Microrganismo di screening della polmonite meccanica criptogenica attraverso il sequenziamento di nuova generazione al fluido del tessuto polmonare (COPandNGS)

La causa della polmonite organizzata criptogenetica (COP) era sconosciuta, ma gli studi avevano dimostrato che alcuni batteri, virus o agenti patogeni specifici potevano essere rilevati nel liquido di lavaggio broncoalveolare (BALF) in alcuni pazienti e questi microrganismi patogeni potevano essere la causa della COP. I campioni sono stati ottenuti con metodi convenzionali (espettorato, sangue, BALF o liquido di puntura polmonare) per il rilevamento microbiologico. A causa dell'influenza della qualità dei campioni acquisiti, della conservazione e del trasporto dei campioni che sono stati influenzati da fattori esterni, molti pazienti non hanno ottenuto buoni risultati dei test, il che ha influito sulla diagnosi e sul successivo trattamento dei pazienti. Sequenziamento di nuova generazione (NGS) che potrebbe determinare da centinaia di migliaia a milioni di molecole di DNA in parallelo contemporaneamente e sequenziare o frammentare in modo efficiente microrganismi patogeni. NGS aveva notevolmente migliorato il tasso di rilevamento di microrganismi patogeni. Questo studio mirava a schermare i microrganismi patogeni nel BALF e nel fluido di puntura polmonare dei pazienti con COP mediante NGS e chiarire ulteriormente la correlazione tra l'insorgenza di COP e microrganismi patogeni.