Ta strona została przetłumaczona automatycznie i dokładność tłumaczenia nie jest gwarantowana. Proszę odnieść się do angielska wersja za tekst źródłowy.

MITOMICS: podejście Multi-OMICS do diagnozowania chorób mitochondrialnych (MITOMICS)

11 stycznia 2024 zaktualizowane przez: Centre Hospitalier Universitaire de Nice

Zainteresowanie podejściem multiomicznym (WES / RNA-Seq) w walce z impasem diagnostycznym w chorobach mitochondrialnych

MITOMICS ma na celu określenie, które wyniki RNA-Seq (z mięśni lub fibroblastów) są najbardziej pouczające dla interpretacji VUS zidentyfikowanego przez WES u pacjentów z podejrzeniem miopatii mitochondrialnej. Analiza wyników RNA-Seq i WES zostanie przeprowadzona metodą obliczeniową z wykorzystaniem metody opartej na autoenkoderze

Przegląd badań

Status

Rekrutacyjny

Szczegółowy opis

Choroby mitochondrialne (MD) są rzadkie, klinicznie i genetycznie niezwykle heterogenne, spowodowane deficytem produkcji energii przez mitochondria. Mitochondria są zależne od 2 genomów mitochondrialnego DNA i jądrowego DNA, a wiele patogennych wariantów przenoszonych przez te 2 genomy jest odpowiedzialnych za choroby mitochondrialne. Strategie diagnostyczne dla pacjentów z MD znacznie się rozwinęły wraz z pojawieniem się sekwencjonowania nowej generacji (NGS), które również przyspieszyło identyfikację odpowiedzialnego genu. Jednak wydajność diagnostyczna pozostaje ograniczona i wymaga opracowania nowych podejść. Poprzednie badania wykazały, że kombinacja WES i RNA-Seq poprawia diagnozę MD, zasadniczo pomagając w interpretacji zidentyfikowanego VUS.

Do projektu MITOMICS włączymy 66 pacjentów z podejrzeniem miopatii mitochondrialnej (klinicznej, histologicznej lub biochemicznej), z ujemnym wynikiem mtDNA i WES NGS w trio. Dla każdego pacjenta zsekwencjonujemy RNA z mięśni i fibroblastów. Korzystając z nowej, innowacyjnej metodologii integracji multi-OMICS, ustalimy, które dane RNA-Seq (z mięśni lub fibroblastów) są najbardziej pouczające dla interpretacji VUS zidentyfikowanego przez WES u pacjentów z podejrzeniem miopatii mitochondrialnej. Uzyskane wyniki pozwolą na interpretację VUS i identyfikację specyficznych sygnatur molekularnych.

Typ studiów

Obserwacyjny

Zapisy (Szacowany)

66

Kontakty i lokalizacje

Ta sekcja zawiera dane kontaktowe osób prowadzących badanie oraz informacje o tym, gdzie badanie jest przeprowadzane.

Kontakt w sprawie studiów

Lokalizacje studiów

      • Angers, Francja
        • Rekrutacyjny
        • Chu Angers
        • Główny śledczy:
          • Vincent PROCACCIO, MD
      • Brest, Francja
        • Rekrutacyjny
        • C.H.R.U. Brest
        • Główny śledczy:
          • Pascale Marcorelles, MD
        • Główny śledczy:
          • Jean Noury, MD
      • Marseille, Francja
        • Rekrutacyjny
        • APHM
        • Główny śledczy:
          • Shahram ATTARIAN, MD
        • Główny śledczy:
          • Brigitte Chabrol, MD
      • Nantes, Francja
        • Rekrutacyjny
        • CHU de Nantes
        • Główny śledczy:
          • Yann Pereon, MD
        • Główny śledczy:
          • Sandra Mercier, MD
    • Chu de Nice
      • Nice, Chu de Nice, Francja, 06003
        • Rekrutacyjny
        • CHU de Nice
        • Kontakt:
        • Główny śledczy:
          • Sylvie BANNWARTH, MD

Kryteria uczestnictwa

Badacze szukają osób, które pasują do określonego opisu, zwanego kryteriami kwalifikacyjnymi. Niektóre przykłady tych kryteriów to ogólny stan zdrowia danej osoby lub wcześniejsze leczenie.

Kryteria kwalifikacji

Wiek uprawniający do nauki

1 rok i starsze (Dziecko, Dorosły, Starszy dorosły)

Akceptuje zdrowych ochotników

Nie

Metoda próbkowania

Próbka bez prawdopodobieństwa

Badana populacja

Pacjenci są konsultowani przez lekarzy genetycznych z różnych ośrodków w ramach zwykłego leczenia ich choroby mitochondrialnej.

Opis

Kryteria przyjęcia:

  • Pacjenci z podejrzeniem choroby mitochondrialnej z objawami mięśniowymi (klinicznymi, histologicznymi lub biochemicznymi)
  • Pacjenci z ujemnym mtDNA i WES NGS w trio
  • Dostępni pacjenci z rutynowymi biopsjami mięśni i skóry
  • Próbki krwi od rodziców i/lub krewnych dostępne do badań segregacyjnych
  • Świadoma zgoda na badanie podpisana przez pacjenta lub przedstawicieli prawnych małoletniego pacjenta lub opiekuna
  • Pacjenci zrzeszeni w ubezpieczeniach społecznych

Kryteria wyłączenia:

  • Pacjenci z podejrzeniem choroby mitochondrialnej bez zajęcia mięśni
  • Pacjenci, u których nie wykonano mtDNA NGS i WES
  • Pacjenci z podejrzeniem choroby mitochondrialnej ze zidentyfikowanym wariantem przyczynowym
  • Odmowa podpisania świadomej zgody na badanie
  • Niewystarczająca ilość zamrożonego materiału lub niepowodzenie hodowli fibroblastów

Plan studiów

Ta sekcja zawiera szczegółowe informacje na temat planu badania, w tym sposób zaprojektowania badania i jego pomiary.

Jak projektuje się badanie?

Szczegóły projektu

  • Modele obserwacyjne: Kohorta
  • Perspektywy czasowe: Inny

Kohorty i interwencje

Grupa / Kohorta
Interwencja / Leczenie
Choroby mitochondrialne
analizując metodologię integracji multi-OMICS ustalimy, które dane RNA-Seq (z mięśnia lub fibroblastów) są najbardziej pouczające dla interpretacji VUS zidentyfikowanego przez WES u pacjentów z podejrzeniem miopatii mitochondrialnej.
• Oznaczanie obecności specyficznych sygnatur molekularnych na poziomie RNA w mięśniach i fibroblastach pacjentów

Co mierzy badanie?

Podstawowe miary wyniku

Miara wyniku
Opis środka
Ramy czasowe
liczbę odmian interpretowanych jako odpowiedzialne za choroby mitochondrialne
Ramy czasowe: linia bazowa
• Porównanie liczby wariacji (wariant splicingu, poziom ekspresji) lub VUS, zidentyfikowanych w WES, interpretowanych jako odpowiedzialne za chorobę (warianty klasy 4 lub 5) dzięki (i) RNA-Seq przeprowadzonemu z biopsji mięśnia lub (ii) RNA-Seq przeprowadzone z fibroblastów
linia bazowa

Miary wyników drugorzędnych

Miara wyniku
Opis środka
Ramy czasowe
RNA w chorobach mitochondrialnych
Ramy czasowe: linia bazowa
Pacjenci, u których nie można było wykonać RNA-Seq i przyczyna niepowodzenia
linia bazowa
zmienność RNA w chorobach mitochondrialnych
Ramy czasowe: linia bazowa
Odmiany zidentyfikowane przez RNA-Seq, umożliwiające interpretację danych WES (nieprawidłowe splicingi, ekspresje monoalleliczne itp.)
linia bazowa
specyficzne sygnatury molekularne chorób mitochondrialnych
Ramy czasowe: linia bazowa
Oznaczanie obecności specyficznych sygnatur molekularnych na poziomie RNA w mięśniach i fibroblastach pacjentów
linia bazowa

Współpracownicy i badacze

Tutaj znajdziesz osoby i organizacje zaangażowane w to badanie.

Śledczy

  • Główny śledczy: SYLVIE BANNWARTH, Centre Hospitalier Universitaire de Nice

Daty zapisu na studia

Daty te śledzą postęp w przesyłaniu rekordów badań i podsumowań wyników do ClinicalTrials.gov. Zapisy badań i zgłoszone wyniki są przeglądane przez National Library of Medicine (NLM), aby upewnić się, że spełniają określone standardy kontroli jakości, zanim zostaną opublikowane na publicznej stronie internetowej.

Główne daty studiów

Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)

7 marca 2022

Zakończenie podstawowe (Rzeczywisty)

7 marca 2022

Ukończenie studiów (Szacowany)

7 września 2025

Daty rejestracji na studia

Pierwszy przesłany

4 czerwca 2021

Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości

4 czerwca 2021

Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)

10 czerwca 2021

Aktualizacje rekordów badań

Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)

12 stycznia 2024

Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości

11 stycznia 2024

Ostatnia weryfikacja

1 stycznia 2024

Więcej informacji

Terminy związane z tym badaniem

Dodatkowe istotne warunki MeSH

Inne numery identyfikacyjne badania

  • 19-API-01
  • 2020-A02651-38 (Identyfikator rejestru: IDRCB)

Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)

Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?

NIE

Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze

Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA

Nie

Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA

Nie

Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .

3
Subskrybuj