- ICH GCP
- US Clinical Trials Registry
- Klinisk forsøg NCT04920812
MITOMICS: en multi-OMICS-tilgang til diagnosticering af mitokondrielle sygdomme (MITOMICS)
Interessen for Multi-omics (WES / RNA-Seq) tilgang til at bekæmpe den diagnostiske dødvande i mitokondrielle sygdomme
Studieoversigt
Status
Betingelser
Intervention / Behandling
Detaljeret beskrivelse
Mitokondrielle sygdomme (MD) er sjældne, klinisk og genetisk ekstremt heterogene, forårsaget af et underskud af energiproduktion via mitokondrierne. Mitokondrier er afhængige af 2 genomer mitokondrielt DNA og nuklear DNA, og mange patogene varianter båret af disse 2 genomer er ansvarlige for mitokondrielle sygdomme. De diagnostiske strategier for MD-patienter har udviklet sig betydeligt med fremkomsten af Next Generation Sequencing (NGS), der også accelererer identifikationen af det ansvarlige gen. Det diagnostiske udbytte forbliver dog begrænset og kræver udvikling af nye tilgange. Tidligere undersøgelser viste, at WES og RNA-Seq kombination forbedrer diagnosen MD, hovedsagelig ved at hjælpe med fortolkningen af identificeret VUS.
Med MITOMICS-projektet vil vi inkludere 66 patienter mistænkt for en mitokondriel myopati (klinisk, histologisk eller biokemisk), med negativt mtDNA og WES NGS i trio. For hver patient vil vi sekventere RNA fra muskler og fibroblaster. Ved hjælp af en ny innovativ metode for multi-OMICS-integration vil vi bestemme, hvilke RNA-Seq-data (fra muskel- eller fibroblaster) der er de mest informative til fortolkningen af VUS identificeret af WES for patienter, der er mistænkt for mitokondriel myopati. De opnåede resultater vil tillade fortolkning af VUS og identifikation af specifikke molekylære signaturer.
Undersøgelsestype
Tilmelding (Anslået)
Kontakter og lokationer
Studiekontakt
- Navn: SYLVIE BANNWARTH
- Telefonnummer: 0492034702
- E-mail: bannwarth.s@chu-nice.fr
Studiesteder
-
-
-
Angers, Frankrig
- Rekruttering
- Chu Angers
-
Ledende efterforsker:
- Vincent PROCACCIO, MD
-
Brest, Frankrig
- Rekruttering
- C.H.R.U. Brest
-
Ledende efterforsker:
- Pascale Marcorelles, MD
-
Ledende efterforsker:
- Jean Noury, MD
-
Marseille, Frankrig
- Rekruttering
- APHM
-
Ledende efterforsker:
- Shahram ATTARIAN, MD
-
Ledende efterforsker:
- Brigitte Chabrol, MD
-
Nantes, Frankrig
- Rekruttering
- CHU de Nantes
-
Ledende efterforsker:
- Yann Pereon, MD
-
Ledende efterforsker:
- Sandra Mercier, MD
-
-
Chu de Nice
-
Nice, Chu de Nice, Frankrig, 06003
- Rekruttering
- CHU de Nice
-
Kontakt:
- Telefonnummer: 0492034702
- E-mail: bannwarth.s@chu-nice.fr
-
Ledende efterforsker:
- Sylvie BANNWARTH, MD
-
-
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
Tager imod sunde frivillige
Prøveudtagningsmetode
Studiebefolkning
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- Patienter, der er mistænkt for en mitokondriel sygdom med muskulære tegn (kliniske, histologiske eller biokemiske)
- Patienter med negativ mtDNA og WES NGS i trio
- Patienter med rutinemæssige muskel- og hudbiopsier tilgængelige
- Blodprøver fra forældre og/eller slægtninge er tilgængelige til segregationsundersøgelser
- Informeret samtykke til undersøgelsen underskrevet af patienten eller de juridiske repræsentanter for den mindreårige patient eller under værgemål
- Patienter tilknyttet social sikring
Ekskluderingskriterier:
- Patienter med mistanke om mitokondriel sygdom uden muskelpåvirkning
- Patienter, for hvem mtDNA NGS og WES ikke er blevet udført
- Patienter med mistanke om mitokondriel sygdom med årsagsvariant identificeret
- Afvisning af at underskrive det informerede samtykke til undersøgelsen
- Utilstrækkelig mængde frosset materiale eller dyrkningsfejl for fibroblaster
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
- Observationsmodeller: Kohorte
- Tidsperspektiver: Andet
Kohorter og interventioner
Gruppe / kohorte |
Intervention / Behandling |
---|---|
Mitokondrielle sygdomme
ved at analysere med metologi for multi-OMICS-integration vil vi bestemme, hvilke RNA-Seq-data (fra muskel eller fibroblaster) der er de mest informative for fortolkningen af VUS identificeret af WES for patienter, der er mistænkt for mitokondriel myopati.
|
• Bestemmelse af tilstedeværelsen af specifikke molekylære signaturer på RNA-niveau i muskler og fibroblaster fra patienter
|
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
---|---|---|
antal variationer tolket som ansvarlige for mitokondrielle sygdomme
Tidsramme: baseline
|
• Sammenligning af antallet af variationer (splejsningsvariant, ekspressionsniveau) eller VUS, identificeret i WES, fortolket som ansvarlige for sygdommen (klasse 4 eller 5 varianter) takket være (i) RNA-Seq udført fra en muskelbiopsi eller (ii) RNA-Seq udført fra fibroblaster
|
baseline
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
---|---|---|
RNA i mitokondirale sygdomme
Tidsramme: baseline
|
Patienter, for hvem RNA-Seq ikke kunne udføres og årsag til svigt
|
baseline
|
variation af RNA i mitokondirale sygdomme
Tidsramme: baseline
|
Variationer identificeret af RNA-Seq, der tillader fortolkning af WES-data (splejsning afvigende, monoalleliske udtryk osv.)
|
baseline
|
specifikke molekylære signaturer af mitokondirale sygdomme
Tidsramme: baseline
|
Bestemmelse af tilstedeværelsen af specifikke molekylære signaturer på RNA-niveau i muskler og fibroblaster fra patienter
|
baseline
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Efterforskere
- Ledende efterforsker: SYLVIE BANNWARTH, Centre Hospitalier Universitaire de Nice
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
Primær færdiggørelse (Faktiske)
Studieafslutning (Anslået)
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Faktiske)
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
- 19-API-01
- 2020-A02651-38 (Registry Identifier: IDRCB)
Plan for individuelle deltagerdata (IPD)
Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .
Kliniske forsøg med Mitokondrielle sygdomme
-
The Champ FoundationChildren's Hospital of Philadelphia; The Cleveland ClinicRekrutteringPearsons syndrom | Single Large Scale Mitochondrial DNA Deletion Syndrome (SLSMDS)Forenede Stater
-
Oregon Health and Science UniversityUniversity of PittsburghAfsluttetMeget langkædet acylCoA-dehydrogenase (VLCAD) mangel | Carnitin Palmitoyltransferase 2 (CPT2) mangel | Mitochondrial Trifunctional Protein (TFP) mangel | Langkædet 3 hydroxyacylCoA dehydrogenase (LCHAD) mangelForenede Stater
-
LMU KlinikumSeventh Framework Programme; NBIA AllianceRekrutteringNeurodegeneration med hjernejernakkumulation (NBIA) | Pantothenatkinase-associeret neurodegeneration (PKAN) | Aceruloplasminæmi | Beta-propeller protein-associeret neurodegeneration (BPAN) | Mitochondrial Membrane Protein Associated Neurodegeneration (MPAN) | Fatty Acid Hydroxylase-associated Neurodegeneration... og andre forholdCanada, Tjekkiet, Tyskland, Italien, Holland, Polen, Serbien, Spanien