Characterization of Enterococci
Characterization of Enterococci; Distribution of Virulence Markers, Virulence Genes and Antibiotic Resistance Pattern of the Isolated Species
Studie Overzicht
Toestand
Toestand
Conditie
Conditie
Studietype
Studietype
Inschrijving (Werkelijk)
Inschrijving
Contacten en locaties
Studie Locaties
-
-
-
Sohag, Egypte
- Sohag faculty of medicine
-
-
Deelname Criteria
Geschiktheidscriteria
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
Accepteert gezonde vrijwilligers
Geslachten die in aanmerking komen voor studie
Bemonsteringsmethode
Studie Bevolking
Beschrijving
Inclusion Criteria:
- any patients in ICU has manifestations of urinary tract infections, surgical wound infections, intra-abdominal infections, intrapelvic infections, bacteraemia and infective endocarditis
Exclusion Criteria:
- patients receiving antibiotics in previous 48 hours
Studie plan
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
I) Sample collection
Tijdsspanne: 2 months
|
Samples are collected from intensive care unit (ICU) including urine, pus swabs, sputum, blood, tracheal aspirates and pharyngeal swabs
|
2 months
|
|
II) Identification of Enterococci:
Tijdsspanne: 2 month
|
by inoculation on Bile esculin azide & growing colonies further identified by :
|
2 month
|
|
III) Phenotypic detection of virulence marker of Enterococci(Gelatinase activity)
Tijdsspanne: 2 weeks
|
by culture on nutrient agar containing gelatin.Positive results appeared as liquefaction of gelatin
|
2 weeks
|
|
IV)Phenotypic detection of virulence marker of Enterococci (hemolytic activity)
Tijdsspanne: 1 week
|
by Detection of hemolytic activity on the blood agar
|
1 week
|
|
V) Phenotypic detection of virulence marker of Enterococci(Caseinase production)
Tijdsspanne: 2 weeks
|
by Detection of Caseinase production on Muller hinton agar containing skimmed milk 3%.
|
2 weeks
|
|
VI) Phenotypic detection of virulence marker of Enterococci(Formation of Slime layer)
Tijdsspanne: 1 week
|
Formation of Slime layer by culture on Brain heart infusion agar containing 5% sucrose, plates are incubated for 24 hrs at 37oC.
Positive strains gave mucoid and slimy colonies.
|
1 week
|
|
VII) Phenotypic detection of virulence marker of EnterococcI (Biofilm formation)
Tijdsspanne: 2 weeks
|
using microtiter plate reader.
Biofilm formation is scored as nonbiofilm forming (-), weak - (+), moderate - (++), and strong - (+++) corresponding to the A630 values ≤1, 1-≤2, 2-≤3, and>3, respectively
|
2 weeks
|
|
VIII) Antibiotic sensitivity test:
Tijdsspanne: 3 monthe
|
MICs (minimal inhibitory concentrations) of Vancomycin are measured by E-test for confirmation of vancomycin resistance among the isolated Enterococci. Results are interpreted according to CLSI guidelines. |
3 monthe
|
|
IX) Molecular Identification of commonest Enterococcus species
Tijdsspanne: 1 month
|
by conventional gene specific uniplex PCR for E. faecalis and E. Faecium
|
1 month
|
|
X) Molecular detection of virulence genes
Tijdsspanne: 2 months
|
Identification of virulence genes; gel E (gene for gelatinase), asa1 (gene for aggregation substance), cylA (gene for cytolysin activator), esp (gene for Enterococcal surface protein) Hyl (gene for Hyaluronidase) of E. faecalis and E. faecium was performed by uniplex PCR.The amplified products are visualized on 2% agarose gel stained with ethidium bromide.
The stained gels are visualized and documented with a gel documentation system and analyzed visually to determine the size of PCR amplicons of the target genes directly by comparison with 100 bp DNA ladder marker.
|
2 months
|
Medewerkers en onderzoekers
Sponsor
Sponsor
Onderzoekers
Onderzoekers
- Hoofdonderzoeker: Ekram Ab Rahmand Mahmoud, lecturer, Sohag faculty of medicine
Studie record data
Bestudeer belangrijke data
Studie start (Werkelijk)
Studie start
Primaire voltooiing (Werkelijk)
Primaire voltooiing
Studie voltooiing (Werkelijk)
Studie voltooiing
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
Eerst ingediend
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
Eerst geplaatst (Werkelijk)
Eerst geplaatst
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (Werkelijk)
Laatste update geplaatst
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
Laatst geverifieerd
Laatst geverifieerd
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Andere studie-ID-nummers
Andere studie-ID-nummers
- Soh-Med-21-02-19
Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)
Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?
Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .