Diese Seite wurde automatisch übersetzt und die Genauigkeit der Übersetzung wird nicht garantiert. Bitte wende dich an die englische Version für einen Quelltext.

MITOMICS: ein Multi-OMICS-Ansatz zur Diagnose von mitochondrialen Erkrankungen (MITOMICS)

11. Januar 2024 aktualisiert von: Centre Hospitalier Universitaire de Nice

Interesse des Multi-Omics (WES/RNA-Seq)-Ansatzes zur Bekämpfung des diagnostischen Stillstands bei Mitochondrienerkrankungen

MITOMICS zielt darauf ab, zu bestimmen, welche RNA-Seq-Ergebnisse (aus Muskel oder Fibroblasten) für die Interpretation von VUS, die von WES für Patienten mit Verdacht auf mitochondriale Myopathie identifiziert wurden, am informativsten sind. Die Analyse der RNA-Seq- und WES-Ergebnisse wird mit einem rechnerischen Ansatz unter Verwendung einer Autoencoder-basierten Methode durchgeführt

Studienübersicht

Status

Rekrutierung

Detaillierte Beschreibung

Mitochondriale Erkrankungen (MD) sind selten, klinisch und genetisch sehr heterogen, verursacht durch einen Mangel an Energieproduktion über die Mitochondrien. Mitochondrien sind abhängig von 2 Genomen, der mitochondrialen DNA und der nuklearen DNA, und viele pathogene Varianten, die von diesen 2 Genomen getragen werden, sind für mitochondriale Erkrankungen verantwortlich. Die diagnostischen Strategien für MD-Patienten haben sich mit dem Aufkommen der Sequenzierung der nächsten Generation (NGS) erheblich weiterentwickelt, was auch die Identifizierung des verantwortlichen Gens beschleunigt. Die diagnostische Ausbeute bleibt jedoch begrenzt und erfordert die Entwicklung neuer Ansätze. Frühere Studien zeigten, dass die Kombination von WES und RNA-Seq die Diagnose von MD verbessert, im Wesentlichen indem sie bei der Interpretation identifizierter VUS hilft.

Mit dem MITOMICS-Projekt werden wir 66 Patienten mit Verdacht auf eine mitochondriale Myopathie (klinisch, histologisch oder biochemisch) mit negativer mtDNA und WES NGS in Trio aufnehmen. Für jeden Patienten werden wir RNA aus Muskel und Fibroblasten sequenzieren. Unter Verwendung einer neuen innovativen Methodik der Multi-OMICS-Integration werden wir bestimmen, welche RNA-Seq-Daten (aus Muskel oder Fibroblasten) für die Interpretation von VUS am informativsten sind, die von WES für Patienten mit Verdacht auf mitochondriale Myopathie identifiziert wurden. Die erhaltenen Ergebnisse werden die Interpretation von VUS und die Identifizierung spezifischer molekularer Signaturen ermöglichen.

Studientyp

Beobachtungs

Einschreibung (Geschätzt)

66

Kontakte und Standorte

Dieser Abschnitt enthält die Kontaktdaten derjenigen, die die Studie durchführen, und Informationen darüber, wo diese Studie durchgeführt wird.

Studienkontakt

Studienorte

      • Angers, Frankreich
        • Rekrutierung
        • Chu Angers
        • Hauptermittler:
          • Vincent PROCACCIO, MD
      • Brest, Frankreich
        • Rekrutierung
        • C.H.R.U. Brest
        • Hauptermittler:
          • Pascale Marcorelles, MD
        • Hauptermittler:
          • Jean Noury, MD
      • Marseille, Frankreich
        • Rekrutierung
        • APHM
        • Hauptermittler:
          • Shahram ATTARIAN, MD
        • Hauptermittler:
          • Brigitte Chabrol, MD
      • Nantes, Frankreich
        • Rekrutierung
        • CHU de Nantes
        • Hauptermittler:
          • Yann Pereon, MD
        • Hauptermittler:
          • Sandra Mercier, MD
    • Chu de Nice
      • Nice, Chu de Nice, Frankreich, 06003
        • Rekrutierung
        • CHU de Nice
        • Kontakt:
        • Hauptermittler:
          • Sylvie BANNWARTH, MD

Teilnahmekriterien

Forscher suchen nach Personen, die einer bestimmten Beschreibung entsprechen, die als Auswahlkriterien bezeichnet werden. Einige Beispiele für diese Kriterien sind der allgemeine Gesundheitszustand einer Person oder frühere Behandlungen.

Zulassungskriterien

Studienberechtigtes Alter

1 Jahr und älter (Kind, Erwachsene, Älterer Erwachsener)

Akzeptiert gesunde Freiwillige

Nein

Probenahmeverfahren

Nicht-Wahrscheinlichkeitsprobe

Studienpopulation

Die Patienten werden von den genetischen Ärzten der verschiedenen Zentren im Rahmen der üblichen Behandlung ihrer mitochondrialen Erkrankung konsultiert.

Beschreibung

Einschlusskriterien:

  • Patienten mit Verdacht auf eine mitochondriale Erkrankung mit muskulären Zeichen (klinisch, histologisch oder biochemisch)
  • Patienten mit negativer mtDNA und WES NGS im Trio
  • Patienten mit routinemäßigen Muskel- und Hautbiopsien verfügbar
  • Blutproben von Eltern und/oder Verwandten für Segregationsstudien verfügbar
  • Einverständniserklärung der Studie, unterzeichnet vom Patienten oder den gesetzlichen Vertretern des minderjährigen Patienten oder unter Vormundschaft
  • Patienten, die der Sozialversicherung angeschlossen sind

Ausschlusskriterien:

  • Patienten mit Verdacht auf eine mitochondriale Erkrankung ohne Muskelbeteiligung
  • Patienten, bei denen die mtDNA NGS und WES nicht durchgeführt wurden
  • Patienten mit Verdacht auf mitochondriale Erkrankung mit identifizierter kausaler Variante
  • Weigerung, die Einverständniserklärung für die Studie zu unterzeichnen
  • Unzureichende Menge an gefrorenem Material oder Kulturversagen für Fibroblasten

Studienplan

Dieser Abschnitt enthält Einzelheiten zum Studienplan, einschließlich des Studiendesigns und der Messung der Studieninhalte.

Wie ist die Studie aufgebaut?

Designdetails

  • Beobachtungsmodelle: Kohorte
  • Zeitperspektiven: Sonstiges

Kohorten und Interventionen

Gruppe / Kohorte
Intervention / Behandlung
Mitochondriale Erkrankungen
Durch die Analyse mit der Methodik der Multi-OMICS-Integration werden wir bestimmen, welche RNA-Seq-Daten (aus Muskel oder Fibroblasten) die informativsten für die Interpretation von VUS sind, die von WES für Patienten mit Verdacht auf mitochondriale Myopathie identifiziert wurden.
• Bestimmung des Vorhandenseins spezifischer molekularer Signaturen auf RNA-Ebene in Muskeln und Fibroblasten von Patienten

Was misst die Studie?

Primäre Ergebnismessungen

Ergebnis Maßnahme
Maßnahmenbeschreibung
Zeitfenster
Anzahl der Variationen, die als verantwortlich für die mitochondrialen Erkrankungen interpretiert werden
Zeitfenster: Grundlinie
• Vergleich der Anzahl der Variationen (Splicing-Variante, Expressionsniveau) oder VUS, identifiziert in WES, interpretiert als verantwortlich für die Krankheit (Varianten der Klasse 4 oder 5) dank (i) der durchgeführten RNA-Seq aus einer Muskelbiopsie oder (ii) RNA-Seq, durchgeführt von Fibroblasten
Grundlinie

Sekundäre Ergebnismessungen

Ergebnis Maßnahme
Maßnahmenbeschreibung
Zeitfenster
RNA bei mitochondrialen Erkrankungen
Zeitfenster: Grundlinie
Patienten, bei denen die RNA-Seq nicht durchgeführt werden konnte und Grund für das Scheitern
Grundlinie
Variation der RNA bei mitochondrialen Erkrankungen
Zeitfenster: Grundlinie
Durch RNA-Seq identifizierte Variationen, die eine Interpretation von WES-Daten ermöglichen (Splicing-Abweichungen, monoallelische Expressionen usw.)
Grundlinie
spezifische molekulare Signaturen von mitochondrialen Erkrankungen
Zeitfenster: Grundlinie
Bestimmung des Vorhandenseins spezifischer molekularer Signaturen auf RNA-Ebene in Muskeln und Fibroblasten von Patienten
Grundlinie

Mitarbeiter und Ermittler

Hier finden Sie Personen und Organisationen, die an dieser Studie beteiligt sind.

Ermittler

  • Hauptermittler: SYLVIE BANNWARTH, Centre Hospitalier Universitaire de Nice

Studienaufzeichnungsdaten

Diese Daten verfolgen den Fortschritt der Übermittlung von Studienaufzeichnungen und zusammenfassenden Ergebnissen an ClinicalTrials.gov. Studienaufzeichnungen und gemeldete Ergebnisse werden von der National Library of Medicine (NLM) überprüft, um sicherzustellen, dass sie bestimmten Qualitätskontrollstandards entsprechen, bevor sie auf der öffentlichen Website veröffentlicht werden.

Haupttermine studieren

Studienbeginn (Tatsächlich)

7. März 2022

Primärer Abschluss (Tatsächlich)

7. März 2022

Studienabschluss (Geschätzt)

7. September 2025

Studienanmeldedaten

Zuerst eingereicht

4. Juni 2021

Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat

4. Juni 2021

Zuerst gepostet (Tatsächlich)

10. Juni 2021

Studienaufzeichnungsaktualisierungen

Letztes Update gepostet (Tatsächlich)

12. Januar 2024

Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt

11. Januar 2024

Zuletzt verifiziert

1. Januar 2024

Mehr Informationen

Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie

Zusätzliche relevante MeSH-Bedingungen

Andere Studien-ID-Nummern

  • 19-API-01
  • 2020-A02651-38 (Registrierungskennung: IDRCB)

Plan für individuelle Teilnehmerdaten (IPD)

Planen Sie, individuelle Teilnehmerdaten (IPD) zu teilen?

NEIN

Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen

Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt

Nein

Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt

Nein

Diese Informationen wurden ohne Änderungen direkt von der Website clinicaltrials.gov abgerufen. Wenn Sie Ihre Studiendaten ändern, entfernen oder aktualisieren möchten, wenden Sie sich bitte an register@clinicaltrials.gov. Sobald eine Änderung auf clinicaltrials.gov implementiert wird, wird diese automatisch auch auf unserer Website aktualisiert .

Klinische Studien zur Mitochondriale Erkrankungen

Klinische Studien zur Diagnose einer mitochondrialen Myopathie

3
Abonnieren