- ICH GCP
- Registro degli studi clinici negli Stati Uniti
- Sperimentazione clinica NCT04920812
MITOMICS: un approccio multi-OMICS per la diagnosi delle malattie mitocondriali (MITOMICS)
Interesse dell'approccio Multi-omics (WES / RNA-Seq) per combattere lo stallo diagnostico nelle malattie mitocondriali
Panoramica dello studio
Stato
Condizioni
Intervento / Trattamento
Descrizione dettagliata
Le malattie mitocondriali (MD) sono rare, clinicamente e geneticamente estremamente eterogenee, causate da un deficit di produzione di energia attraverso i mitocondri. I mitocondri dipendono dal DNA mitocondriale e dal DNA nucleare di 2 genomi e molte varianti patogene trasportate da questi 2 genomi sono responsabili delle malattie mitocondriali. Le strategie diagnostiche per i pazienti con MD si sono evolute in modo significativo con l'emergere del Next Generation Sequencing (NGS), accelerando anche l'identificazione del gene responsabile. Tuttavia, la resa diagnostica rimane limitata e richiede lo sviluppo di nuovi approcci. Precedenti studi hanno dimostrato che la combinazione WES e RNA-Seq migliora la diagnosi di MD, essenzialmente aiutando nell'interpretazione del VUS identificato.
Con il progetto MITOMICS, includeremo 66 pazienti sospettati di una miopatia mitocondriale (clinica, istologica o biochimica), con un mtDNA negativo e WES NGS in trio. Per ogni paziente verrà sequenziato l'RNA di muscolo e fibroblasti. Utilizzando una nuova metodologia innovativa di integrazione multi-OMICS determineremo quali dati RNA-Seq (da muscolo o fibroblasti) sono i più informativi per l'interpretazione del VUS identificato da WES per i pazienti sospettati di miopatia mitocondriale. I risultati ottenuti consentiranno l'interpretazione di VUS e l'identificazione di firme molecolari specifiche.
Tipo di studio
Iscrizione (Stimato)
Contatti e Sedi
Contatto studio
- Nome: SYLVIE BANNWARTH
- Numero di telefono: 0492034702
- Email: bannwarth.s@chu-nice.fr
Luoghi di studio
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Angers, Francia
- Reclutamento
- Chu Angers
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Investigatore principale:
- Vincent PROCACCIO, MD
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Brest, Francia
- Reclutamento
- C.H.R.U. Brest
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Investigatore principale:
- Pascale Marcorelles, MD
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Investigatore principale:
- Jean Noury, MD
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Marseille, Francia
- Reclutamento
- APHM
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Investigatore principale:
- Shahram ATTARIAN, MD
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Investigatore principale:
- Brigitte Chabrol, MD
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Nantes, Francia
- Reclutamento
- CHU de Nantes
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Investigatore principale:
- Yann Pereon, MD
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Investigatore principale:
- Sandra Mercier, MD
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Chu de Nice
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Nice, Chu de Nice, Francia, 06003
- Reclutamento
- CHU de Nice
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Contatto:
- Numero di telefono: 0492034702
- Email: bannwarth.s@chu-nice.fr
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Investigatore principale:
- Sylvie BANNWARTH, MD
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Criteri di partecipazione
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
Accetta volontari sani
Metodo di campionamento
Popolazione di studio
Descrizione
Criterio di inclusione:
- Pazienti sospettati di una malattia mitocondriale con segni muscolari (clinici, istologici o biochimici)
- Pazienti con mtDNA negativo e WES NGS in trio
- Pazienti con biopsie muscolari e cutanee di routine disponibili
- Prelievi di sangue da genitori e/o parenti disponibili per studi di segregazione
- Consenso informato allo studio firmato dal paziente o dai rappresentanti legali del paziente minorenne o sotto tutela
- Pazienti iscritti alla previdenza sociale
Criteri di esclusione:
- Pazienti con sospetta malattia mitocondriale senza coinvolgimento muscolare
- Pazienti per i quali non sono stati eseguiti il mtDNA NGS e WES
- Pazienti con sospetta malattia mitocondriale con variante causale identificata
- Rifiuto di firmare il consenso informato per lo studio
- Quantità insufficiente di materiale congelato o fallimento della coltura per i fibroblasti
Piano di studio
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
- Modelli osservazionali: Coorte
- Prospettive temporali: Altro
Coorti e interventi
Gruppo / Coorte |
Intervento / Trattamento |
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Malattie mitocondriali
analizzando con la metodologia dell'integrazione multi-OMICS determineremo quali dati RNA-Seq (da muscolo o fibroblasti) sono i più informativi per l'interpretazione del VUS identificato da WES per i pazienti sospettati di miopatia mitocondriale.
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• Determinazione della presenza di firme molecolari specifiche a livello di RNA nei muscoli e nei fibroblasti dei pazienti
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Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
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numero di variazioni interpretate come responsabili delle malattie mitocondriali
Lasso di tempo: linea di base
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• Confronto del numero di varianti (variante di splicing, livello di espressione) o VUS, identificate in WES, interpretate come responsabili della malattia (varianti di classe 4 o 5) grazie (i) all'RNA-Seq effettuato a partire da una biopsia muscolare o (ii) RNA-Seq eseguito da fibroblasti
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linea di base
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Misure di risultato secondarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
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RNA nelle malattie mitocondriali
Lasso di tempo: linea di base
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Pazienti per i quali non è stato possibile eseguire l'RNA-Seq e motivo del fallimento
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linea di base
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variazione dell'RNA nelle malattie mitocondriali
Lasso di tempo: linea di base
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Variazioni identificate da RNA-Seq, che consentono l'interpretazione dei dati WES (splicing aberranti, espressioni monoalleliche, ecc.)
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linea di base
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firme molecolari specifiche delle malattie mitocondriali
Lasso di tempo: linea di base
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Determinazione della presenza di firme molecolari specifiche a livello di RNA nei muscoli e nei fibroblasti dei pazienti
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linea di base
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Collaboratori e investigatori
Investigatori
- Investigatore principale: SYLVIE BANNWARTH, Centre Hospitalier Universitaire de Nice
Studiare le date dei record
Studia le date principali
Inizio studio (Effettivo)
Completamento primario (Effettivo)
Completamento dello studio (Stimato)
Date di iscrizione allo studio
Primo inviato
Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
Primo Inserito (Effettivo)
Aggiornamenti dei record di studio
Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
Ultimo verificato
Maggiori informazioni
Termini relativi a questo studio
Termini MeSH pertinenti aggiuntivi
Altri numeri di identificazione dello studio
- 19-API-01
- 2020-A02651-38 (Identificatore di registro: IDRCB)
Piano per i dati dei singoli partecipanti (IPD)
Hai intenzione di condividere i dati dei singoli partecipanti (IPD)?
Informazioni su farmaci e dispositivi, documenti di studio
Studia un prodotto farmaceutico regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti
Studia un dispositivo regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti
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