Identificación de biomarcadores genómicos para artritis reumatoide de inicio tardío (BIOGENOPRAT)

El propósito de este protocolo es identificar una firma genómica específica de AR de inicio tardío y contribuir a la caracterización de objetivos terapéuticos dedicados. La recolección de pacientes se realizará en el servicio de reumatología de CHSF (Corbeil-Essonnes, Francia) y las muestras de saliva se recolectarán para análisis genómicos adicionales realizados por el laboratorio GenHotel (Univ Evry - Univ Paris-Saclay, Evry, Francia).

En primer lugar, el análisis de secuencias de ADN/genoma completo permitirá identificar variantes específicas de la AR de inicio tardío. Dichos biomarcadores identificados ayudarían al diagnóstico diferencial y contribuirían a un inicio más temprano de la atención de los familiares con AR en riesgo de desarrollar AR. En segundo lugar, el análisis de las secuencias de ARN, incluidos los genes de proteínas codificantes y el ARN no codificante, brindará información sobre la expresión y regulación de genes y las vías moleculares. La comparación de grupos de pacientes permitirá la discriminación de biomarcadores y firmas moleculares específicas de la enfermedad y sus fenotipos de aparición. La integración de dichos datos genómicos en el mapa de la enfermedad de la AR (que consiste en una red de vías biológicas) y otros enfoques de modelado resaltarán las particularidades de la AR de aparición tardía en las que podría centrarse la investigación del objetivo terapéutico.

Para completar el análisis genómico, se producirán datos de metiloma y proteoma en una segunda fase. Dichos datos ayudarán en la identificación del proceso de regulación que conduce a un perfil de proteína específico de la AR de inicio tardío.

Se planea un estudio auxiliar a partir de muestras familiares identificadas después del análisis de los datos recopilados de pacientes con AR. La identificación de marcadores genéticos de riesgo se facilita en un contexto familiar de análisis. Además, los individuos sin AR en la muestra familiar proporcionan una muestra de control que permite una mejor discriminación entre los marcadores genómicos dependientes de la familia y los dependientes del fenotipo.