En pilotstudie som vurderer intestinal mikrobiota-diversifisering og endringer etter reise til Sør(Øst) Asia fra USA (ABROAD)

Reisendes diaré er den vanligste sykdommen som oppleves av de som reiser til utlandet. Estimater varierer, men forekomsten er rapportert å variere mellom 30-60 %, avhengig av reisemål og sesong. Flere organismer har vært involvert som årsaker til reisendes diaré, men bakterier står for 80-90% av tilfellene. Det er økende bevis for at integriteten til tarmmikrobiomet kan være en sterk modulator av diarésykdom, og at tarminfeksjoner og andre faktorer, inkludert stress, antibiotikaeksponering og kosthold kan forstyrre mangfoldet og den generelle sammensetningen av mikrobiomet. Dysbiose, en tilstand av endret mikrobiota-diversitet, kan være mindre motstandsdyktig mot oppkjøp av tarmpatogener og kolonisering av flere medikamentresistente organismer. Videre kan forstyrrelser i mikrobiomet som kan skyldes en episode med reisendes diaré ha en rolle i utviklingen av kronisk diaré og post-infeksiøs irritabel tarm-syndrom.

Denne prospektive, observasjonspilotstudien er ment å innhente foreløpige data for å støtte begrunnelsen for en påfølgende større kohortstudie. Denne studien er utformet for å vurdere gjennomførbarhet, foredle målpopulasjonen og raskt teste kvalitative og kvantitative endringer i mikrobiomet etter korttidsreiser (sju til 21 dager) til Sør- eller Sørøst-Asia, regioner hvor hyppigheten av reisendes diaré og tarmkolonisering. med antimikrobielle resistente bakterier er høyest.

Målgruppen vil inkludere 10 Emory University-studenter og/eller Emory University Hospital TravelWell Clinic (TWC) pasienter som har internasjonale reiseplaner. Samtykke, villige og kvalifiserte deltakere vil fullføre en innledende kvalifikasjonsscreening, etterfulgt av studiebesøk før reisen, kortsiktig post-reise og langsiktig post-reise studiebesøk. For å bestemme spesifikke faktorer assosiert med mangfoldsendring av tarmmikrobiota og endringer i tilstedeværelsen av gener som koder for antibiotikaresistens, spørreskjemaer designet for å samle inn data om demografi, medisinsk historie, kosthold, matinntak, nylig (innen 12 uker før reisen) vurdering, under reise eller etter reisen) sykdomshistorie, medisinbruk, reiserute, reiseaktiviteter og relevant mat- og vannrisikoatferd vil bli fullført ved hvert studiebesøk. En avføringsprøve vil også bli gitt på hvert tidspunkt. Deltakerne kan også velge å delta i en valgfri delstudie som involverer bankrester for fremtidig forskningsbruk.

Det primære protokollmålet er å pilotere en studie som undersøker sammenhengen mellom reise og endringer i tarmmikrobiomet (inkludert både bakterie- og soppkomponenter) og bakterie- og soppresistomet.

Det sekundære protokollmålet er å vurdere endringer i mikrobiotaprofilen og tilbakevending til eller mot tilstanden før reisen ved å sammenligne resultater for sekvensering av avføringsprøver før reisen med kortsiktige resultater for sekvensering av avføringsprøver etter reise og langsiktige post-reiser.