Characterization of Enterococci
Characterization of Enterococci; Distribution of Virulence Markers, Virulence Genes and Antibiotic Resistance Pattern of the Isolated Species
Studienübersicht
Status
Status
Bedingungen
Bedingungen
Studientyp
Studientyp
Einschreibung (Tatsächlich)
Einschreibung
Kontakte und Standorte
Studienorte
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Sohag, Ägypten
- Sohag faculty of medicine
-
-
Teilnahmekriterien
Zulassungskriterien
Zulassungskriterien
Studienberechtigtes Alter
Akzeptiert gesunde Freiwillige
Studienberechtigte Geschlechter
Probenahmeverfahren
Studienpopulation
Beschreibung
Inclusion Criteria:
- any patients in ICU has manifestations of urinary tract infections, surgical wound infections, intra-abdominal infections, intrapelvic infections, bacteraemia and infective endocarditis
Exclusion Criteria:
- patients receiving antibiotics in previous 48 hours
Studienplan
Wie ist die Studie aufgebaut?
Designdetails
Was misst die Studie?
Primäre Ergebnismessungen
Primäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
|---|---|---|
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I) Sample collection
Zeitfenster: 2 months
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Samples are collected from intensive care unit (ICU) including urine, pus swabs, sputum, blood, tracheal aspirates and pharyngeal swabs
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2 months
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II) Identification of Enterococci:
Zeitfenster: 2 month
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by inoculation on Bile esculin azide & growing colonies further identified by :
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2 month
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III) Phenotypic detection of virulence marker of Enterococci(Gelatinase activity)
Zeitfenster: 2 weeks
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by culture on nutrient agar containing gelatin.Positive results appeared as liquefaction of gelatin
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2 weeks
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IV)Phenotypic detection of virulence marker of Enterococci (hemolytic activity)
Zeitfenster: 1 week
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by Detection of hemolytic activity on the blood agar
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1 week
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V) Phenotypic detection of virulence marker of Enterococci(Caseinase production)
Zeitfenster: 2 weeks
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by Detection of Caseinase production on Muller hinton agar containing skimmed milk 3%.
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2 weeks
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VI) Phenotypic detection of virulence marker of Enterococci(Formation of Slime layer)
Zeitfenster: 1 week
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Formation of Slime layer by culture on Brain heart infusion agar containing 5% sucrose, plates are incubated for 24 hrs at 37oC.
Positive strains gave mucoid and slimy colonies.
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1 week
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VII) Phenotypic detection of virulence marker of EnterococcI (Biofilm formation)
Zeitfenster: 2 weeks
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using microtiter plate reader.
Biofilm formation is scored as nonbiofilm forming (-), weak - (+), moderate - (++), and strong - (+++) corresponding to the A630 values ≤1, 1-≤2, 2-≤3, and>3, respectively
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2 weeks
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VIII) Antibiotic sensitivity test:
Zeitfenster: 3 monthe
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MICs (minimal inhibitory concentrations) of Vancomycin are measured by E-test for confirmation of vancomycin resistance among the isolated Enterococci. Results are interpreted according to CLSI guidelines. |
3 monthe
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IX) Molecular Identification of commonest Enterococcus species
Zeitfenster: 1 month
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by conventional gene specific uniplex PCR for E. faecalis and E. Faecium
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1 month
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X) Molecular detection of virulence genes
Zeitfenster: 2 months
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Identification of virulence genes; gel E (gene for gelatinase), asa1 (gene for aggregation substance), cylA (gene for cytolysin activator), esp (gene for Enterococcal surface protein) Hyl (gene for Hyaluronidase) of E. faecalis and E. faecium was performed by uniplex PCR.The amplified products are visualized on 2% agarose gel stained with ethidium bromide.
The stained gels are visualized and documented with a gel documentation system and analyzed visually to determine the size of PCR amplicons of the target genes directly by comparison with 100 bp DNA ladder marker.
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2 months
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Mitarbeiter und Ermittler
Sponsor
Sponsor
Ermittler
Ermittler
- Hauptermittler: Ekram Ab Rahmand Mahmoud, lecturer, Sohag faculty of medicine
Studienaufzeichnungsdaten
Haupttermine studieren
Studienbeginn (Tatsächlich)
Studienbeginn
Primärer Abschluss (Tatsächlich)
Primärer Abschluss
Studienabschluss (Tatsächlich)
Studienabschluss
Studienanmeldedaten
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst gepostet (Tatsächlich)
Zuerst gepostet
Studienaufzeichnungsaktualisierungen
Letztes Update gepostet (Tatsächlich)
Letztes Update gepostet
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Zuletzt verifiziert
Zuletzt verifiziert
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Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie
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- Soh-Med-21-02-19
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Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt
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