Identificatie van genomische biomarkers voor reumatoïde artritis met late aanvang (BIOGENOPRAT)

Het doel van dit protocol is het identificeren van een genomische handtekening die specifiek is voor RA met een laat begin en om bij te dragen aan de karakterisering van speciale therapeutische doelen. De verzameling van patiënten zal worden gehouden bij de reumatologiedienst van CHSF (Corbeil-Essonnes, Frankrijk) en speekselmonsters zullen worden verzameld voor verdere genomische analyses uitgevoerd door GenHotel lab (Univ Evry - Univ Paris-Saclay, Evry, Frankrijk).

Ten eerste zal analyse van volledige genoom-/DNA-sequenties het mogelijk maken om specifieke varianten van RA met late aanvang te identificeren. Dergelijke geïdentificeerde biomarkers zouden een differentiële diagnose kunnen helpen en bijdragen aan een snellere start van de zorg voor RA-familieleden die het risico lopen RA te ontwikkelen. Ten tweede zal analyse van RNA-sequenties, inclusief coderende eiwitgenen en niet-coderend RNA, informatie geven over genexpressie en regulatie, en moleculaire routes. Vergelijking van patiëntengroepen zal discriminatie mogelijk maken van biomarkers en moleculaire kenmerken die specifiek zijn voor de ziekte en voor de beginfenotypes. Integratie van dergelijke genomische gegevens in de RA-ziektekaart (bestaande uit een netwerk van biologische routes), en verdere modelleringsbenaderingen, zullen laat optredende RA-kenmerken benadrukken waarop onderzoek naar een therapeutisch doel zou kunnen worden gericht.

Om de genomische analyse te voltooien, zullen in een tweede fase methyloom- en proteoomgegevens worden geproduceerd. Dergelijke gegevens zullen helpen bij het identificeren van het regulatieproces dat leidt tot een eiwitprofiel dat specifiek is voor RA met late aanvang.

Er is een aanvullend onderzoek gepland op basis van familiemonsters die zijn geïdentificeerd na analyse van gegevens die zijn verzameld van RA-patiënten. Identificatie van risico-genetische markers wordt vergemakkelijkt in een familiale context van analyses. Bovendien bieden niet-RA-individuen in een familiale steekproef een controlemonster waardoor een beter onderscheid kan worden gemaakt tussen familie-afhankelijke en fenotype-afhankelijke genomische markers