Characterization of Enterococci
Characterization of Enterococci; Distribution of Virulence Markers, Virulence Genes and Antibiotic Resistance Pattern of the Isolated Species
Panoramica dello studio
Stato
Stato
Condizioni
Condizioni
Tipo di studio
Tipo di studio
Iscrizione (Effettivo)
Iscrizione
Contatti e Sedi
Luoghi di studio
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Sohag, Egitto
- Sohag faculty of medicine
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Criteri di partecipazione
Criteri di ammissibilità
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
Accetta volontari sani
Sessi ammissibili allo studio
Metodo di campionamento
Popolazione di studio
Descrizione
Inclusion Criteria:
- any patients in ICU has manifestations of urinary tract infections, surgical wound infections, intra-abdominal infections, intrapelvic infections, bacteraemia and infective endocarditis
Exclusion Criteria:
- patients receiving antibiotics in previous 48 hours
Piano di studio
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
|---|---|---|
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I) Sample collection
Lasso di tempo: 2 months
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Samples are collected from intensive care unit (ICU) including urine, pus swabs, sputum, blood, tracheal aspirates and pharyngeal swabs
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2 months
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II) Identification of Enterococci:
Lasso di tempo: 2 month
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by inoculation on Bile esculin azide & growing colonies further identified by :
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2 month
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III) Phenotypic detection of virulence marker of Enterococci(Gelatinase activity)
Lasso di tempo: 2 weeks
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by culture on nutrient agar containing gelatin.Positive results appeared as liquefaction of gelatin
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2 weeks
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IV)Phenotypic detection of virulence marker of Enterococci (hemolytic activity)
Lasso di tempo: 1 week
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by Detection of hemolytic activity on the blood agar
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1 week
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V) Phenotypic detection of virulence marker of Enterococci(Caseinase production)
Lasso di tempo: 2 weeks
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by Detection of Caseinase production on Muller hinton agar containing skimmed milk 3%.
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2 weeks
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VI) Phenotypic detection of virulence marker of Enterococci(Formation of Slime layer)
Lasso di tempo: 1 week
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Formation of Slime layer by culture on Brain heart infusion agar containing 5% sucrose, plates are incubated for 24 hrs at 37oC.
Positive strains gave mucoid and slimy colonies.
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1 week
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VII) Phenotypic detection of virulence marker of EnterococcI (Biofilm formation)
Lasso di tempo: 2 weeks
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using microtiter plate reader.
Biofilm formation is scored as nonbiofilm forming (-), weak - (+), moderate - (++), and strong - (+++) corresponding to the A630 values ≤1, 1-≤2, 2-≤3, and>3, respectively
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2 weeks
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VIII) Antibiotic sensitivity test:
Lasso di tempo: 3 monthe
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MICs (minimal inhibitory concentrations) of Vancomycin are measured by E-test for confirmation of vancomycin resistance among the isolated Enterococci. Results are interpreted according to CLSI guidelines. |
3 monthe
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IX) Molecular Identification of commonest Enterococcus species
Lasso di tempo: 1 month
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by conventional gene specific uniplex PCR for E. faecalis and E. Faecium
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1 month
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X) Molecular detection of virulence genes
Lasso di tempo: 2 months
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Identification of virulence genes; gel E (gene for gelatinase), asa1 (gene for aggregation substance), cylA (gene for cytolysin activator), esp (gene for Enterococcal surface protein) Hyl (gene for Hyaluronidase) of E. faecalis and E. faecium was performed by uniplex PCR.The amplified products are visualized on 2% agarose gel stained with ethidium bromide.
The stained gels are visualized and documented with a gel documentation system and analyzed visually to determine the size of PCR amplicons of the target genes directly by comparison with 100 bp DNA ladder marker.
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2 months
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Collaboratori e investigatori
Sponsor
Sponsor
Investigatori
Investigatori
- Investigatore principale: Ekram Ab Rahmand Mahmoud, lecturer, Sohag faculty of medicine
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Inizio studio
Completamento primario (Effettivo)
Completamento primario
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Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
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Primo Inserito (Effettivo)
Primo Inserito
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Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)
Ultimo aggiornamento pubblicato
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Ultimo verificato
Ultimo verificato
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Termini relativi a questo studio
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- Soh-Med-21-02-19
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