidi a organizace zapojené do této studie.

Vyšetřovatelé

  • Vrchní vyšetřovatel: Viviana Cordeddu, PhD, Istituto Superiore di Sanità

Publikace a užitečné odkazy

Osoba odpovědná za zadávání informací o studiu tyto publikace poskytuje dobrovolně. Mohou se týkat čehokoli, co souvisí se studiem.

Termíny studijních záznamů

Tato data sledují průběh záznamů studie a předkládání souhrnných výsledků na ClinicalTrials.gov. Záznamy ze studií a hlášené výsledky jsou před zveřejněním na veřejné webové stránce přezkoumány Národní lékařskou knihovnou (NLM), aby se ujistily, že splňují specifické standardy kontroly kvality.

Hlavní termíny studia

Začátek studia (Aktuální)

15. listopadu 2022

Primární dokončení (Očekávaný)

2. května 2024

Dokončení studie (Očekávaný)

15. listopadu 2025

Termíny zápisu do studia

První předloženo

20. března 2023

První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality

30. března 2023

První zveřejněno (Aktuální)

31. března 2023

Aktualizace studijních záznamů

Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)

31. března 2023

Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality

30. března 2023

Naposledy ověřeno

1. března 2023

Více informací

Termíny související s touto studií

Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)

Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?

NEROZHODNÝ

Popis plánu IPD

Plánujeme sdílet anonymizovaná genomická data mezi třemi partnery zapojenými do studie prostřednictvím telefonických schůzek a sdílených cloudových složek.

Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty

Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA

Ne

Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA

Ne

Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .

Klinické studie na Retinitis Pigmentosa

Klinické studie na sekvenování celého genomu

3
Předplatit