- ICH GCP
- Registr klinických studií v USA
- Klinická studie NCT05793515
Mechanismy dědičných retinálních dystrofií využívající sekvenování celého genomu a modely in vitro a in vivo
„Pochopení genetické chybějící variability a patogenetických mechanismů dědičných retinálních dystrofií pomocí sekvenování celého genomu a modelů in vitro a in vivo“
Dědičné retinální dystrofie (IRD), velká skupina heterogenních a vzácných poruch, mohou vést k nevratné bilaterální ztrátě zraku a slepotě. Charakterizace genetických základů IRD pomůže pochopit patogenezi, která je základem rozvoje poškození sítnice. Navzdory pokrokům v molekulární identifikaci genů způsobujících onemocnění tvoří nevyřešené IRD asi 40 % všech případů.
Cílem této studie je vyřešit chybějící dědičnost u IRD pomocí sekvenování celého genomu (WGS) k identifikaci genetických příčin u klinicky dobře charakterizovaných pacientů bez molekulární diagnózy.
Identifikace nových genů, které hrají roli ve vývoji nebo udržování funkce sítnice, povede k vývoji nových terapeutických přístupů a podpoří rychlejší diagnostiku a zlepšení léčby pacientů.
Přehled studie
Postavení
Intervence / Léčba
Detailní popis
IRD jsou vzácné neurodegenerativní a geneticky heterogenní stavy se širokým spektrem prezentací, a to i mezi postiženými členy stejné rodiny. Tyto poruchy vykazují širokou škálu fenotypů s významným překrýváním, které lze široce rozdělit do tří hlavních skupin: ty, které postihují především periferii, jako je retinitis pigmentosa (RP) a choroideremie; ty, které primárně zahrnují makulu, známé jako „makulární“ nebo „centrální“ dystrofie; a ty, které postihují jak centrum, tak periferii, jak je vidět u dystrofie typu kužel-tyč nebo tyčinka-kužel. Dohromady mají IRD výskyt 1:2000, což má dopad na cca. 2 miliony lidí na celém světě a pacienti jsou progresivně zrakově postižení. Postižení jedinci mohou být sledováni měřením zrakové ostrosti, hodnocením zorného pole, elektroretinografickými záznamy (ERG), strukturálním zobrazením s autofluorescencí, optickou koherentní tomografií ve spektrální oblasti (OCT) a OCT angiografií. I když lze pomocí těchto inovativních a neinvazivních nástrojů dosáhnout přesné klinické diagnózy, k potvrzení specifického fenotypu je nezbytné genetické testování a segregační analýza se může zabývat vzorem dědičnosti. Přístupy k objevování genů objasnily, že za tato degenerativní onemocnění jsou zodpovědné mutace asi 280 různých genů zapojených do vývoje očí, přežití fotoreceptorů, fototransdukčních mechanismů, retinoidního cyklu, enzymatické funkce sítnice nebo buněčné struktury (RetNet. Dostupné na: https://sph.uth.edu/retnet/) a vzor dědičnosti může být autozomálně dominantní, recesivní nebo X-vázaný.
Ke zlepšení úspěšnosti genetické/genomické diagnostiky byly prozkoumány nové technologie sekvenování, počínaje cíleným sekvenováním zaměřeným na multigenové panely až po sekvenování celého exomu (WES) a sekvenování celého genomu (WGS). Vzhledem ke genetické heterogenitě IRD je shoda klinické a molekulární diagnózy nezbytným cílem pro přesnou charakterizaci fenotypu a pro zvýšení šance na terapeuticky přínosné strategie.
Velký problém spočívá v identifikaci nových genů kódujících tato onemocnění. Tato extrémní genetická heterogenita představuje asi 30 % selhání detekce molekulární diagnostiky. S možností vyšetřování WES nebo WGS se otevírají širší okna pro objev genů.
Typ studie
Zápis (Očekávaný)
Kontakty a umístění
Studijní kontakt
- Jméno: Viviana Cordeddu, PhD
- Telefonní číslo: 3441 +39-06-4990
- E-mail: viviana.cordeddu@iss.it
Studijní záloha kontaktů
- Jméno: Elena Toschi, MD
- Telefonní číslo: 6554 +39-06-4990
- E-mail: elena.toschi@iss.it
Studijní místa
-
-
-
Rome, Itálie, 00161
- Nábor
- Istituto Superiore di Sanità-Dpt. Oncology and Molecular Medicine
-
Kontakt:
- Viviana Cordeddu, PhD
- Telefonní číslo: 3441 +39-06-4990
- E-mail: viviana.cordeddu@iss.it
-
Kontakt:
- Emilia Stellacci, MS
- Telefonní číslo: 3197 +39-06-4990
- E-mail: emilia.stellacci@iss.it
-
Dílčí vyšetřovatel:
- Lucia Ziccardi, MD-PhD
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
Přijímá zdravé dobrovolníky
Pohlaví způsobilá ke studiu
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Popis
Kritéria pro zařazení:
- Pacienti s dystrofií sítnice a zrakového nervu s podezřením na dědičnou povahu.
- Probandi s klinickým sledováním minimálně 12 měsíců.
- Pacienti s neprůkaznou molekulární diagnózou pomocí molekulárně-genetických testů na dosud známé geny pro diagnostikovanou patologii.
Kritéria vyloučení:
- Pacienti s klinickou diagnózou bez prokázaného genetického původu.
- Pacienti, jejichž vzorky rodičů nebo příbuzných druhého stupně nejsou k dispozici.
- Pacienti, kteří odmítají být informováni o získaných genetických výsledcích, včetně náhodných klinicky relevantních, validovaných a použitelných pro samotného pacienta a/nebo jeho rodinu.
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
Kohorty a intervence
Skupina / kohorta |
Intervence / Léčba |
---|---|
FB_001
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
|
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
|
FB_002
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
|
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
|
FB_003
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
|
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
|
FB_004
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
|
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
|
FB_005
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
|
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
|
FB_006
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
|
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
|
FB_007
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
|
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
|
FB_008
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
|
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
|
FB_009
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
|
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
|
FB_0010
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
|
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
|
FB_0011
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
|
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
|
FB_0012
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
|
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
|
FB_0013
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
|
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
|
FB_0014
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
|
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
|
FB_0015
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
|
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
|
FB_0016
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
|
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
|
FB_0017
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
|
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
|
FB_0018
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
|
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
|
FB_0019
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
|
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
|
FB_0020
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
|
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
|
FB_0021
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
|
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
|
FB_0022
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
|
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
|
FB_0023
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
|
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
|
FB_0024
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
|
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
|
FB_0025
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
|
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
|
FB_0026
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
|
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
|
FB_0027
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
|
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
|
FB_0028
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
|
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
|
FB_0029
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
|
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
|
FB_0030
Proband postižený IRD a postižení a/nebo nepostižení příbuzní bez molekulární diagnózy.
|
Sekvenování celého genomu bude provedeno u pacientů, jejichž test byl negativní na cílené resekvenování a/nebo klinické exomové sekvenování.
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
---|---|---|
Pochopení genetických chybějících patogenetických variant u IRD
Časové okno: dva roky
|
Identifikace genetických variant způsobujících klinický fenotyp
|
dva roky
|
Sekundární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
---|---|---|
Objev genů v IRD
Časové okno: dva roky
|
Identifikace nových chorobných genů odpovědných za IRD.
|
dva roky
|
Další výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
---|---|---|
Posouzení patogenity nově identifikované varianty (variancí) pomocí funkčních studií.
Časové okno: tři roky
|
Funkční charakterizace nových variant pomocí in vivo a in vitro modelů
|
tři roky
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Sponzor
Vyšetřovatelé
- Vrchní vyšetřovatel: Viviana Cordeddu, PhD, Istituto Superiore di Sanità
Publikace a užitečné odkazy
Obecné publikace
- Cremers FPM, Boon CJF, Bujakowska K, Zeitz C. Special Issue Introduction: Inherited Retinal Disease: Novel Candidate Genes, Genotype-Phenotype Correlations, and Inheritance Models. Genes (Basel). 2018 Apr 16;9(4):215. doi: 10.3390/genes9040215.
- Ziccardi L, Cordeddu V, Gaddini L, Matteucci A, Parravano M, Malchiodi-Albedi F, Varano M. Gene Therapy in Retinal Dystrophies. Int J Mol Sci. 2019 Nov 14;20(22):5722. doi: 10.3390/ijms20225722.
- Cordeddu V, Redeker B, Stellacci E, Jongejan A, Fragale A, Bradley TE, Anselmi M, Ciolfi A, Cecchetti S, Muto V, Bernardini L, Azage M, Carvalho DR, Espay AJ, Male A, Molin AM, Posmyk R, Battisti C, Casertano A, Melis D, van Kampen A, Baas F, Mannens MM, Bocchinfuso G, Stella L, Tartaglia M, Hennekam RC. Mutations in ZBTB20 cause Primrose syndrome. Nat Genet. 2014 Aug;46(8):815-7. doi: 10.1038/ng.3035. Epub 2014 Jul 13.
- Musacchia F, Ciolfi A, Mutarelli M, Bruselles A, Castello R, Pinelli M, Basu S, Banfi S, Casari G, Tartaglia M, Nigro V; TUDP. VarGenius executes cohort-level DNA-seq variant calling and annotation and allows to manage the resulting data through a PostgreSQL database. BMC Bioinformatics. 2018 Dec 12;19(1):477. doi: 10.1186/s12859-018-2532-4.
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
Primární dokončení (Očekávaný)
Dokončení studie (Očekávaný)
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Aktuální)
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Klíčová slova
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
- ISS20-5656c541c257
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
Popis plánu IPD
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .
Klinické studie na Retinitis Pigmentosa
-
Oslo University HospitalNáborRetinitis Pigmentosa | Retinitis Pigmentosa 11Norsko
-
Jinnah Burn and Reconstructive Surgery Centre,...The Layton Rahmatullah Benevolent Trust (LRBT) Free Eye Hospital, Township... a další spolupracovníciNáborRetinitis Pigmentosa (RP)Pákistán
-
AbbVieAktivní, ne náborPokročilá retinitis PigmentosaSpojené státy
-
jCyte, IncCalifornia Institute for Regenerative Medicine (CIRM)DokončenoRetinitis Pigmentosa (RP)Spojené státy
-
MeiraGTx UK II LtdJanssen, LPAktivní, ne náborRetinitis PigmentosaSpojené státy, Spojené království, Kanada
-
Radtke, Norman D., M.D.Foundation Fighting BlindnessDokončenoRetinitis Pigmentosa.Spojené státy
-
QLT Inc.DokončenoRetinitis Pigmentosa (RP)Kanada, Irsko
-
University Hospital, LimogesZatím nenabírámeSyndrom retinitis Pigmentosa
-
Endogena Therapeutics, IncAktivní, ne náborRetinitis Pigmentosa | Syndrom retinitis PigmentosaSpojené státy
-
MeiraGTx UK II LtdSyne Qua Non Limited; Bionical EmasDokončenoX-vázaná retinitida PigmentosaSpojené království, Spojené státy
Klinické studie na sekvenování celého genomu
-
Sequenom, Inc.Columbia UniversityUkončeno
-
First Affiliated Hospital Xi'an Jiaotong UniversityNábor
-
Institut National de la Santé Et de la Recherche...Institut Bergonié; Plateforme labellisée Inca - Institut Bergonié, Bordeaux; Plateforme... a další spolupracovníciDokončenoSarkom měkkých tkání | Kolorektální karcinomFrancie
-
Peking University First HospitalNáborRenální buněčný karcinom | VHL syndromČína
-
Shanghai Jiao Tong University School of MedicineThe First Affiliated Hospital of Nanchang University; The Affiliated Hospital... a další spolupracovníciNáborAutoimunitní gastritidaČína
-
Tianjin Medical University Second HospitalNeznámýSolidní nádor, dospělýČína
-
Institut National de la Santé Et de la Recherche...Commissariat A L'energie Atomique; Imagine InstituteDokončeno
-
Helse-Bergen HFUniversity Hospital of North Norway; Helse FordeDokončenoVývojová dysplazie kyčle
-
Francine Behar-CohenEmory University; University of Lausanne HospitalsDokončenoRhegmatogenní oddělení sítniceŠvýcarsko
-
Shaare Zedek Medical CenterUkončenoŽlučové kameny | Hemolytické poruchyIzrael