Screening av mikroorganismer av kryptogen mekanisk lungebetennelse gjennom neste generasjons sekvensering til lungevevsvæske (COPandNGS)

Årsaken til kryptogene organiserende lungebetennelse (COP) var ukjent, men studier hadde vist at visse bakterier, virus eller spesifikke patogener kunne påvises i bronkoalveolar lavage fluid (BALF) hos noen pasienter, og disse patogene mikroorganismene kan være årsaken til COP. Prøver ble tatt med konvensjonelle metoder (sputum, blod, BALF eller lungepunkturvæske) for mikrobiologisk påvisning. På grunn av påvirkning av kvaliteten på ervervede prøver, prøvekonservering og transport som var påvirket av eksterne faktorer, fikk mange pasienter ikke gode testresultater, noe som påvirket diagnosen og påfølgende behandling av pasientene. Neste generasjons sekvensering (NGS) som kan bestemme hundretusener til millioner av DNA-molekyler parallelt på en gang, og effektivt sekvensere eller fragmentere patogene mikroorganismer. NGS hadde i stor grad forbedret deteksjonshastigheten for patogene mikroorganismer. Denne studien hadde som mål å screene patogene mikroorganismer i BALF og lungepunkteringsvæske hos COP-pasienter av NGS, og ytterligere klargjøre sammenhengen mellom forekomst av COP og patogene mikroorganismer.