快速一线基因组测序与染色体微阵列和外显子组测序相比对先天性畸形产前诊断的评价 (PRENATOMEultra)

通过产前超声治疗先天畸形（占妊娠的 3%）是一项真正的医学挑战。 它们的预后因潜在病因而异。 在法国，产前诊断 (PND) 长期以来一直基于影像学或感染性、代谢性、免疫学或遗传研究（核型、染色体微阵列 (CMA) 和某些情况下的目标基因测序）。 经过这些调查后，大约 70% 的胎儿仍未得到病因诊断。 外显子组 (ES) 和基因组测序 (GS) 彻底改变了医学遗传学，在缺乏临床指导和/或阴性标准检查后，发育障碍的产后诊断率超过 40%。 在 PND 中，trio-ES 已在多个国家逐步引入诊断方法，以改善预后并帮助夫妇就当前怀孕做出决定，同时也用于随后的计划生育/咨询。 然而，结果返回的延迟时间平均为 3 至 4 周，这对于夫妇来说是很长的。 此外，ES 无法检测到 GS 可以检测到的某些变异，例如结构变异，而这可能会导致 5% 至 10% 的病例进行额外诊断。

自 2013 年以来，FHU TRANSLAD 一直通过部署不同的试点项目，将 ES 应用于患有发育异常的罕见疾病患者的诊断中。 在 PND 中，我们的团队是法国第一个提出国家研究项目 AnDDI-Prenatome，该项目由 AnDDI-Rares 健康网络支持，旨在评估先天性先天性心脏病分析 ES 并在不到 4 周内提供结果的可行性。畸形（PMID：37035737）。 我们能够证明产前 ES 实施的可行性，当 ES 用作一线测试时，总体诊断率为 41% (37/89)，而在正常 CMA 后使用时，总体诊断率为 31% (19/61)。 这一经验使得ES在常规诊断中得以实施，并为法国医院提供了服务。 我们的团队现在协调 DPNI-Exome 试验（区域间 PHRC；NCT05182242），比较发现胎儿超声​​征象时针对 PND 中胎儿 ES 的非侵入性和侵入性方法。

我们的团队现在希望评估出现超声征象时快速 trio-GS 不到 7 天的诊断率和结果交付百分比，以减少结果延迟，但也可能增加 PND 的发生率。 此外，有关快速 trio-GS 效率的信息以及与其实施相关的技术障碍将有助于制定国家指南。

从国际科学的角度来看，这是一个最重要的问题，因为目前只有六篇出版物提出使用快速产前 GS，而大约七十项研究报告了产前 ES 的经验。 这六篇出版物中有五篇来自中国，有时是回顾性的，关于方法、纳入标准、延误或遇到的困难没有或有限的信息，而且纳入的患者数量往往很少。 效率不能从这些出版物中扣除。 拟议的研究应该回答快速 trio-GS 是否可以在法国的常规 PND 中实施。

该团队致力于评估新生殖技术对夫妇的影响。 它已经在 DPNI-Exome 研究中进行了纵向定性研究，该研究显示了夫妇在等待不同时间范围内的不同结果时面临的困难。 GS 可以只提供一种独特的测试来回答家长的问题。 团队尽最大努力确保很快得出结果，但心理学家提到，等待结果让这对夫妇有足够的时间来认识到超声波征兆的发现，以及可能对妊娠预后的影响。 因此，重要的是评估夫妇对单一测试的看法和满意度，该测试比标准护理中提供的测试更快，并评估获得结果所需的时间是否足以供他们做出决策。 这可以通过半指导性访谈来评估。