호산구 식도염의 Metatrascryptome과 Transcriptome의 메타분석 검증을 위한 단일 중심 후향적 관찰 연구

호산구성 식도염(EoE)은 주로 식품 항원에 의해 활성화되는 만성 식도 염증성 질환으로, Th2 반응 특이적 인터루킨(IL) 5 및 IL13이 발병 과정에서 중요한 역할을 하는 식도 점막층 내에 호산구가 동시에 축적됩니다. . EoE는 유전적 근거가 제시되고 남성 비율이 3:1로 흔하지 않은 질병으로 자리잡고 있습니다. 발생률은 10,0009명당 0.1~1.2건으로 다양하며 매년 증가합니다. EoE 증상에는 식사 곤란, 성장 장애, 구토, 흉부 및/또는 복통, 연하곤란, 음식 매복이 포함되며 조직학적으로 혈관 손실이 있는 식도 선형 고랑, 점막 고리, 소구경 내강, 협착, 점막 삼출물과 관련이 있습니다. , 그리고 덜 일반적으로 폴립과 궤양이 발생합니다. 현재 채택된 치료법은 주로 양성자 펌프 억제, 글루코코르티코이드의 국소 투여, 식습관 변화를 기반으로 합니다. 그러나 대부분의 환자에서 호산구성 식도염은 만성질환으로 남아 있어, 치료를 중단하면 염증이 생기고 증상이 재발하게 된다. 이는 활력 및 전반적인 건강 점수를 포함한 삶의 질을 저하시킬 수 있으며 합병증이 발생할 수 있습니다. 따라서 EoE 발병 과정에서 발생하는 메커니즘을 완벽하게 이해하는 것은 치료적 개입 방식을 구현하고 개선하여 전체 환자의 건강을 개선하는 데 여전히 가장 중요합니다.

EoE는 위식도 역류 질환(GERD), 호산구성 위장 질환 및 이완불능증과 같은 다른 질병 징후와 중복되는 환자의 증상을 유발하기 때문에 간단하고 촉진된 EoE 임상 진단은 여전히 ​​부족합니다. 점막 면역 변화와 함께 상피 장벽 기능 손상은 증가된 투과성과 항원 감지 및 EoE TaMMA 측면에서 EoE의 특징으로 남아 있습니다.

실제로 점막 수준에서 EoE는 IL13 의존 메커니즘을 통해 조절되는 장벽 기능 및 접착 분자와 관련된 단백질의 하향 조절과 함께 확장된 상피 간 공간의 놀라운 패턴이 특징입니다. 결과적으로 변경된 상피 투과성은 항원 제시를 향상시키는 허용 환경으로 이어질 수 있으며 이는 결국 지속적인 만성 염증으로 이어집니다.

EoE 병인의 정의를 위한 일종의 표준으로 사용되는 일부 해부학적 및 분자적 특성에도 불구하고, 분자 연구의 메타 분석은 질병의 생리병리학에 대한 이해를 향상시키고 EoE의 간단한 진단에 도움이 되는 분자 마커를 정의할 수 있습니다. 아직 수행되지 않았습니다. 우리는 최근 염증성 장질환(IBD) 전사체 및 메타전사체 메타분석 웹 앱(IBD TaMMA, https://ibd-meta-analytic.herokuapp.com/)을 개발 및 출시했습니다. IBD 관련 연구. TaMMA는 커뮤니티가 사용자 친화적인 웹 애플리케이션을 통해 데이터에 쉽게 액세스하고 쿼리하고 '재생'할 수 있도록 하는 오픈 소스 프레임워크를 제공하고 정의할 수 있는 전례 없는 기회를 제공함으로써 오믹스 데이터 메타 분석 분야에 기여해 왔습니다. IBD의 발병기전을 더 잘 이해하기 위한 새로운 가설과 통찰력.

IBD TaMMA가 지난 몇 달 동안 점점 더 많이 보여주고 있는 유용성을 고려하여 우리는 EoE, GERD 및 통제 분석 연구를 포함하는 대화형 웹 앱인 EoE TaMMA에서 시각화된 EoE 관련 공개 데이터 세트에 대한 유사한 메타 분석을 개발했습니다( EoE 및 GERD 제외). EoE 관련 표현형은 웹앱 전체에서 확인되었습니다. 플랫폼을 더욱 통합하기 위해 우리는 EoE 및 GERD를 활용하여 EoE 및 GERD 환자의 독립적인 코호트에서 EoE TaMMA 결과의 검증을 제안하고 있습니다.