MITOMICS: uma abordagem multi-OMICS para o diagnóstico de doenças mitocondriais (MITOMICS)
Interesse da Abordagem Multi-ômica (WES / RNA-Seq) para combater o impasse diagnóstico em doenças mitocondriais
Visão geral do estudo
Status
Condições
Intervenção / Tratamento
Descrição detalhada
As doenças mitocondriais (DM) são raras, clinicamente e geneticamente extremamente heterogêneas, causadas por déficit de produção de energia via mitocôndria. As mitocôndrias são dependentes de 2 genomas DNA mitocondrial e DNA nuclear, e muitas variantes patogênicas transportadas por esses 2 genomas são responsáveis por doenças mitocondriais. As estratégias de diagnóstico para pacientes com DM evoluíram significativamente com o surgimento do Sequenciamento de Nova Geração (NGS), acelerando também a identificação do gene responsável. No entanto, o rendimento diagnóstico permanece limitado e requer o desenvolvimento de novas abordagens. Estudos anteriores mostraram que a combinação de WES e RNA-Seq melhora o diagnóstico de DM, essencialmente por ajudar na interpretação de VUS identificados.
Com o projeto MITOMICS, serão incluídos 66 pacientes com suspeita de miopatia mitocondrial (clínica, histológica ou bioquímica), com mtDNA negativo e WES NGS em trio. Para cada paciente iremos sequenciar o RNA do músculo e fibroblastos. Usando uma nova metodologia inovadora de integração multi-OMICS, determinaremos quais dados de RNA-Seq (de músculo ou fibroblastos) são os mais informativos para a interpretação de VUS identificados por WES para pacientes com suspeita de miopatia mitocondrial. Os resultados obtidos permitirão a interpretação do VUS e a identificação de assinaturas moleculares específicas.
Tipo de estudo
Inscrição (Estimado)
Contactos e Locais
Contato de estudo
- Nome: SYLVIE BANNWARTH
- Número de telefone: 0492034702
- E-mail: bannwarth.s@chu-nice.fr
Locais de estudo
-
-
-
Angers, França
- Recrutamento
- CHU Angers
-
Investigador principal:
- Vincent PROCACCIO, MD
-
Brest, França
- Recrutamento
- C.H.R.U. Brest
-
Investigador principal:
- Pascale Marcorelles, MD
-
Investigador principal:
- Jean Noury, MD
-
Marseille, França
- Recrutamento
- APHM
-
Investigador principal:
- Shahram ATTARIAN, MD
-
Investigador principal:
- Brigitte Chabrol, MD
-
Nantes, França
- Recrutamento
- CHU de Nantes
-
Investigador principal:
- Yann Pereon, MD
-
Investigador principal:
- Sandra Mercier, MD
-
-
Chu de Nice
-
Nice, Chu de Nice, França, 06003
- Recrutamento
- CHU de Nice
-
Contato:
- Número de telefone: 0492034702
- E-mail: bannwarth.s@chu-nice.fr
-
Investigador principal:
- Sylvie BANNWARTH, MD
-
-
Critérios de participação
Critérios de elegibilidade
Idades elegíveis para estudo
Aceita Voluntários Saudáveis
Método de amostragem
População do estudo
Descrição
Critério de inclusão:
- Pacientes com suspeita de doença mitocondrial com sinais musculares (clínicos, histológicos ou bioquímicos)
- Pacientes com mtDNA negativo e WES NGS em trio
- Pacientes com biópsias musculares e cutâneas de rotina disponíveis
- Amostras de sangue de pais e/ou parentes disponíveis para estudos de segregação
- Consentimento informado do estudo assinado pelo paciente ou pelos representantes legais do paciente menor ou sob tutela
- Doentes inscritos na segurança social
Critério de exclusão:
- Pacientes com suspeita de doença mitocondrial sem envolvimento muscular
- Pacientes para os quais o mtDNA NGS e WES não foram realizados
- Pacientes com suspeita de doença mitocondrial com variante causal identificada
- Recusa em assinar o consentimento informado para o estudo
- Quantidade insuficiente de material congelado ou falha na cultura para fibroblastos
Plano de estudo
Como o estudo é projetado?
Detalhes do projeto
- Modelos de observação: Coorte
- Perspectivas de Tempo: Outro
Coortes e Intervenções
Grupo / Coorte |
Intervenção / Tratamento |
|---|---|
|
Doenças mitocondriais
analisando com metodologia de integração multi-OMICS determinaremos quais dados de RNA-Seq (de músculo ou fibroblastos) são os mais informativos para a interpretação de VUS identificados por WES para pacientes com suspeita de miopatia mitocondrial.
|
• Determinação da presença de assinaturas moleculares específicas no nível de RNA em músculos e fibroblastos de pacientes
|
O que o estudo está medindo?
Medidas de resultados primários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
|---|---|---|
|
número de variações interpretadas como responsáveis pelas doenças mitocondriais
Prazo: linha de base
|
• Comparação do número de variações (variante de splicing, nível de expressão) ou VUS, identificadas no WES, interpretadas como responsáveis pela doença (variantes de classe 4 ou 5) graças a (i) o RNA-Seq realizado a partir de uma biópsia muscular ou (ii) RNA-Seq realizado a partir de fibroblastos
|
linha de base
|
Medidas de resultados secundários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
|---|---|---|
|
RNA em doenças mitocondriais
Prazo: linha de base
|
Pacientes para os quais o RNA-Seq não pôde ser realizado e motivo da falha
|
linha de base
|
|
variação do RNA nas doenças mitocondriais
Prazo: linha de base
|
Variações identificadas por RNA-Seq, permitindo a interpretação de dados WES (splicing aberrantes, expressões monoalélicas, etc.)
|
linha de base
|
|
assinaturas moleculares específicas de doenças mitocondriais
Prazo: linha de base
|
Determinação da presença de assinaturas moleculares específicas no nível do RNA em músculos e fibroblastos de pacientes
|
linha de base
|
Colaboradores e Investigadores
Patrocinador
Investigadores
- Investigador principal: SYLVIE BANNWARTH, Centre Hospitalier Universitaire de Nice
Datas de registro do estudo
Datas Principais do Estudo
Início do estudo (Real)
Conclusão Primária (Real)
Conclusão do estudo (Estimado)
Datas de inscrição no estudo
Enviado pela primeira vez
Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ
Primeira postagem (Real)
Atualizações de registro de estudo
Última Atualização Postada (Real)
Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade
Última verificação
Mais Informações
Termos relacionados a este estudo
Termos MeSH relevantes adicionais
Outros números de identificação do estudo
- 19-API-01
- 2020-A02651-38 (Identificador de registro: IDRCB)
Plano para dados de participantes individuais (IPD)
Planeja compartilhar dados de participantes individuais (IPD)?
Informações sobre medicamentos e dispositivos, documentos de estudo
Estuda um medicamento regulamentado pela FDA dos EUA
Estuda um produto de dispositivo regulamentado pela FDA dos EUA
Essas informações foram obtidas diretamente do site clinicaltrials.gov sem nenhuma alteração. Se você tiver alguma solicitação para alterar, remover ou atualizar os detalhes do seu estudo, entre em contato com register@clinicaltrials.gov. Assim que uma alteração for implementada em clinicaltrials.gov, ela também será atualizada automaticamente em nosso site .