Estudo observacional retrospectivo monocêntrico para validação de meta-análise do metatrascriptoma e transcriptoma da esofagite eosinofilizada

A esofagite eosinofílica (EoE) é uma doença inflamatória esofágica crônica, ativada principalmente por antígenos alimentares, com o acúmulo concomitante de eosinófilos na camada mucosa esofágica, onde a interleucina (IL) 5 e IL13 específica da resposta Th2 desempenha um papel fundamental durante sua patogênese. . A EEo se posiciona como uma doença incomum, com base genética sugerida e preponderância masculina de 3:1. Sua taxa de incidência varia entre 0,1 e 1,2 casos por 10.0009 e aumenta anualmente. Os sintomas da EEo incluem dificuldade para comer, retardo de crescimento, vômitos, dor torácica e/ou abdominal, disfagia e impactação alimentar, histologicamente associados a sulcos lineares esofágicos com perda de vascularização, anéis mucosos, lúmen de pequeno calibre, estenoses, exsudatos mucosos e, menos comumente, pólipos e ulcerações. As terapias atualmente adotadas baseiam-se principalmente na inibição da bomba de prótons, administração tópica de glicocorticóides e mudanças nos hábitos alimentares. No entanto, na maioria dos pacientes, a esofagite eosinofílica continua a ser uma doença crónica e, se o tratamento for interrompido, ocorre inflamação e os sintomas recorrem. Isto pode prejudicar a qualidade de vida, incluindo os índices de vitalidade e de saúde geral, e podem surgir complicações. Portanto, a compreensão completa dos mecanismos que ocorrem durante a patogênese da EEo continua sendo de suma importância para implementar e melhorar as linhas terapêuticas de intervenção, melhorando o bem-estar geral dos pacientes.

Ainda falta um diagnóstico clínico simples e facilitado da EEo, uma vez que a EEo provoca nos pacientes sintomas que se sobrepõem a outras manifestações da doença, como doença do refluxo gastroesofágico (DRGE), doença gastrointestinal eosinofílica e acalasia. Juntamente com as alterações da imunidade da mucosa, o comprometimento da função da barreira epitelial continua sendo uma marca registrada da EoE, em termos de aumento da permeabilidade e detecção de antígeno e EoE TaMMA .

De facto, ao nível da mucosa, a EoE é caracterizada por um padrão marcante de espaços interepiteliais dilatados, com regulação negativa de proteínas associadas à função de barreira e moléculas de adesão, por sua vez, moduladas através de um mecanismo dependente de IL13. Como consequência, a permeabilidade epitelial alterada pode levar a um ambiente permissivo que melhora a apresentação do antígeno, o que por sua vez leva à inflamação crónica persistente.

Apesar de algumas caracterizações anatômicas e moleculares empregadas como uma espécie de padrão ouro para a definição da patogênese da EEo, uma meta-análise dos estudos moleculares pode melhorar a compreensão da fisiopatologia da doença e definir marcadores moleculares úteis para um diagnóstico direto da EEo ainda não foi realizado. Recentemente, desenvolvemos e lançamos o aplicativo da web Transcriptome e Metatranscriptome Meta-Analysis para Doença Inflamatória Intestinal (IBD) (IBD TaMMA, https://ibd-meta-análise.herokuapp.com/), uma pesquisa completa de todos os conjuntos de dados públicos gerados para Estudos relacionados à DII. TaMMA contribuiu para o campo da meta-análise de dados ômicos, fornecendo uma estrutura de código aberto que permitirá à comunidade acessar, consultar e 'brincar' facilmente com os dados por meio de um aplicativo da web amigável e oferecendo uma oportunidade sem precedentes para definir novas hipóteses e insights para melhor compreender a patogênese da DII.

Considerando a utilidade que o IBD TaMMA tem demonstrado cada vez mais nos últimos meses, desenvolvemos uma meta-análise semelhante de conjuntos de dados públicos relacionados à EoE visualizados em um aplicativo web interativo, o EoE TaMMA, que inclui estudos que analisam EoE, DRGE e controles ( sem EEo e DRGE). Os fenótipos relacionados à EoE foram confirmados em todo o aplicativo da web. Para consolidar ainda mais a plataforma, estamos propondo a validação dos resultados da EoE TaMMA em uma coorte independente de pacientes com EEo e DRGE, aproveitando as vantagens da EoE e da DRGE.