- ICH GCP
- US-Register für klinische Studien
- Klinische Studie NCT04920812
MITOMICS: ein Multi-OMICS-Ansatz zur Diagnose von mitochondrialen Erkrankungen (MITOMICS)
Interesse des Multi-Omics (WES/RNA-Seq)-Ansatzes zur Bekämpfung des diagnostischen Stillstands bei Mitochondrienerkrankungen
Studienübersicht
Status
Bedingungen
Intervention / Behandlung
Detaillierte Beschreibung
Mitochondriale Erkrankungen (MD) sind selten, klinisch und genetisch sehr heterogen, verursacht durch einen Mangel an Energieproduktion über die Mitochondrien. Mitochondrien sind abhängig von 2 Genomen, der mitochondrialen DNA und der nuklearen DNA, und viele pathogene Varianten, die von diesen 2 Genomen getragen werden, sind für mitochondriale Erkrankungen verantwortlich. Die diagnostischen Strategien für MD-Patienten haben sich mit dem Aufkommen der Sequenzierung der nächsten Generation (NGS) erheblich weiterentwickelt, was auch die Identifizierung des verantwortlichen Gens beschleunigt. Die diagnostische Ausbeute bleibt jedoch begrenzt und erfordert die Entwicklung neuer Ansätze. Frühere Studien zeigten, dass die Kombination von WES und RNA-Seq die Diagnose von MD verbessert, im Wesentlichen indem sie bei der Interpretation identifizierter VUS hilft.
Mit dem MITOMICS-Projekt werden wir 66 Patienten mit Verdacht auf eine mitochondriale Myopathie (klinisch, histologisch oder biochemisch) mit negativer mtDNA und WES NGS in Trio aufnehmen. Für jeden Patienten werden wir RNA aus Muskel und Fibroblasten sequenzieren. Unter Verwendung einer neuen innovativen Methodik der Multi-OMICS-Integration werden wir bestimmen, welche RNA-Seq-Daten (aus Muskel oder Fibroblasten) für die Interpretation von VUS am informativsten sind, die von WES für Patienten mit Verdacht auf mitochondriale Myopathie identifiziert wurden. Die erhaltenen Ergebnisse werden die Interpretation von VUS und die Identifizierung spezifischer molekularer Signaturen ermöglichen.
Studientyp
Einschreibung (Geschätzt)
Kontakte und Standorte
Studienkontakt
- Name: SYLVIE BANNWARTH
- Telefonnummer: 0492034702
- E-Mail: bannwarth.s@chu-nice.fr
Studienorte
-
-
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Angers, Frankreich
- Rekrutierung
- Chu Angers
-
Hauptermittler:
- Vincent PROCACCIO, MD
-
Brest, Frankreich
- Rekrutierung
- C.H.R.U. Brest
-
Hauptermittler:
- Pascale Marcorelles, MD
-
Hauptermittler:
- Jean Noury, MD
-
Marseille, Frankreich
- Rekrutierung
- APHM
-
Hauptermittler:
- Shahram ATTARIAN, MD
-
Hauptermittler:
- Brigitte Chabrol, MD
-
Nantes, Frankreich
- Rekrutierung
- CHU de Nantes
-
Hauptermittler:
- Yann Pereon, MD
-
Hauptermittler:
- Sandra Mercier, MD
-
-
Chu de Nice
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Nice, Chu de Nice, Frankreich, 06003
- Rekrutierung
- CHU de Nice
-
Kontakt:
- Telefonnummer: 0492034702
- E-Mail: bannwarth.s@chu-nice.fr
-
Hauptermittler:
- Sylvie BANNWARTH, MD
-
-
Teilnahmekriterien
Zulassungskriterien
Studienberechtigtes Alter
Akzeptiert gesunde Freiwillige
Probenahmeverfahren
Studienpopulation
Beschreibung
Einschlusskriterien:
- Patienten mit Verdacht auf eine mitochondriale Erkrankung mit muskulären Zeichen (klinisch, histologisch oder biochemisch)
- Patienten mit negativer mtDNA und WES NGS im Trio
- Patienten mit routinemäßigen Muskel- und Hautbiopsien verfügbar
- Blutproben von Eltern und/oder Verwandten für Segregationsstudien verfügbar
- Einverständniserklärung der Studie, unterzeichnet vom Patienten oder den gesetzlichen Vertretern des minderjährigen Patienten oder unter Vormundschaft
- Patienten, die der Sozialversicherung angeschlossen sind
Ausschlusskriterien:
- Patienten mit Verdacht auf eine mitochondriale Erkrankung ohne Muskelbeteiligung
- Patienten, bei denen die mtDNA NGS und WES nicht durchgeführt wurden
- Patienten mit Verdacht auf mitochondriale Erkrankung mit identifizierter kausaler Variante
- Weigerung, die Einverständniserklärung für die Studie zu unterzeichnen
- Unzureichende Menge an gefrorenem Material oder Kulturversagen für Fibroblasten
Studienplan
Wie ist die Studie aufgebaut?
Designdetails
- Beobachtungsmodelle: Kohorte
- Zeitperspektiven: Sonstiges
Kohorten und Interventionen
Gruppe / Kohorte |
Intervention / Behandlung |
---|---|
Mitochondriale Erkrankungen
Durch die Analyse mit der Methodik der Multi-OMICS-Integration werden wir bestimmen, welche RNA-Seq-Daten (aus Muskel oder Fibroblasten) die informativsten für die Interpretation von VUS sind, die von WES für Patienten mit Verdacht auf mitochondriale Myopathie identifiziert wurden.
|
• Bestimmung des Vorhandenseins spezifischer molekularer Signaturen auf RNA-Ebene in Muskeln und Fibroblasten von Patienten
|
Was misst die Studie?
Primäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
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Anzahl der Variationen, die als verantwortlich für die mitochondrialen Erkrankungen interpretiert werden
Zeitfenster: Grundlinie
|
• Vergleich der Anzahl der Variationen (Splicing-Variante, Expressionsniveau) oder VUS, identifiziert in WES, interpretiert als verantwortlich für die Krankheit (Varianten der Klasse 4 oder 5) dank (i) der durchgeführten RNA-Seq aus einer Muskelbiopsie oder (ii) RNA-Seq, durchgeführt von Fibroblasten
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Grundlinie
|
Sekundäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
---|---|---|
RNA bei mitochondrialen Erkrankungen
Zeitfenster: Grundlinie
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Patienten, bei denen die RNA-Seq nicht durchgeführt werden konnte und Grund für das Scheitern
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Grundlinie
|
Variation der RNA bei mitochondrialen Erkrankungen
Zeitfenster: Grundlinie
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Durch RNA-Seq identifizierte Variationen, die eine Interpretation von WES-Daten ermöglichen (Splicing-Abweichungen, monoallelische Expressionen usw.)
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Grundlinie
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spezifische molekulare Signaturen von mitochondrialen Erkrankungen
Zeitfenster: Grundlinie
|
Bestimmung des Vorhandenseins spezifischer molekularer Signaturen auf RNA-Ebene in Muskeln und Fibroblasten von Patienten
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Grundlinie
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Mitarbeiter und Ermittler
Ermittler
- Hauptermittler: SYLVIE BANNWARTH, Centre Hospitalier Universitaire de Nice
Studienaufzeichnungsdaten
Haupttermine studieren
Studienbeginn (Tatsächlich)
Primärer Abschluss (Tatsächlich)
Studienabschluss (Geschätzt)
Studienanmeldedaten
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst gepostet (Tatsächlich)
Studienaufzeichnungsaktualisierungen
Letztes Update gepostet (Tatsächlich)
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Zuletzt verifiziert
Mehr Informationen
Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie
Zusätzliche relevante MeSH-Bedingungen
Andere Studien-ID-Nummern
- 19-API-01
- 2020-A02651-38 (Registrierungskennung: IDRCB)
Plan für individuelle Teilnehmerdaten (IPD)
Planen Sie, individuelle Teilnehmerdaten (IPD) zu teilen?
Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt
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