Screening von Mikroorganismen kryptogener mechanischer Pneumonie durch Sequenzierung der nächsten Generation zu Lungengewebeflüssigkeit (COPandNGS)

Die Ursache der kryptogen organisierenden Pneumonie (COP) war unbekannt, aber Studien hatten gezeigt, dass bei einigen Patienten bestimmte Bakterien, Viren oder spezifische Krankheitserreger in der bronchoalveolären Lavageflüssigkeit (BALF) nachgewiesen werden konnten und diese pathogenen Mikroorganismen die Ursache der COP sein könnten. Die Proben wurden mit konventionellen Methoden (Sputum, Blut, BALF oder Lungenpunktionsflüssigkeit) für den mikrobiologischen Nachweis gewonnen. Aufgrund des Einflusses der Qualität der gewonnenen Proben, der Probenaufbewahrung und des Transports, die durch externe Faktoren beeinflusst wurden, erhielten viele Patienten keine guten Testergebnisse, was sich auf die Diagnose und die anschließende Behandlung der Patienten auswirkte. Sequenzierung der nächsten Generation (NGS), die Hunderttausende bis Millionen von DNA-Molekülen gleichzeitig parallel bestimmen und pathogene Mikroorganismen effizient sequenzieren oder fragmentieren könnte. NGS hatte die Erkennungsrate von pathogenen Mikroorganismen stark verbessert. Diese Studie zielte darauf ab, pathogene Mikroorganismen in BALF und Lungenpunktionsflüssigkeit von COP-Patienten durch NGS zu screenen und die Korrelation zwischen dem Auftreten von COP und pathogenen Mikroorganismen weiter zu klären.