Effekten av Tecfidera på tarmmikrobiota

Dette vil være et åpent prospektivt studiedesign med hensyn til MS immunmodulerende terapivalg. Studiegruppen vil bli definert som forsøkspersoner med en residiverende form for multippel sklerose som definert av McDonald-kriteriene som velger å starte dimetylfumarat (DMF) behandling. Blinding av hovedetterforskeren og studien som er gjenstand for mikrobiotaanalyseresultater vil opprettholdes til den planlagte slutten av studien. Forsøkspersoner som får minst én dose DMF og deretter avbryter behandlingen, vil bli invitert til å fullføre studien om alternativ immunmodulerende terapi eller ingen terapi. Data fra forsøkspersoner som har mottatt minst én dose DMF og som trekker seg tidlig fra studien vil bli inkludert i analysen som siste besøk videreført. Det er satt som mål å registrere 25 personer til denne studien.

Tarmmikrobiota vil bli karakterisert ved hjelp av en kommersiell tjeneste, Second Genome, ved bruk av bakteriell DNA-ekstraksjon fra avføringsprøver og 16S ribosomal RNA-genamplifikasjon, etterfulgt av sekvensering med høy gjennomstrømning. Taksonomisk profilering på Illumina MiSeq-systemet sykles for å generere sammenkoblede 250-bp-lesninger i Second Genomes protokoller. Disse lengre leselengdene gir høykvalitets full lengdeavlesninger av genet for å sikre den mest nøyaktige klassifiseringen som er tilgjengelig gjennom sekvenseringsteknologier. Neste generasjons sekvensering har dukket opp som et kraftig verktøy for å undersøke mikrobielle samfunn i store prøvesett.

Serielle avføringsprøver vil bli samlet inn fra hvert individ, og sendt til Second Genome for analyse. Den første avføringsprøven vil bli tatt før den første dosen av DMF, med påfølgende samlinger på definerte tidspunkter i løpet av studien. En mer intensiv analyse vil fokusere på de første 12 ukene av behandlingen, en tid hvor utvikling og oppløsning av gastrointestinale bivirkninger vanligvis finner sted under terapi. Alvorlighetsgrad av behandlingsoppstått flushing vil bli registrert i løpet av denne tiden ved hjelp av en 5-punkts Likert-skala-spylingsalvorlighetsundersøkelse. Gastrointestinale (G.I.)-symptomer vil bli vurdert ved å bruke spørreskjemaet Gastrointestinal Symptoms Rating Scale (GSRS), et validert, selvadministrert spørreskjema som inkluderer 15 spørsmål, som vurderer alvorlighetsgraden av G.I. symptomer ved bruk av en 7-punkts Likert-skala i fem domener: fordøyelsesbesvær, diaré, forstoppelse, magesmerter og refluks. Alvorlighetsgraden av symptomene rapportert i GSRS øker med økende poengsum. Andre variabler som potensielt kan endre den gastrointestinale mikrobiotaen og sekundært DMF-toleranse vil bli vurdert, inkludert identifisering av personer som er predisponert for funksjonelle tarmsykdommer ved bruk av Roma III funksjonell tarmundersøkelse, et validert klinisk verktøy for å identifisere risikopersoner, diettsammensetning , antibiotikaeksponering, steroidbehandlinger for nevrologiske tilbakefall, bruk av prebiotiske , probiotiske eller vitamin D-tilskudd og behandling med H2-blokker eller protonpumpehemmer (PPI), ettersom endringer i tarmens pH påvirker tarmfloraens sammensetning. Ytterligere data om humørendring over 24 uker med DMF-terapi, ved bruk av Hamilton Anxiety Measurement (HAM) Rating Scale og Patient Health Questionnaire-9 (PHQ-9) Depression Scale, vil bli samlet inn og korrelert til DMF-fremkommende G.I. forstyrrelser, og til endringer i bakterie- og arkearter i tarmfloraen.