- ICH GCP
- Register voor klinische proeven in de VS.
- Klinische proef NCT04920812
MITOMICS: een multi-OMICS-benadering voor de diagnose van mitochondriale ziekten (MITOMICS)
Interesse van Multi-omics (WES / RNA-Seq) benadering om te vechten tegen de diagnostische impasse bij mitochondriale ziekten
Studie Overzicht
Toestand
Conditie
Interventie / Behandeling
Gedetailleerde beschrijving
Mitochondriale ziekten (MD) zijn zeldzaam, klinisch en genetisch uiterst heterogeen, veroorzaakt door een tekort aan energieproductie via de mitochondriën. Mitochondria zijn afhankelijk van 2 genomen mitochondriaal DNA en nucleair DNA, en veel pathogene varianten die door deze 2 genomen worden gedragen, zijn verantwoordelijk voor mitochondriale ziekten. De diagnostische strategieën voor MD-patiënten zijn aanzienlijk geëvolueerd met de opkomst van Next Generation Sequencing (NGS), die ook de identificatie van het verantwoordelijke gen versnelt. De diagnostische opbrengst blijft echter beperkt en vereist de ontwikkeling van nieuwe benaderingen. Eerdere studies toonden aan dat de combinatie van WES en RNA-Seq de diagnose van MD verbetert, voornamelijk door te helpen bij de interpretatie van geïdentificeerde VUS.
Met het MITOMICS-project zullen we 66 patiënten includeren die verdacht worden van een mitochondriale myopathie (klinisch, histologisch of biochemisch), met een negatief mtDNA en WES NGS in trio. Voor elke patiënt zullen we RNA uit spieren en fibroblasten sequensen. Met behulp van een nieuwe innovatieve methodologie van multi-OMICS-integratie zullen we bepalen welke RNA-Seq-gegevens (van spieren of fibroblasten) het meest informatief zijn voor de interpretatie van VUS geïdentificeerd door WES voor patiënten die verdacht worden van mitochondriale myopathie. De verkregen resultaten zullen de interpretatie van VUS en de identificatie van specifieke moleculaire handtekeningen mogelijk maken.
Studietype
Inschrijving (Geschat)
Contacten en locaties
Studiecontact
- Naam: SYLVIE BANNWARTH
- Telefoonnummer: 0492034702
- E-mail: bannwarth.s@chu-nice.fr
Studie Locaties
-
-
-
Angers, Frankrijk
- Werving
- CHU Angers
-
Hoofdonderzoeker:
- Vincent PROCACCIO, MD
-
Brest, Frankrijk
- Werving
- C.H.R.U. Brest
-
Hoofdonderzoeker:
- Pascale Marcorelles, MD
-
Hoofdonderzoeker:
- Jean Noury, MD
-
Marseille, Frankrijk
- Werving
- APHM
-
Hoofdonderzoeker:
- Shahram ATTARIAN, MD
-
Hoofdonderzoeker:
- Brigitte Chabrol, MD
-
Nantes, Frankrijk
- Werving
- CHU de Nantes
-
Hoofdonderzoeker:
- Yann Pereon, MD
-
Hoofdonderzoeker:
- Sandra Mercier, MD
-
-
Chu de Nice
-
Nice, Chu de Nice, Frankrijk, 06003
- Werving
- CHU de Nice
-
Contact:
- Telefoonnummer: 0492034702
- E-mail: bannwarth.s@chu-nice.fr
-
Hoofdonderzoeker:
- Sylvie BANNWARTH, MD
-
-
Deelname Criteria
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
Accepteert gezonde vrijwilligers
Bemonsteringsmethode
Studie Bevolking
Beschrijving
Inclusiecriteria:
- Patiënten die verdacht worden van een mitochondriale ziekte met spiersymptomen (klinisch, histologisch of biochemisch)
- Patiënten met negatief mtDNA en WES NGS in trio
- Patiënten met routinematige spier- en huidbiopten beschikbaar
- Bloedmonsters van ouders en/of familieleden beschikbaar voor segregatieonderzoeken
- Geïnformeerde toestemming van de studie ondertekend door de patiënt of de wettelijke vertegenwoordigers van de minderjarige patiënt of onder curatele
- Patiënten aangesloten bij de sociale zekerheid
Uitsluitingscriteria:
- Patiënten met vermoedelijke mitochondriale ziekte zonder spierbetrokkenheid
- Patiënten bij wie de mtDNA NGS en WES niet zijn uitgevoerd
- Patiënten met vermoedelijke mitochondriale ziekte met geïdentificeerde causale variant
- Weigering om de geïnformeerde toestemming voor het onderzoek te ondertekenen
- Onvoldoende hoeveelheid bevroren materiaal of cultuurfalen voor fibroblasten
Studie plan
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
- Observatiemodellen: Cohort
- Tijdsperspectieven: Ander
Cohorten en interventies
Groep / Cohort |
Interventie / Behandeling |
---|---|
Mitochondriale ziekten
analyseren met methodologie van multi-OMICS-integratie zullen we bepalen welke RNA-Seq-gegevens (van spieren of fibroblasten) het meest informatief zijn voor de interpretatie van VUS geïdentificeerd door WES voor patiënten die verdacht worden van mitochondriale myopathie.
|
• Bepaling van de aanwezigheid van specifieke moleculaire kenmerken op RNA-niveau in spieren en fibroblasten van patiënten
|
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
---|---|---|
aantal variaties geïnterpreteerd als verantwoordelijk voor de mitochondriale ziekten
Tijdsspanne: basislijn
|
• Vergelijking van het aantal variaties (splitsingsvariant, expressieniveau) of VUS, geïdentificeerd in WES, geïnterpreteerd als verantwoordelijk voor de ziekte (klasse 4 of 5 varianten) dankzij (i) de RNA-Seq uitgevoerd op een spierbiopsie of (ii) RNA-Seq uitgevoerd vanuit fibroblasten
|
basislijn
|
Secundaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
---|---|---|
RNA bij mitochondriale ziekten
Tijdsspanne: basislijn
|
Patiënten bij wie de RNA-Seq niet kon worden uitgevoerd en reden voor falen
|
basislijn
|
variatie van RNA bij mitochondriale ziekten
Tijdsspanne: basislijn
|
Variaties geïdentificeerd door RNA-Seq, waardoor interpretatie van WES-gegevens mogelijk is (afwijkende splicing, monoallelische uitdrukkingen, enz.)
|
basislijn
|
specifieke moleculaire handtekeningen van mitochondriale ziekten
Tijdsspanne: basislijn
|
Bepaling van de aanwezigheid van specifieke moleculaire kenmerken op RNA-niveau in spieren en fibroblasten van patiënten
|
basislijn
|
Medewerkers en onderzoekers
Onderzoekers
- Hoofdonderzoeker: SYLVIE BANNWARTH, Centre Hospitalier Universitaire de Nice
Studie record data
Bestudeer belangrijke data
Studie start (Werkelijk)
Primaire voltooiing (Werkelijk)
Studie voltooiing (Geschat)
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
Eerst geplaatst (Werkelijk)
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (Werkelijk)
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
Laatst geverifieerd
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden
Andere studie-ID-nummers
- 19-API-01
- 2020-A02651-38 (Register-ID: IDRCB)
Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)
Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?
Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .
Klinische onderzoeken op Mitochondriale ziekten
-
The Champ FoundationChildren's Hospital of Philadelphia; The Cleveland ClinicWervingPearson-syndroom | Single Large Scale Mitochondrial DNA Deletion Syndromes (SLSMDS)Verenigde Staten
-
University of PennsylvaniaVoltooidPatiënten met primaire of secundaire diagnose Code of Intrntl Classification of Diseases, 9th Revision, (ICD-9-CM) 410 (Behalve wanneer het 5e cijfer 2 was)Verenigde Staten
-
SpringWorks Therapeutics, Inc.VerkrijgbaarNeurofibromatose Type 1-geassocieerde plexiforme neurofibromen | Histiocytisch neoplasma | Andere MAP-K Pathway Driven Diseases