好酸球性食道炎のメタトラスクリプトームおよびトランスクリプトームのメタ解析の検証のための単中心的遡及的観察研究

好酸球性食道炎 (EoE) は慢性食道炎症性疾患であり、主に食物抗原によって活性化され、食道粘膜層内での好酸球の同時蓄積を伴い、Th2 応答特異的インターロイキン (IL) 5 と IL13 がその発症時に重要な役割を果たします。 。 EoE は、遺伝的根拠が示唆され、男性が 3 対 1 で優勢であるため、まれな疾患として位置づけられています。 発生率は10,0009人あたり0.1～1.2人の間で変動し、毎年増加しています。 EoEの症状には、摂食困難、発育不全、嘔吐、胸痛および/または腹痛、嚥下障害、および宿便が含まれ、組織学的には血管喪失を伴う食道の線状溝、粘膜輪、小口径内腔、狭窄、粘膜滲出液と関連している。 、頻度は低いですが、ポリープや潰瘍が発生します。 現在採用されている治療法は、主にプロトンポンプ阻害、グルココルチコイドの局所投与、食習慣の変更に基づいています。 しかし、ほとんどの患者において、好酸球性食道炎は依然として慢性疾患であり、治療を中止すると炎症が起こり、症状が再発します。 これにより、活力や一般的な健康スコアなどの生活の質が妨げられ、合併症が発生する可能性があります。 したがって、EoE の発症時に発生するメカニズムを完全に理解することは、一連の治療介入を実施および改善し、全体的な患者の健康状態を改善するために依然として最も重要です。

EoE は胃食道逆流症 (GERD)、好酸球性胃腸疾患、アカラシアなどの他の疾患症状と重複する症状を患者に引き起こすため、直接的で容易な EoE 臨床診断はまだ存在していません。 粘膜免疫の変化に加えて、上皮バリア機能障害は、透過性と抗原感知の増加および EoE TaMMA の両方の点で EoE の特徴として残っています。

実際、粘膜レベルでは、EoE は拡張した上皮間隙の顕著なパターンを特徴とし、バリア機能および接着分子に関連するタンパク質の下方制御が、IL13 依存性機構を介して調節されます。 結果として、上皮透過性の変化は、抗原提示を増強する許容的な環境をもたらし、それが持続的な慢性炎症を引き起こす可能性があります。

EoEの病因を定義するための一種のゴールドスタンダードとしていくつかの解剖学的および分子的特徴付けが採用されているにもかかわらず、分子研究のメタアナリシスはこの疾患の生理病理の理解を改善し、EoEの直接的な診断に役立つ分子マーカーを定義する可能性があるまだ実行されていません。 当社は最近、炎症性腸疾患 (IBD) トランスクリプトームおよびメタトランスクリプトーム メタアナリシス Web アプリ (IBD TaMMA、https://ibd-meta-analysis.herokuapp.com/) を開発し、リリースしました。これは、炎症性腸疾患 (IBD) のために生成されたすべての公開データ セットの完全な調査です。 IBD関連の研究。 TaMMA は、コミュニティがユーザーフレンドリーな Web アプリケーションを通じてデータに簡単にアクセス、クエリ、および「再生」できるようにするオープンソース フレームワークを提供し、定義を行う前例のない機会を提供することで、オミクス データ メタ分析の分野に貢献してきました。 IBDの病因をより深く理解するための新しい仮説と洞察。

ここ数か月にわたって IBD TaMMA がますます示している有用性を考慮して、私たちは、対話型 Web アプリである EoE TaMMA で視覚化された EoE 関連の公開データセットの同様のメタ分析を開発しました。これには、EoE、GERD、および制御を分析する研究が含まれます ( EoE と GERD なし)。 EoE 関連の表現型が Web アプリ全体で確認されました。 プラットフォームをさらに強化するために、EoE と GERD を利用して、EoE と GERD 患者の独立したコホートにおける EoE TaMMA の結果を検証することを提案しています。