Пилотное исследование по оценке диверсификации и изменений кишечной микробиоты после поездки в Южную (Восточную) Азию из США (ABROAD)

Диарея путешественников является наиболее распространенным заболеванием, с которым сталкиваются те, кто выезжает за границу. Оценки разнятся, но сообщается, что заболеваемость колеблется от 30 до 60%, в зависимости от пункта назначения и сезона. Причиной диареи путешественников считают несколько организмов, но бактерии составляют 80-90% случаев. Появляется все больше доказательств того, что целостность кишечного микробиома может быть сильным модулятором диарейных заболеваний, и что кишечные инфекции и другие факторы, включая стресс, воздействие антибиотиков и диету, могут нарушать разнообразие и общий состав микробиома. Дисбактериоз, состояние измененного разнообразия микробиоты, может быть менее устойчивым к приобретению кишечных патогенов и колонизации множественными лекарственно-устойчивыми организмами. Кроме того, нарушения в микробиоме, которые могут возникнуть в результате эпизода диареи путешественников, могут играть роль в развитии хронической диареи и постинфекционного синдрома раздраженного кишечника.

Это проспективное обсервационное пилотное исследование предназначено для получения предварительных данных, подтверждающих обоснование последующего более крупного когортного исследования. Это исследование предназначено для оценки осуществимости, уточнения целевой популяции и быстрого тестирования качественных и количественных изменений в микробиоме после краткосрочного путешествия (от семи до 21 дня) в Южную или Юго-Восточную Азию, регионы, где уровень диареи путешественников и кишечной колонизации с устойчивыми к противомикробным препаратам бактериями являются самыми высокими.

Целевая группа будет включать 10 студентов Университета Эмори и/или пациентов клиники TravelWell Clinic (TWC) Университетской больницы Эмори, у которых есть планы международных поездок. Согласованные, желающие и соответствующие критериям участники пройдут первоначальный скрининг на соответствие требованиям, за которым последуют учебные визиты перед поездкой, краткосрочные и долгосрочные учебные визиты после поездки. Для определения специфических факторов, связанных с изменением разнообразия кишечной микробиоты и изменениями наличия генов, кодирующих устойчивость к антибиотикам, были разработаны анкеты, предназначенные для сбора данных о демографии, истории болезни, диете, потреблении пищи, недавних (в течение 12 недель до поездки) оценка, во время путешествия или после путешествия) история болезни, использование лекарств, маршрут путешествия, туристическая деятельность и соответствующее поведение, связанное с риском пищевых продуктов и воды, будут выполняться во время каждого исследовательского визита. Образец стула также будет предоставляться в каждый момент времени. Участники также могут принять участие в дополнительном подисследовании, которое включает в себя хранение остатков стула для использования в будущих исследованиях.

Основная цель протокола — пилотное исследование связи между путешествиями и изменениями кишечного микробиома (включая как бактериальные, так и грибковые компоненты), а также бактериального и грибкового резистома.

Вторичная цель протокола состоит в том, чтобы оценить изменения профиля микробиоты и возврат к состоянию до путешествия или к нему путем сравнения результатов секвенирования образцов стула до путешествия с краткосрочными результатами секвенирования образцов стула после путешествия и долгосрочными результатами секвенирования образцов стула после путешествия.