Identificazione di biomarcatori genomici per l'artrite reumatoide con insorgenza tardiva (BIOGENOPRAT)

Lo scopo di questo protocollo è identificare una firma genomica specifica dell'AR ad esordio tardivo e contribuire alla caratterizzazione di bersagli terapeutici dedicati. La raccolta dei pazienti si terrà presso il servizio di reumatologia del CHSF (Corbeil-Essonnes, Francia) e verranno raccolti campioni salivari per ulteriori analisi genomiche condotte dal laboratorio GenHotel (Univ Evry - Univ Paris-Saclay, Evry, Francia).

In primo luogo, l'analisi dell'intero genoma/sequenze di DNA consentirà di identificare varianti specifiche dell'AR ad esordio tardivo. Tali biomarcatori identificati aiuterebbero la diagnosi differenziale e contribuirebbe all'inizio precoce delle cure per i parenti di RA a rischio di sviluppare RA. In secondo luogo, l'analisi delle sequenze di RNA, compresi i geni proteici codificanti e l'RNA non codificante, fornirà informazioni sull'espressione e regolazione genica e sui percorsi molecolari. Il confronto dei gruppi di pazienti consentirà la discriminazione dei biomarcatori e delle firme molecolari specifiche della malattia e dei suoi fenotipi di insorgenza. L'integrazione di tali dati genomici nella mappa della malattia dell'AR (costituita da una rete di percorsi biologici) e ulteriori approcci di modellazione evidenzieranno le particolarità dell'AR ad esordio tardivo su cui potrebbe essere focalizzata la ricerca dell'obiettivo terapeutico.

Per completare l'analisi genomica, i dati sul metiloma e sul proteoma saranno prodotti in una seconda fase. Tali dati aiuteranno nell'identificazione del processo di regolazione che porta a un profilo proteico specifico dell'AR ad esordio tardivo.

È previsto uno studio accessorio da campioni familiari identificati dopo l'analisi dei dati raccolti da pazienti affetti da AR. L'identificazione dei marcatori genetici di rischio è facilitata in un contesto familiare di analisi. Inoltre, gli individui non RA nel campione familiare forniscono un campione di controllo che consente una migliore discriminazione tra marcatori genomici dipendenti dalla famiglia e dipendenti dal fenotipo