Characterization of Enterococci
Characterization of Enterococci; Distribution of Virulence Markers, Virulence Genes and Antibiotic Resistance Pattern of the Isolated Species
Descripción general del estudio
Estado
Estado
Condiciones
Condiciones
Tipo de estudio
Tipo de estudio
Inscripción (Actual)
Inscripción
Contactos y Ubicaciones
Ubicaciones de estudio
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Sohag, Egipto
- Sohag faculty of medicine
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Criterios de participación
Criterio de elegibilidad
Criterio de elegibilidad
Edades elegibles para estudiar
Acepta Voluntarios Saludables
Géneros elegibles para el estudio
Método de muestreo
Población de estudio
Descripción
Inclusion Criteria:
- any patients in ICU has manifestations of urinary tract infections, surgical wound infections, intra-abdominal infections, intrapelvic infections, bacteraemia and infective endocarditis
Exclusion Criteria:
- patients receiving antibiotics in previous 48 hours
Plan de estudios
¿Cómo está diseñado el estudio?
Detalles de diseño
¿Qué mide el estudio?
Medidas de resultado primarias
Medidas de resultado primarias
Medida de resultado |
Medida Descripción |
Periodo de tiempo |
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I) Sample collection
Periodo de tiempo: 2 months
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Samples are collected from intensive care unit (ICU) including urine, pus swabs, sputum, blood, tracheal aspirates and pharyngeal swabs
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2 months
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II) Identification of Enterococci:
Periodo de tiempo: 2 month
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by inoculation on Bile esculin azide & growing colonies further identified by :
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2 month
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III) Phenotypic detection of virulence marker of Enterococci(Gelatinase activity)
Periodo de tiempo: 2 weeks
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by culture on nutrient agar containing gelatin.Positive results appeared as liquefaction of gelatin
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2 weeks
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IV)Phenotypic detection of virulence marker of Enterococci (hemolytic activity)
Periodo de tiempo: 1 week
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by Detection of hemolytic activity on the blood agar
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1 week
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V) Phenotypic detection of virulence marker of Enterococci(Caseinase production)
Periodo de tiempo: 2 weeks
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by Detection of Caseinase production on Muller hinton agar containing skimmed milk 3%.
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2 weeks
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VI) Phenotypic detection of virulence marker of Enterococci(Formation of Slime layer)
Periodo de tiempo: 1 week
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Formation of Slime layer by culture on Brain heart infusion agar containing 5% sucrose, plates are incubated for 24 hrs at 37oC.
Positive strains gave mucoid and slimy colonies.
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1 week
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VII) Phenotypic detection of virulence marker of EnterococcI (Biofilm formation)
Periodo de tiempo: 2 weeks
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using microtiter plate reader.
Biofilm formation is scored as nonbiofilm forming (-), weak - (+), moderate - (++), and strong - (+++) corresponding to the A630 values ≤1, 1-≤2, 2-≤3, and>3, respectively
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2 weeks
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VIII) Antibiotic sensitivity test:
Periodo de tiempo: 3 monthe
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MICs (minimal inhibitory concentrations) of Vancomycin are measured by E-test for confirmation of vancomycin resistance among the isolated Enterococci. Results are interpreted according to CLSI guidelines. |
3 monthe
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IX) Molecular Identification of commonest Enterococcus species
Periodo de tiempo: 1 month
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by conventional gene specific uniplex PCR for E. faecalis and E. Faecium
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1 month
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X) Molecular detection of virulence genes
Periodo de tiempo: 2 months
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Identification of virulence genes; gel E (gene for gelatinase), asa1 (gene for aggregation substance), cylA (gene for cytolysin activator), esp (gene for Enterococcal surface protein) Hyl (gene for Hyaluronidase) of E. faecalis and E. faecium was performed by uniplex PCR.The amplified products are visualized on 2% agarose gel stained with ethidium bromide.
The stained gels are visualized and documented with a gel documentation system and analyzed visually to determine the size of PCR amplicons of the target genes directly by comparison with 100 bp DNA ladder marker.
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2 months
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Colaboradores e Investigadores
Patrocinador
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Investigadores
Investigadores
- Investigador principal: Ekram Ab Rahmand Mahmoud, lecturer, Sohag faculty of medicine
Fechas de registro del estudio
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Inicio del estudio (Actual)
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Finalización primaria (Actual)
Finalización primaria
Finalización del estudio (Actual)
Finalización del estudio
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- Soh-Med-21-02-19
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Estudia un producto farmacéutico regulado por la FDA de EE. UU.
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