嗜酸粒性食管炎 Metatrascryptome 和转录组荟萃分析验证的单中心回顾性观察研究

嗜酸性粒细胞性食管炎 (EoE) 是一种慢性食管炎症性疾病，主要由食物抗原激活，伴随食管粘膜层内嗜酸性粒细胞的积累，其中 Th2 反应特异性白细胞介素 (IL) 5 和 IL13 在其发病机制中发挥关键作用。 EoE 被认为是一种不常见的疾病，有遗传基础，男性发病率为 3:1。 其发病率在每 10,0009 人中 0.1 至 1.2 例之间变化，并且逐年增加。 EoE 症状包括进食困难、发育迟缓、呕吐、胸痛和/或腹痛、吞咽困难和食物嵌塞，组织学上与食管线状皱纹伴血管供应丧失、粘膜环、小口径管腔、狭窄、粘膜渗出有关，以及不太常见的息肉和溃疡。 目前采用的治疗方法主要是质子泵抑制、局部给予糖皮质激素以及改变饮食习惯等。 然而，在大多数患者中，嗜酸性粒细胞性食管炎仍然是一种慢性疾病，如果停止治疗，炎症就会随之发生，症状会复发。 这可能会影响生活质量，包括活力和总体健康评分，并且可能会出现并发症。 因此，完全理解 EoE 发病机制对于实施和改进干预治疗方案、改善患者的整体健康状况仍然至关重要。

仍然缺乏简单且方便的 EoE 临床诊断，因为 EoE 会在患者中引发与其他疾病表现重叠的症状，例如胃食管反流病 (GERD)、嗜酸粒细胞性胃肠道疾病和贲门失弛缓症。 除了粘膜免疫改变外，上皮屏障功能损伤仍然是 EoE 的一个标志，无论是通透性增加、抗原感应还是 EoE TaMMA 方面。

事实上，在粘膜水平上，EoE 的特点是上皮间空间扩张的显着模式，与屏障功能和粘附分子相关的蛋白质下调，进而通过 IL13 依赖性机制进行调节。 因此，上皮通透性的改变可导致增强抗原呈递的宽松环境，进而导致持续性慢性炎症。

尽管一些解剖学和分子特征被用作定义 EoE 发病机制的金标准，但分子研究的荟萃分析可以提高对该疾病病理生理学的理解，并定义有助于直接诊断 EoE 的分子标记尚未执行。 我们最近开发并发布了炎症性肠病 (IBD) 转录组和元转录组荟萃分析网络应用程序（IBD TaMMA，https://ibd-meta-analysis.herokuapp.com/），这是对为以下目的生成的所有公共数据集的完整调查： IBD 相关研究。 TaMMA 提供了一个开源框架，使社区能够通过用户友好的 Web 应用程序轻松访问、查询和“玩”数据，并提供前所未有的机会来定义数据，从而为组学数据元分析领域做出了贡献。新的假设和见解，以更好地了解 IBD 的发病机制。

考虑到 IBD TaMMA 在过去几个月中越来越显示出的实用性，我们开发了一个类似的对 EoE 相关公共数据集的元分析，该数据集在交互式网络应用程序 EoE TaMMA 中可视化，其中包括分析 EoE、GERD 和对照的研究（没有 EoE 和 GERD）。 EoE 相关表型在整个网络应用程序中得到确认。 为了进一步巩固该平台，我们建议利用 EoE 和 GERD 在独立的 EoE 和 GERD 患者队列中验证 EoE TaMMA 结果。