- ICH GCP
- Rejestr badań klinicznych w USA
- Badanie kliniczne NCT04920812
MITOMICS: podejście Multi-OMICS do diagnozowania chorób mitochondrialnych (MITOMICS)
Zainteresowanie podejściem multiomicznym (WES / RNA-Seq) w walce z impasem diagnostycznym w chorobach mitochondrialnych
Przegląd badań
Status
Warunki
Interwencja / Leczenie
Szczegółowy opis
Choroby mitochondrialne (MD) są rzadkie, klinicznie i genetycznie niezwykle heterogenne, spowodowane deficytem produkcji energii przez mitochondria. Mitochondria są zależne od 2 genomów mitochondrialnego DNA i jądrowego DNA, a wiele patogennych wariantów przenoszonych przez te 2 genomy jest odpowiedzialnych za choroby mitochondrialne. Strategie diagnostyczne dla pacjentów z MD znacznie się rozwinęły wraz z pojawieniem się sekwencjonowania nowej generacji (NGS), które również przyspieszyło identyfikację odpowiedzialnego genu. Jednak wydajność diagnostyczna pozostaje ograniczona i wymaga opracowania nowych podejść. Poprzednie badania wykazały, że kombinacja WES i RNA-Seq poprawia diagnozę MD, zasadniczo pomagając w interpretacji zidentyfikowanego VUS.
Do projektu MITOMICS włączymy 66 pacjentów z podejrzeniem miopatii mitochondrialnej (klinicznej, histologicznej lub biochemicznej), z ujemnym wynikiem mtDNA i WES NGS w trio. Dla każdego pacjenta zsekwencjonujemy RNA z mięśni i fibroblastów. Korzystając z nowej, innowacyjnej metodologii integracji multi-OMICS, ustalimy, które dane RNA-Seq (z mięśni lub fibroblastów) są najbardziej pouczające dla interpretacji VUS zidentyfikowanego przez WES u pacjentów z podejrzeniem miopatii mitochondrialnej. Uzyskane wyniki pozwolą na interpretację VUS i identyfikację specyficznych sygnatur molekularnych.
Typ studiów
Zapisy (Szacowany)
Kontakty i lokalizacje
Kontakt w sprawie studiów
- Nazwa: SYLVIE BANNWARTH
- Numer telefonu: 0492034702
- E-mail: bannwarth.s@chu-nice.fr
Lokalizacje studiów
-
-
-
Angers, Francja
- Rekrutacyjny
- Chu Angers
-
Główny śledczy:
- Vincent PROCACCIO, MD
-
Brest, Francja
- Rekrutacyjny
- C.H.R.U. Brest
-
Główny śledczy:
- Pascale Marcorelles, MD
-
Główny śledczy:
- Jean Noury, MD
-
Marseille, Francja
- Rekrutacyjny
- APHM
-
Główny śledczy:
- Shahram ATTARIAN, MD
-
Główny śledczy:
- Brigitte Chabrol, MD
-
Nantes, Francja
- Rekrutacyjny
- CHU de Nantes
-
Główny śledczy:
- Yann Pereon, MD
-
Główny śledczy:
- Sandra Mercier, MD
-
-
Chu de Nice
-
Nice, Chu de Nice, Francja, 06003
- Rekrutacyjny
- CHU de Nice
-
Kontakt:
- Numer telefonu: 0492034702
- E-mail: bannwarth.s@chu-nice.fr
-
Główny śledczy:
- Sylvie BANNWARTH, MD
-
-
Kryteria uczestnictwa
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
Akceptuje zdrowych ochotników
Metoda próbkowania
Badana populacja
Opis
Kryteria przyjęcia:
- Pacjenci z podejrzeniem choroby mitochondrialnej z objawami mięśniowymi (klinicznymi, histologicznymi lub biochemicznymi)
- Pacjenci z ujemnym mtDNA i WES NGS w trio
- Dostępni pacjenci z rutynowymi biopsjami mięśni i skóry
- Próbki krwi od rodziców i/lub krewnych dostępne do badań segregacyjnych
- Świadoma zgoda na badanie podpisana przez pacjenta lub przedstawicieli prawnych małoletniego pacjenta lub opiekuna
- Pacjenci zrzeszeni w ubezpieczeniach społecznych
Kryteria wyłączenia:
- Pacjenci z podejrzeniem choroby mitochondrialnej bez zajęcia mięśni
- Pacjenci, u których nie wykonano mtDNA NGS i WES
- Pacjenci z podejrzeniem choroby mitochondrialnej ze zidentyfikowanym wariantem przyczynowym
- Odmowa podpisania świadomej zgody na badanie
- Niewystarczająca ilość zamrożonego materiału lub niepowodzenie hodowli fibroblastów
Plan studiów
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
- Modele obserwacyjne: Kohorta
- Perspektywy czasowe: Inny
Kohorty i interwencje
Grupa / Kohorta |
Interwencja / Leczenie |
---|---|
Choroby mitochondrialne
analizując metodologię integracji multi-OMICS ustalimy, które dane RNA-Seq (z mięśnia lub fibroblastów) są najbardziej pouczające dla interpretacji VUS zidentyfikowanego przez WES u pacjentów z podejrzeniem miopatii mitochondrialnej.
|
• Oznaczanie obecności specyficznych sygnatur molekularnych na poziomie RNA w mięśniach i fibroblastach pacjentów
|
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
---|---|---|
liczbę odmian interpretowanych jako odpowiedzialne za choroby mitochondrialne
Ramy czasowe: linia bazowa
|
• Porównanie liczby wariacji (wariant splicingu, poziom ekspresji) lub VUS, zidentyfikowanych w WES, interpretowanych jako odpowiedzialne za chorobę (warianty klasy 4 lub 5) dzięki (i) RNA-Seq przeprowadzonemu z biopsji mięśnia lub (ii) RNA-Seq przeprowadzone z fibroblastów
|
linia bazowa
|
Miary wyników drugorzędnych
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
---|---|---|
RNA w chorobach mitochondrialnych
Ramy czasowe: linia bazowa
|
Pacjenci, u których nie można było wykonać RNA-Seq i przyczyna niepowodzenia
|
linia bazowa
|
zmienność RNA w chorobach mitochondrialnych
Ramy czasowe: linia bazowa
|
Odmiany zidentyfikowane przez RNA-Seq, umożliwiające interpretację danych WES (nieprawidłowe splicingi, ekspresje monoalleliczne itp.)
|
linia bazowa
|
specyficzne sygnatury molekularne chorób mitochondrialnych
Ramy czasowe: linia bazowa
|
Oznaczanie obecności specyficznych sygnatur molekularnych na poziomie RNA w mięśniach i fibroblastach pacjentów
|
linia bazowa
|
Współpracownicy i badacze
Śledczy
- Główny śledczy: SYLVIE BANNWARTH, Centre Hospitalier Universitaire de Nice
Daty zapisu na studia
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
Zakończenie podstawowe (Rzeczywisty)
Ukończenie studiów (Szacowany)
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia weryfikacja
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Dodatkowe istotne warunki MeSH
Inne numery identyfikacyjne badania
- 19-API-01
- 2020-A02651-38 (Identyfikator rejestru: IDRCB)
Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)
Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .