Identyfikacja genomowych biomarkerów reumatoidalnego zapalenia stawów o późnym początku (BIOGENOPRAT)

Celem tego protokołu jest zidentyfikowanie sygnatury genomowej specyficznej dla RZS o późnym początku i przyczynienie się do charakterystyki dedykowanych celów terapeutycznych. Zbiórka pacjentów odbędzie się na oddziale reumatologii CHSF (Corbeil-Essonnes, Francja), a próbki śliny zostaną pobrane do dalszych analiz genomicznych prowadzonych przez laboratorium GenHotel (Univ Evry - Univ Paris-Saclay, Evry, Francja).

Po pierwsze, analiza całych sekwencji genomu/DNA pozwoli zidentyfikować konkretne warianty RZS o późnym początku. Tak zidentyfikowane biomarkery pomogłyby w diagnostyce różnicowej i przyczyniłyby się do wcześniejszego rozpoczęcia opieki nad krewnymi RZS zagrożonymi rozwojem RZS. Po drugie, analiza sekwencji RNA, w tym genów kodujących białka i niekodującego RNA, dostarczy informacji na temat ekspresji i regulacji genów oraz szlaków molekularnych. Porównanie grup pacjentów pozwoli na rozróżnienie biomarkerów i sygnatur molekularnych specyficznych dla choroby i jej początkowych fenotypów. Integracja takich danych genomowych z mapą choroby RA (składającą się z sieci szlaków biologicznych) i dalsze podejścia do modelowania pozwolą uwypuklić specyfikę RZS o późnym początku, na której można skoncentrować badania nad celem terapeutycznym.

Aby zakończyć analizę genomową, w drugiej fazie zostaną wygenerowane dane dotyczące metylomu i proteomu. Takie dane pomogą w identyfikacji procesu regulacji prowadzącego do profilu białkowego specyficznego dla RZS o późnym początku.

Planowane jest dodatkowe badanie z próbek rodzinnych zidentyfikowanych po analizie danych zebranych od pacjentów z RZS. Identyfikacja genetycznych markerów ryzyka jest ułatwiona w rodzinnym kontekście analiz. Ponadto osoby bez RZS w próbce rodzinnej stanowią próbkę kontrolną umożliwiającą lepsze rozróżnienie między markerami genomowymi zależnymi od rodziny i zależnymi od fenotypu