Denne side blev automatisk oversat, og nøjagtigheden af ​​oversættelsen er ikke garanteret. Der henvises til engelsk version for en kildetekst.

MITOMICS: en multi-OMICS-tilgang til diagnosticering af mitokondrielle sygdomme (MITOMICS)

11. januar 2024 opdateret af: Centre Hospitalier Universitaire de Nice

Interessen for Multi-omics (WES / RNA-Seq) tilgang til at bekæmpe den diagnostiske dødvande i mitokondrielle sygdomme

MITOMICS har til formål at bestemme, hvilke RNA-Seq-resultater (fra muskler eller fibroblaster) der er de mest informative for fortolkningen af ​​VUS identificeret af WES for patienter, der mistænkes for mitokondriel myopati. Analyse af RNA-Seq- og WES-resultater udføres med en beregningsmetode ved hjælp af en autoencoder-baseret metode

Studieoversigt

Status

Rekruttering

Detaljeret beskrivelse

Mitokondrielle sygdomme (MD) er sjældne, klinisk og genetisk ekstremt heterogene, forårsaget af et underskud af energiproduktion via mitokondrierne. Mitokondrier er afhængige af 2 genomer mitokondrielt DNA og nuklear DNA, og mange patogene varianter båret af disse 2 genomer er ansvarlige for mitokondrielle sygdomme. De diagnostiske strategier for MD-patienter har udviklet sig betydeligt med fremkomsten af ​​Next Generation Sequencing (NGS), der også accelererer identifikationen af ​​det ansvarlige gen. Det diagnostiske udbytte forbliver dog begrænset og kræver udvikling af nye tilgange. Tidligere undersøgelser viste, at WES og RNA-Seq kombination forbedrer diagnosen MD, hovedsagelig ved at hjælpe med fortolkningen af ​​identificeret VUS.

Med MITOMICS-projektet vil vi inkludere 66 patienter mistænkt for en mitokondriel myopati (klinisk, histologisk eller biokemisk), med negativt mtDNA og WES NGS i trio. For hver patient vil vi sekventere RNA fra muskler og fibroblaster. Ved hjælp af en ny innovativ metode for multi-OMICS-integration vil vi bestemme, hvilke RNA-Seq-data (fra muskel- eller fibroblaster) der er de mest informative til fortolkningen af ​​VUS identificeret af WES for patienter, der er mistænkt for mitokondriel myopati. De opnåede resultater vil tillade fortolkning af VUS og identifikation af specifikke molekylære signaturer.

Undersøgelsestype

Observationel

Tilmelding (Anslået)

66

Kontakter og lokationer

Dette afsnit indeholder kontaktoplysninger for dem, der udfører undersøgelsen, og oplysninger om, hvor denne undersøgelse udføres.

Studiekontakt

Studiesteder

      • Angers, Frankrig
        • Rekruttering
        • Chu Angers
        • Ledende efterforsker:
          • Vincent PROCACCIO, MD
      • Brest, Frankrig
        • Rekruttering
        • C.H.R.U. Brest
        • Ledende efterforsker:
          • Pascale Marcorelles, MD
        • Ledende efterforsker:
          • Jean Noury, MD
      • Marseille, Frankrig
        • Rekruttering
        • APHM
        • Ledende efterforsker:
          • Shahram ATTARIAN, MD
        • Ledende efterforsker:
          • Brigitte Chabrol, MD
      • Nantes, Frankrig
        • Rekruttering
        • CHU de Nantes
        • Ledende efterforsker:
          • Yann Pereon, MD
        • Ledende efterforsker:
          • Sandra Mercier, MD
    • Chu de Nice
      • Nice, Chu de Nice, Frankrig, 06003
        • Rekruttering
        • CHU de Nice
        • Kontakt:
        • Ledende efterforsker:
          • Sylvie BANNWARTH, MD

Deltagelseskriterier

Forskere leder efter personer, der passer til en bestemt beskrivelse, kaldet berettigelseskriterier. Nogle eksempler på disse kriterier er en persons generelle helbredstilstand eller tidligere behandlinger.

Berettigelseskriterier

Aldre berettiget til at studere

1 år og ældre (Barn, Voksen, Ældre voksen)

Tager imod sunde frivillige

Ingen

Prøveudtagningsmetode

Ikke-sandsynlighedsprøve

Studiebefolkning

Patienter ses i samråd af de genetiske læger på de forskellige centre som en del af den sædvanlige behandling af deres mitokondriesygdom.

Beskrivelse

Inklusionskriterier:

  • Patienter, der er mistænkt for en mitokondriel sygdom med muskulære tegn (kliniske, histologiske eller biokemiske)
  • Patienter med negativ mtDNA og WES NGS i trio
  • Patienter med rutinemæssige muskel- og hudbiopsier tilgængelige
  • Blodprøver fra forældre og/eller slægtninge er tilgængelige til segregationsundersøgelser
  • Informeret samtykke til undersøgelsen underskrevet af patienten eller de juridiske repræsentanter for den mindreårige patient eller under værgemål
  • Patienter tilknyttet social sikring

Ekskluderingskriterier:

  • Patienter med mistanke om mitokondriel sygdom uden muskelpåvirkning
  • Patienter, for hvem mtDNA NGS og WES ikke er blevet udført
  • Patienter med mistanke om mitokondriel sygdom med årsagsvariant identificeret
  • Afvisning af at underskrive det informerede samtykke til undersøgelsen
  • Utilstrækkelig mængde frosset materiale eller dyrkningsfejl for fibroblaster

Studieplan

Dette afsnit indeholder detaljer om studieplanen, herunder hvordan undersøgelsen er designet, og hvad undersøgelsen måler.

Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?

Design detaljer

  • Observationsmodeller: Kohorte
  • Tidsperspektiver: Andet

Kohorter og interventioner

Gruppe / kohorte
Intervention / Behandling
Mitokondrielle sygdomme
ved at analysere med metologi for multi-OMICS-integration vil vi bestemme, hvilke RNA-Seq-data (fra muskel eller fibroblaster) der er de mest informative for fortolkningen af ​​VUS identificeret af WES for patienter, der er mistænkt for mitokondriel myopati.
• Bestemmelse af tilstedeværelsen af ​​specifikke molekylære signaturer på RNA-niveau i muskler og fibroblaster fra patienter

Hvad måler undersøgelsen?

Primære resultatmål

Resultatmål
Foranstaltningsbeskrivelse
Tidsramme
antal variationer tolket som ansvarlige for mitokondrielle sygdomme
Tidsramme: baseline
• Sammenligning af antallet af variationer (splejsningsvariant, ekspressionsniveau) eller VUS, identificeret i WES, fortolket som ansvarlige for sygdommen (klasse 4 eller 5 varianter) takket være (i) RNA-Seq udført fra en muskelbiopsi eller (ii) RNA-Seq udført fra fibroblaster
baseline

Sekundære resultatmål

Resultatmål
Foranstaltningsbeskrivelse
Tidsramme
RNA i mitokondirale sygdomme
Tidsramme: baseline
Patienter, for hvem RNA-Seq ikke kunne udføres og årsag til svigt
baseline
variation af RNA i mitokondirale sygdomme
Tidsramme: baseline
Variationer identificeret af RNA-Seq, der tillader fortolkning af WES-data (splejsning afvigende, monoalleliske udtryk osv.)
baseline
specifikke molekylære signaturer af mitokondirale sygdomme
Tidsramme: baseline
Bestemmelse af tilstedeværelsen af ​​specifikke molekylære signaturer på RNA-niveau i muskler og fibroblaster fra patienter
baseline

Samarbejdspartnere og efterforskere

Det er her, du vil finde personer og organisationer, der er involveret i denne undersøgelse.

Efterforskere

  • Ledende efterforsker: SYLVIE BANNWARTH, Centre Hospitalier Universitaire de Nice

Datoer for undersøgelser

Disse datoer sporer fremskridtene for indsendelser af undersøgelsesrekord og resumeresultater til ClinicalTrials.gov. Studieregistreringer og rapporterede resultater gennemgås af National Library of Medicine (NLM) for at sikre, at de opfylder specifikke kvalitetskontrolstandarder, før de offentliggøres på den offentlige hjemmeside.

Studer store datoer

Studiestart (Faktiske)

7. marts 2022

Primær færdiggørelse (Faktiske)

7. marts 2022

Studieafslutning (Anslået)

7. september 2025

Datoer for studieregistrering

Først indsendt

4. juni 2021

Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier

4. juni 2021

Først opslået (Faktiske)

10. juni 2021

Opdateringer af undersøgelsesjournaler

Sidste opdatering sendt (Faktiske)

12. januar 2024

Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier

11. januar 2024

Sidst verificeret

1. januar 2024

Mere information

Begreber relateret til denne undersøgelse

Yderligere relevante MeSH-vilkår

Andre undersøgelses-id-numre

  • 19-API-01
  • 2020-A02651-38 (Registry Identifier: IDRCB)

Plan for individuelle deltagerdata (IPD)

Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?

INGEN

Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter

Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt

Ingen

Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt

Ingen

Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .

Kliniske forsøg med Mitokondrielle sygdomme

  • The Champ Foundation
    Children's Hospital of Philadelphia; The Cleveland Clinic
    Rekruttering
    Pearsons syndrom | Single Large Scale Mitochondrial DNA Deletion Syndrome (SLSMDS)
    Forenede Stater
  • Oregon Health and Science University
    University of Pittsburgh
    Afsluttet
    Meget langkædet acylCoA-dehydrogenase (VLCAD) mangel | Carnitin Palmitoyltransferase 2 (CPT2) mangel | Mitochondrial Trifunctional Protein (TFP) mangel | Langkædet 3 hydroxyacylCoA dehydrogenase (LCHAD) mangel
    Forenede Stater
  • LMU Klinikum
    Seventh Framework Programme; NBIA Alliance
    Rekruttering
    Neurodegeneration med hjernejernakkumulation (NBIA) | Pantothenatkinase-associeret neurodegeneration (PKAN) | Aceruloplasminæmi | Beta-propeller protein-associeret neurodegeneration (BPAN) | Mitochondrial Membrane Protein Associated Neurodegeneration (MPAN) | Fatty Acid Hydroxylase-associated Neurodegeneration... og andre forhold
    Canada, Tjekkiet, Tyskland, Italien, Holland, Polen, Serbien, Spanien
3
Abonner