염색체 마이크로어레이 및 엑솜 시퀀싱과 비교하여 선천성 기형의 산전 진단을 위한 신속한 1차 게놈 시퀀싱 평가 (PRENATOMEultra)

산전 초음파를 통한 선천성 기형(임신의 3%) 관리는 진정한 의학적 과제를 나타냅니다. 이들의 예후는 근본적인 병인에 따라 다양합니다. 프랑스에서 산전 진단(PND)은 오랫동안 영상 또는 감염성, 대사성, 면역학적 또는 유전학적 조사(핵형, 염색체 마이크로어레이(CMA) 및 일부 경우 표적 유전자의 서열 분석)를 기반으로 해왔습니다. 이러한 조사 후에도 태아의 약 70%는 병인 진단 없이 남아 있습니다. 엑솜(ES)과 게놈 시퀀싱(GS)은 임상적 방향이 없거나 음성 표준 정밀 검사 후에 발달 장애에 대한 출생 후 진단율이 40% 이상으로 의료 유전학에 혁명을 일으켰습니다. PND에서 trio-ES는 예후를 개선하고 부부가 현재 임신뿐만 아니라 후속 가족 계획/상담에 관한 결정을 내릴 수 있도록 돕기 위한 진단 접근 방식으로 여러 국가에서 점진적으로 도입되었습니다. 하지만 결과가 나오는 데 평균 3~4주가 걸리는 지연 시간이 부부에게는 길다. 또한 ES는 GS가 접근할 수 있는 구조적 변이와 같은 일부 변이를 감지할 수 없으며, 이로 인해 5~10%의 사례에서 추가 진단이 필요할 수 있습니다.

2013년부터 FHU TRANSLAD는 다양한 파일럿 프로젝트를 전개하여 발달 기형이 있는 희귀 질환 환자의 진단에 ES를 이전해 왔습니다. PND에서 우리 팀은 선천성 질환의 맥락에서 ES를 분석하고 4주 이내에 결과를 제공하는 타당성을 평가하기 위해 AnDDI-Rares 건강 네트워크의 지원을 받는 국가 연구 프로젝트인 AnDDI-Prenatome을 프랑스에서 처음으로 제안했습니다. 기형(PMID:37035737). 우리는 ES를 1차 테스트로 사용한 경우 전체 진단 수율이 41%(37/89), 일반 CMA 후에 사용한 경우 31%(19/61)로 산전 ES 구현의 타당성을 입증할 수 있었습니다. 이러한 경험을 통해 프랑스 병원에 제안을 통해 일상적인 진단에 ES를 구현할 수 있게 되었습니다. 우리 팀은 이제 태아 초음파 징후가 발견될 때 PND의 태아 ES에 대한 비침습적 접근 방식과 침습적 접근 방식을 비교하는 DPNI-Exome 시험(지역 간 PHRC, NCT05182242)을 조정합니다.

우리 팀은 이제 초음파 징후의 경우 빠른 trio-GS의 진단 수율과 7일 이내에 결과 전달 비율을 평가하여 결과 지연을 줄이고 PND 비율도 높일 수 있기를 원합니다. 또한, Rapid trio-GS의 효율성과 그 구현과 관련된 기술적 장애물에 관한 정보를 통해 국가 지침 개발이 가능해질 것입니다.

이는 현재 6개의 출판물만이 빠른 산전 GS의 사용을 제안한 반면 약 70개의 연구에서 산전 ES의 경험을 보고하기 때문에 국제 과학 관점에서 가장 중요한 문제입니다. 이 6개 출판물 중 5개는 중국에서 나온 것이었고 때로는 회고적이며 방법, 포함 기준, 지연 또는 직면한 어려움에 관한 정보가 없거나 제한적이며 포함된 환자 수가 적은 경우가 많습니다. 이러한 출판물에서는 효율성을 공제할 수 없습니다. 제안된 연구는 신속한 트리오-GS가 프랑스의 일상적인 PND에서 구현될 수 있는지에 대한 답변을 제공해야 합니다.

연구팀은 새로운 생식 기술이 부부에게 미치는 영향을 평가하는 데 전념하고 있습니다. DPNI-Exome 연구에서 이미 종단적 질적 연구를 수행했는데, 이는 커플이 서로 다른 기간에 전달되는 서로 다른 결과를 기다릴 때 직면하는 어려움을 보여줍니다. GS는 부모의 질문에 답할 수 있는 단 하나의 고유한 테스트만 제공할 수 있습니다. 팀은 결과가 매우 빨리 전달될 수 있도록 최선을 다하지만, 결과를 기다리는 것은 부부가 초음파 징후의 발견과 임신 예후에 미칠 수 있는 영향을 깨닫기에 충분한 시간을 제공한다고 심리학자들은 언급했습니다. 따라서 표준 진료보다 빠른 단일 테스트를 통해 부부의 인식과 만족도를 평가하고, 결과를 얻는 데 필요한 시간이 의사 결정에 충분한지 평가하는 것이 중요합니다. 이는 반지향적 인터뷰를 통해 평가할 수 있습니다.