Deze pagina is automatisch vertaald en de nauwkeurigheid van de vertaling kan niet worden gegarandeerd. Raadpleeg de Engelse versie voor een brontekst.

MITOMICS: een multi-OMICS-benadering voor de diagnose van mitochondriale ziekten (MITOMICS)

11 januari 2024 bijgewerkt door: Centre Hospitalier Universitaire de Nice

Interesse van Multi-omics (WES / RNA-Seq) benadering om te vechten tegen de diagnostische impasse bij mitochondriale ziekten

MITOMICS heeft tot doel te bepalen welke RNA-Seq-resultaten (van spieren of fibroblasten) het meest informatief zijn voor de interpretatie van VUS geïdentificeerd door WES voor patiënten die verdacht worden van mitochondriale myopathie. Analyse van RNA-Seq- en WES-resultaten zal worden uitgevoerd met een computationele benadering met behulp van een op autoencoder gebaseerde methode

Studie Overzicht

Toestand

Werving

Gedetailleerde beschrijving

Mitochondriale ziekten (MD) zijn zeldzaam, klinisch en genetisch uiterst heterogeen, veroorzaakt door een tekort aan energieproductie via de mitochondriën. Mitochondria zijn afhankelijk van 2 genomen mitochondriaal DNA en nucleair DNA, en veel pathogene varianten die door deze 2 genomen worden gedragen, zijn verantwoordelijk voor mitochondriale ziekten. De diagnostische strategieën voor MD-patiënten zijn aanzienlijk geëvolueerd met de opkomst van Next Generation Sequencing (NGS), die ook de identificatie van het verantwoordelijke gen versnelt. De diagnostische opbrengst blijft echter beperkt en vereist de ontwikkeling van nieuwe benaderingen. Eerdere studies toonden aan dat de combinatie van WES en RNA-Seq de diagnose van MD verbetert, voornamelijk door te helpen bij de interpretatie van geïdentificeerde VUS.

Met het MITOMICS-project zullen we 66 patiënten includeren die verdacht worden van een mitochondriale myopathie (klinisch, histologisch of biochemisch), met een negatief mtDNA en WES NGS in trio. Voor elke patiënt zullen we RNA uit spieren en fibroblasten sequensen. Met behulp van een nieuwe innovatieve methodologie van multi-OMICS-integratie zullen we bepalen welke RNA-Seq-gegevens (van spieren of fibroblasten) het meest informatief zijn voor de interpretatie van VUS geïdentificeerd door WES voor patiënten die verdacht worden van mitochondriale myopathie. De verkregen resultaten zullen de interpretatie van VUS en de identificatie van specifieke moleculaire handtekeningen mogelijk maken.

Studietype

Observationeel

Inschrijving (Geschat)

66

Contacten en locaties

In dit gedeelte vindt u de contactgegevens van degenen die het onderzoek uitvoeren en informatie over waar dit onderzoek wordt uitgevoerd.

Studiecontact

Studie Locaties

      • Angers, Frankrijk
        • Werving
        • CHU Angers
        • Hoofdonderzoeker:
          • Vincent PROCACCIO, MD
      • Brest, Frankrijk
        • Werving
        • C.H.R.U. Brest
        • Hoofdonderzoeker:
          • Pascale Marcorelles, MD
        • Hoofdonderzoeker:
          • Jean Noury, MD
      • Marseille, Frankrijk
        • Werving
        • APHM
        • Hoofdonderzoeker:
          • Shahram ATTARIAN, MD
        • Hoofdonderzoeker:
          • Brigitte Chabrol, MD
      • Nantes, Frankrijk
        • Werving
        • CHU de Nantes
        • Hoofdonderzoeker:
          • Yann Pereon, MD
        • Hoofdonderzoeker:
          • Sandra Mercier, MD
    • Chu de Nice
      • Nice, Chu de Nice, Frankrijk, 06003
        • Werving
        • CHU de Nice
        • Contact:
        • Hoofdonderzoeker:
          • Sylvie BANNWARTH, MD

Deelname Criteria

Onderzoekers zoeken naar mensen die aan een bepaalde beschrijving voldoen, de zogenaamde geschiktheidscriteria. Enkele voorbeelden van deze criteria zijn iemands algemene gezondheidstoestand of eerdere behandelingen.

Geschiktheidscriteria

Leeftijden die in aanmerking komen voor studie

1 jaar en ouder (Kind, Volwassen, Oudere volwassene)

Accepteert gezonde vrijwilligers

Nee

Bemonsteringsmethode

Niet-waarschijnlijkheidssteekproef

Studie Bevolking

Patiënten worden in overleg gezien door de geneticus van de verschillende centra als onderdeel van de gebruikelijke behandeling van hun mitochondriale aandoening.

Beschrijving

Inclusiecriteria:

  • Patiënten die verdacht worden van een mitochondriale ziekte met spiersymptomen (klinisch, histologisch of biochemisch)
  • Patiënten met negatief mtDNA en WES NGS in trio
  • Patiënten met routinematige spier- en huidbiopten beschikbaar
  • Bloedmonsters van ouders en/of familieleden beschikbaar voor segregatieonderzoeken
  • Geïnformeerde toestemming van de studie ondertekend door de patiënt of de wettelijke vertegenwoordigers van de minderjarige patiënt of onder curatele
  • Patiënten aangesloten bij de sociale zekerheid

Uitsluitingscriteria:

  • Patiënten met vermoedelijke mitochondriale ziekte zonder spierbetrokkenheid
  • Patiënten bij wie de mtDNA NGS en WES niet zijn uitgevoerd
  • Patiënten met vermoedelijke mitochondriale ziekte met geïdentificeerde causale variant
  • Weigering om de geïnformeerde toestemming voor het onderzoek te ondertekenen
  • Onvoldoende hoeveelheid bevroren materiaal of cultuurfalen voor fibroblasten

Studie plan

Dit gedeelte bevat details van het studieplan, inclusief hoe de studie is opgezet en wat de studie meet.

Hoe is de studie opgezet?

Ontwerpdetails

  • Observatiemodellen: Cohort
  • Tijdsperspectieven: Ander

Cohorten en interventies

Groep / Cohort
Interventie / Behandeling
Mitochondriale ziekten
analyseren met methodologie van multi-OMICS-integratie zullen we bepalen welke RNA-Seq-gegevens (van spieren of fibroblasten) het meest informatief zijn voor de interpretatie van VUS geïdentificeerd door WES voor patiënten die verdacht worden van mitochondriale myopathie.
• Bepaling van de aanwezigheid van specifieke moleculaire kenmerken op RNA-niveau in spieren en fibroblasten van patiënten

Wat meet het onderzoek?

Primaire uitkomstmaten

Uitkomstmaat
Maatregel Beschrijving
Tijdsspanne
aantal variaties geïnterpreteerd als verantwoordelijk voor de mitochondriale ziekten
Tijdsspanne: basislijn
• Vergelijking van het aantal variaties (splitsingsvariant, expressieniveau) of VUS, geïdentificeerd in WES, geïnterpreteerd als verantwoordelijk voor de ziekte (klasse 4 of 5 varianten) dankzij (i) de RNA-Seq uitgevoerd op een spierbiopsie of (ii) RNA-Seq uitgevoerd vanuit fibroblasten
basislijn

Secundaire uitkomstmaten

Uitkomstmaat
Maatregel Beschrijving
Tijdsspanne
RNA bij mitochondriale ziekten
Tijdsspanne: basislijn
Patiënten bij wie de RNA-Seq niet kon worden uitgevoerd en reden voor falen
basislijn
variatie van RNA bij mitochondriale ziekten
Tijdsspanne: basislijn
Variaties geïdentificeerd door RNA-Seq, waardoor interpretatie van WES-gegevens mogelijk is (afwijkende splicing, monoallelische uitdrukkingen, enz.)
basislijn
specifieke moleculaire handtekeningen van mitochondriale ziekten
Tijdsspanne: basislijn
Bepaling van de aanwezigheid van specifieke moleculaire kenmerken op RNA-niveau in spieren en fibroblasten van patiënten
basislijn

Medewerkers en onderzoekers

Hier vindt u mensen en organisaties die betrokken zijn bij dit onderzoek.

Onderzoekers

  • Hoofdonderzoeker: SYLVIE BANNWARTH, Centre Hospitalier Universitaire de Nice

Studie record data

Deze datums volgen de voortgang van het onderzoeksdossier en de samenvatting van de ingediende resultaten bij ClinicalTrials.gov. Studieverslagen en gerapporteerde resultaten worden beoordeeld door de National Library of Medicine (NLM) om er zeker van te zijn dat ze voldoen aan specifieke kwaliteitscontrolenormen voordat ze op de openbare website worden geplaatst.

Bestudeer belangrijke data

Studie start (Werkelijk)

7 maart 2022

Primaire voltooiing (Werkelijk)

7 maart 2022

Studie voltooiing (Geschat)

7 september 2025

Studieregistratiedata

Eerst ingediend

4 juni 2021

Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria

4 juni 2021

Eerst geplaatst (Werkelijk)

10 juni 2021

Updates van studierecords

Laatste update geplaatst (Werkelijk)

12 januari 2024

Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria

11 januari 2024

Laatst geverifieerd

1 januari 2024

Meer informatie

Termen gerelateerd aan deze studie

Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden

Andere studie-ID-nummers

  • 19-API-01
  • 2020-A02651-38 (Register-ID: IDRCB)

Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)

Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?

NEE

Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten

Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel

Nee

Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct

Nee

Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .

Klinische onderzoeken op Mitochondriale ziekten

3
Abonneren