Viral belastningsanalyse av SARS-CoV-2-viruset i nese versus munnsteder

Eksperimentell studie på avidentifiserte, biologiske prøver (nese- og bukkalpinne).

Studien vil bli utført på pasienter innlagt på IRCCS Sacro Cuore Don Calabria sykehus eller helsepersonell eller deres familiemedlemmer, som testet positivt for SARS-CoV-2 ved enten en molekylær eller antigentest, utført på nasofaryngeal vattpinne, i henhold til gjeldende diagnostikk .

Blant familiemedlemmene vil også barn >4 år være inkludert. Årsaken til å inkludere barn og unge forsøkspersoner er basert på data som indikerer at de ser ut til å være svært følsomme for Omicron-infeksjon og at deres vaksinasjonsstatus kan påvirke virusmengden. Nese- og munnpinnen er dårlig invasiv, og de kan tolereres godt også av barn.

Innen 7 dager fra diagnosen vil forsøkspersonene bli bedt om å ta prøver av ytterligere to prøver, dvs. neseprøve og munnprøve, som vil bli testet for tilstedeværelse av SARS-CoV-2 RNA. Resultater, uttrykt som syklusterskel, vil deretter bli sammenlignet for å analysere viral belastning fra de to forskjellige stedene.

Dessuten vil en aliquot bli retro-transkribert til cDNA og sekvensert ved hjelp av Next Generation Sequencing (NGS) for å oppnå virusets hele genomsekvens eller evaluert ved RT-PCR for variantbestemmelse.