Оценка быстрого секвенирования генома первой линии для пренатальной диагностики врожденных пороков развития в сравнении с хромосомным микрочипом и секвенированием экзома (PRENATOMEultra)

Лечение врожденных пороков развития (3% беременностей) с помощью пренатального ультразвукового исследования представляет собой реальную медицинскую проблему. Их прогноз варьируется в зависимости от основной этиологии. Во Франции пренатальная диагностика (ПНД) уже давно основана на визуализации или инфекционных, метаболических, иммунологических или генетических исследованиях (кариотип, хромосомный микрочип (CMA) и в некоторых случаях секвенирование целевых генов). Около 70% плодов после этих исследований остаются без этиологического диагноза. Экзом (ES) и секвенирование генома (GS) произвели революцию в медицинской генетике: уровень постнатальной диагностики нарушений развития при отсутствии клинической ориентации и/или после отрицательного стандартного обследования составляет более 40%. При ПНД трио-ЭС постепенно внедряется в ряде стран в качестве диагностического подхода для уточнения прогноза и помощи парам в принятии решений относительно текущей беременности, а также для последующего планирования семьи/консультирования. Однако задержка с получением результатов, составляющая в среднем 3–4 недели, для пар является длительной. Кроме того, ЭС не может обнаружить некоторые варианты, например структурные варианты, доступные для ГС, что может привести к дополнительной диагностике в 5–10% случаев.

С 2013 года ФГУ «ТРАНСЛАД» осуществляет передачу ЭС в диагностике пациентов с редкими заболеваниями с аномалиями развития, реализуя различные пилотные проекты. В PND наша команда первой во Франции предложила национальный исследовательский проект AnDDI-Prenatome при поддержке сети здравоохранения AnDDI-Rares для оценки возможности анализа ES и получения результатов менее чем за 4 недели в контексте врожденных заболеваний. пороки развития (PMID:37035737). Нам удалось продемонстрировать возможность пренатального внедрения ЭС: общий диагностический показатель составил 41% (37/89), когда ЭС использовался в качестве теста первой линии, и 31% (19/61) при использовании после нормального CMA. Этот опыт позволил внедрить ЭС в рутинную диагностику, что стало предложением для французских больниц. В настоящее время наша команда координирует исследование DPNI-Exome (межрегиональный PHRC; NCT05182242), в котором сравниваются неинвазивные и инвазивные подходы к лечению ЭС плода при ПНД при обнаружении признаков УЗИ плода.

Наша команда теперь хочет оценить диагностическую эффективность и процент получения результатов менее чем за 7 дней быстрого трио-GS в случае ультразвуковых признаков, чтобы уменьшить задержку результатов, но также, возможно, увеличить частоту PND. Кроме того, информация об эффективности быстрого трио-GS, а также о технических препятствиях, связанных с его внедрением, позволит разработать национальные рекомендации.

Это вопрос первостепенной важности с международной научной точки зрения, поскольку в настоящее время только шесть публикаций предлагают использовать быструю пренатальную GS, а около семидесяти исследований сообщают об опыте пренатальной ES. Пять из этих шести публикаций были из Китая, иногда ретроспективные, без какой-либо или ограниченной информации о методах, критериях включения, задержках или возникших трудностях, а также часто о небольшом количестве включенных пациентов. Эффективность не может быть вычтена из этих публикаций. Предлагаемое исследование должно ответить на вопрос, можно ли внедрить быстрый трио-GS в рутинную программу PND во Франции.

Команда стремится оценить влияние новых репродуктивных технологий на пары. Он уже провел продольные качественные исследования в рамках исследования DPNI-Exome, которые показали, с какими трудностями сталкиваются пары, ожидая разных результатов, полученных в разные сроки. GS позволяет предложить только один уникальный тест, который сможет ответить на вопросы родителей. Команда делает все возможное, чтобы результаты были получены очень быстро, но психологи отметили, что ожидание результатов дает паре достаточно времени, чтобы осознать обнаружение признаков УЗИ и возможное влияние на прогноз беременности. Поэтому важно оценить восприятие и удовлетворенность пар с помощью одного теста, который выполняется быстрее, чем то, что предлагается в стандартном уходе, и оценить, достаточно ли времени, необходимого для получения результатов, для принятия ими решения. Это можно оценить с помощью полудирективных интервью.