Denne siden ble automatisk oversatt og nøyaktigheten av oversettelsen er ikke garantert. Vennligst referer til engelsk versjon for en kildetekst.

MITOMICS: en multi-OMICS-tilnærming for diagnostisering av mitokondrielle sykdommer (MITOMICS)

11. januar 2024 oppdatert av: Centre Hospitalier Universitaire de Nice

Interessen for Multi-omics (WES / RNA-Seq) tilnærming til å bekjempe den diagnostiske dødlåsen i mitokondrielle sykdommer

MITOMICS tar sikte på å bestemme hvilke RNA-Seq-resultater (fra muskel eller fibroblaster) som er de mest informative for tolkningen av VUS identifisert av WES for pasienter mistenkt for mitokondriell myopati. Analyse av RNA-Seq og WES-resultater vil utføres med en beregningsmessig tilnærming ved bruk av en autoenkoder-basert metode

Studieoversikt

Status

Rekruttering

Detaljert beskrivelse

Mitokondrielle sykdommer (MD) er sjeldne, klinisk og genetisk ekstremt heterogene, forårsaket av mangel på energiproduksjon via mitokondriene. Mitokondrier er avhengige av 2 genom mitokondrielt DNA og kjernefysisk DNA, og mange patogene varianter som bæres av disse 2 genomene er ansvarlige for mitokondrielle sykdommer. De diagnostiske strategiene for MD-pasienter har utviklet seg betydelig med fremveksten av Next Generation Sequencing (NGS), som også akselererer identifiseringen av det ansvarlige genet. Imidlertid forblir det diagnostiske utbyttet begrenset og krever utvikling av nye tilnærminger. Tidligere studier viste at kombinasjonen WES og RNA-Seq forbedrer diagnosen MD, hovedsakelig ved å hjelpe til med tolkningen av identifisert VUS.

Med MITOMICS-prosjektet vil vi inkludere 66 pasienter mistenkt for en mitokondriell myopati (klinisk, histologisk eller biokjemisk), med negativ mtDNA og WES NGS i trio. For hver pasient vil vi sekvensere RNA fra muskel og fibroblaster. Ved å bruke en ny innovativ metologi for multi-OMICS-integrasjon vil vi bestemme hvilke RNA-Seq-data (fra muskel eller fibroblaster) som er de mest informative for tolkningen av VUS identifisert av WES for pasienter mistenkt for mitokondriell myopati. Resultatene som oppnås vil tillate tolkning av VUS og identifisering av spesifikke molekylære signaturer.

Studietype

Observasjonsmessig

Registrering (Antatt)

66

Kontakter og plasseringer

Denne delen inneholder kontaktinformasjon for de som utfører studien, og informasjon om hvor denne studien blir utført.

Studiekontakt

Studiesteder

      • Angers, Frankrike
        • Rekruttering
        • Chu Angers
        • Hovedetterforsker:
          • Vincent PROCACCIO, MD
      • Brest, Frankrike
        • Rekruttering
        • C.H.R.U. Brest
        • Hovedetterforsker:
          • Pascale Marcorelles, MD
        • Hovedetterforsker:
          • Jean Noury, MD
      • Marseille, Frankrike
        • Rekruttering
        • APHM
        • Hovedetterforsker:
          • Shahram ATTARIAN, MD
        • Hovedetterforsker:
          • Brigitte Chabrol, MD
      • Nantes, Frankrike
        • Rekruttering
        • CHU de Nantes
        • Hovedetterforsker:
          • Yann Pereon, MD
        • Hovedetterforsker:
          • Sandra Mercier, MD
    • Chu de Nice
      • Nice, Chu de Nice, Frankrike, 06003
        • Rekruttering
        • CHU de Nice
        • Ta kontakt med:
        • Hovedetterforsker:
          • Sylvie BANNWARTH, MD

Deltakelseskriterier

Forskere ser etter personer som passer til en bestemt beskrivelse, kalt kvalifikasjonskriterier. Noen eksempler på disse kriteriene er en persons generelle helsetilstand eller tidligere behandlinger.

Kvalifikasjonskriterier

Alder som er kvalifisert for studier

1 år og eldre (Barn, Voksen, Eldre voksen)

Tar imot friske frivillige

Nei

Prøvetakingsmetode

Ikke-sannsynlighetsprøve

Studiepopulasjon

Pasienter blir sett i samråd av genetiske leger ved de forskjellige sentrene som en del av den vanlige behandlingen av deres mitokondrielle sykdom.

Beskrivelse

Inklusjonskriterier:

  • Pasienter mistenkt for en mitokondriell sykdom med muskulære tegn (kliniske, histologiske eller biokjemiske)
  • Pasienter med negativ mtDNA og WES NGS i trio
  • Pasienter med rutinemessige muskel- og hudbiopsier tilgjengelig
  • Blodprøver fra foreldre og/eller slektninger tilgjengelig for segregeringsstudier
  • Informert samtykke til studien signert av pasienten eller de juridiske representantene for den mindreårige pasienten eller under vergemål
  • Pasienter tilknyttet trygd

Ekskluderingskriterier:

  • Pasienter med mistanke om mitokondriell sykdom uten muskelinvolvering
  • Pasienter som ikke har blitt utført mtDNA NGS og WES
  • Pasienter med mistanke om mitokondriell sykdom med årsaksvariant identifisert
  • Avslag på å signere det informerte samtykket for studien
  • Utilstrekkelig mengde frosset materiale eller kultursvikt for fibroblaster

Studieplan

Denne delen gir detaljer om studieplanen, inkludert hvordan studien er utformet og hva studien måler.

Hvordan er studiet utformet?

Designdetaljer

  • Observasjonsmodeller: Kohort
  • Tidsperspektiver: Annen

Kohorter og intervensjoner

Gruppe / Kohort
Intervensjon / Behandling
Mitokondrielle sykdommer
analysering med metologi av multi-OMICS-integrasjon vil vi bestemme hvilke RNA-Seq-data (fra muskel eller fibroblaster) som er de mest informative for tolkningen av VUS identifisert av WES for pasienter mistenkt for mitokondriell myopati.
• Bestemmelse av tilstedeværelsen av spesifikke molekylære signaturer på RNA-nivå i muskler og fibroblaster fra pasienter

Hva måler studien?

Primære resultatmål

Resultatmål
Tiltaksbeskrivelse
Tidsramme
antall variasjoner tolket som ansvarlige for mitokondrielle sykdommer
Tidsramme: grunnlinje
• Sammenligning av antall variasjoner (skjøtevariant, ekspresjonsnivå) eller VUS, identifisert i WES, tolket som ansvarlig for sykdommen (klasse 4 eller 5 varianter) takket være (i) RNA-Seq utført fra en muskelbiopsi eller (ii) RNA-Seq utført fra fibroblaster
grunnlinje

Sekundære resultatmål

Resultatmål
Tiltaksbeskrivelse
Tidsramme
RNA ved mitokondirale sykdommer
Tidsramme: grunnlinje
Pasienter for hvem RNA-Seq ikke kunne utføres og årsak til svikt
grunnlinje
variasjon av RNA i mitokondirale sykdommer
Tidsramme: grunnlinje
Variasjoner identifisert av RNA-Seq, som tillater tolkning av WES-data (avvikende skjøting, monoalleliske uttrykk, etc.)
grunnlinje
spesifikke molekylære signaturer av mitokondirale sykdommer
Tidsramme: grunnlinje
Bestemmelse av tilstedeværelsen av spesifikke molekylære signaturer på RNA-nivå i muskler og fibroblaster fra pasienter
grunnlinje

Samarbeidspartnere og etterforskere

Det er her du vil finne personer og organisasjoner som er involvert i denne studien.

Etterforskere

  • Hovedetterforsker: SYLVIE BANNWARTH, Centre Hospitalier Universitaire de Nice

Studierekorddatoer

Disse datoene sporer fremdriften for innsending av studieposter og sammendragsresultater til ClinicalTrials.gov. Studieposter og rapporterte resultater gjennomgås av National Library of Medicine (NLM) for å sikre at de oppfyller spesifikke kvalitetskontrollstandarder før de legges ut på det offentlige nettstedet.

Studer hoveddatoer

Studiestart (Faktiske)

7. mars 2022

Primær fullføring (Faktiske)

7. mars 2022

Studiet fullført (Antatt)

7. september 2025

Datoer for studieregistrering

Først innsendt

4. juni 2021

Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene

4. juni 2021

Først lagt ut (Faktiske)

10. juni 2021

Oppdateringer av studieposter

Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)

12. januar 2024

Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene

11. januar 2024

Sist bekreftet

1. januar 2024

Mer informasjon

Begreper knyttet til denne studien

Ytterligere relevante MeSH-vilkår

Andre studie-ID-numre

  • 19-API-01
  • 2020-A02651-38 (Registeridentifikator: IDRCB)

Plan for individuelle deltakerdata (IPD)

Planlegger du å dele individuelle deltakerdata (IPD)?

NEI

Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter

Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt

Nei

Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt

Nei

Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .

3
Abonnere