En pilotundersøgelse, der vurderer diversificering af tarmmikrobiota og ændringer efter rejse til Syd(øst)asien fra USA (ABROAD)

Rejsendes diarré er den mest almindelige sygdom, som personer, der rejser til udlandet, oplever. Estimater varierer, men forekomsten er blevet rapporteret at variere mellem 30-60%, afhængigt af rejsemål og sæson. Flere organismer er blevet impliceret som årsager til rejsendes diarré, men bakterier står for 80-90% af tilfældene. Der er stigende evidens for, at integriteten af ​​det intestinale mikrobiom kan være en stærk modulator af diarrésygdom, og at tarminfektioner og andre faktorer, herunder stress, antibiotikaeksponering og kost, kan forstyrre mangfoldigheden og den overordnede sammensætning af mikrobiomet. Dysbiose, en tilstand af ændret mikrobiotadiversitet, kan være mindre modstandsdygtig over for erhvervelse af tarmpatogener og kolonisering af flere lægemiddelresistente organismer. Desuden kan forstyrrelser i mikrobiomet, der kan være et resultat af en episode med rejsendes diarré, have en rolle i udviklingen af ​​kronisk diarré og post-infektiøs irritabel tyktarm.

Denne prospektive, observationelle pilotundersøgelse er beregnet til at indhente foreløbige data til at understøtte begrundelsen for en efterfølgende større kohorteundersøgelse. Denne undersøgelse er designet til at vurdere gennemførligheden, forfine målpopulationen og hurtigt teste kvalitative og kvantitative ændringer i mikrobiomet efter kortvarig rejse (syv til 21 dage) til Syd- eller Sydøstasien, regioner hvor hyppigheden af ​​rejsendes diarré og tarmkolonisering med antimikrobielle resistente bakterier er højest.

Målgruppen vil omfatte 10 Emory University studerende og/eller Emory University Hospital TravelWell Clinic (TWC) patienter, som har internationale rejseplaner. Samtykkede, villige og kvalificerede deltagere vil gennemføre en indledende berettigelsesscreening, efterfulgt af studiebesøg før rejsen, kortsigtede post-rejser og langsigtede post-rejser. For at bestemme specifikke faktorer forbundet med diversitetsændring af tarmmikrobiotaen og ændringer i tilstedeværelsen af ​​gener, der koder for antibiotikaresistens, spørgeskemaer designet til at indsamle data om demografi, sygehistorie, kost, fødeindtagelse, nylige (inden for 12 uger før rejsen). vurdering, under rejse eller post-rejse) sygdomshistorie, medicinbrug, rejseplan, rejseaktiviteter og relevant mad- og vandrisikoadfærd vil blive afsluttet ved hvert studiebesøg. En afføringsprøve vil også blive givet på hvert tidspunkt. Deltagerne kan også vælge at deltage i et valgfrit delstudie, som involverer bankrester til fremtidig forskningsbrug.

Det primære protokolmål er at pilotere en undersøgelse, der undersøger sammenhængen mellem rejser og ændringer i tarmmikrobiomet (inklusive både bakterielle og svampekomponenter) og bakterie- og svamperesistomet.

Det sekundære protokolmål er at vurdere ændringer i mikrobiotaprofilen og tilbagevenden til eller mod tilstanden før rejsen ved at sammenligne resultaterne af sekventering af præ-rejse af afføringsprøver med kortsigtede post-travel og langsigtede post-travel prøvesekvenseringsresultater.