Screening van micro-organismen op cryptogene mechanische longontsteking door middel van next-generation sequencing naar longweefselvloeistof (COPandNGS)

De oorzaak van cryptogene organiserende pneumonie (COP) was onbekend, maar studies hadden aangetoond dat bepaalde bacteriën, virussen of specifieke pathogenen bij sommige patiënten konden worden gedetecteerd in bronchoalveolaire lavagevloeistof (BALF), en deze pathogene micro-organismen kunnen de oorzaak zijn van COP. Monsters werden verkregen met conventionele methoden (sputum, bloed, BALF of longpunctievloeistof) voor microbiologische detectie. Vanwege de invloed van de kwaliteit van de verkregen monsters, het behoud van het monster en het transport die werden beïnvloed door externe factoren, kregen veel patiënten geen goede testresultaten, wat de diagnose en daaropvolgende behandeling van patiënten beïnvloedde. Sequencing van de volgende generatie (NGS) die honderdduizenden tot miljoenen DNA-moleculen in één keer parallel kan bepalen, en efficiënt de sequentie of fragment van pathogene micro-organismen kan bepalen. NGS had de detectiesnelheid van pathogene micro-organismen aanzienlijk verbeterd. Deze studie was gericht op het screenen van pathogene micro-organismen in BALF en longpunctievloeistof van COP-patiënten door NGS, en om de correlatie tussen het optreden van COP en pathogene micro-organismen verder te verduidelijken.