Viral belastningsanalys av SARS-CoV-2-viruset på näsa kontra munplatser

Experimentell studie på avidentifierade, biologiska prover (nasal och buckal pinne).

Studien kommer att utföras på patienter som är inlagda på IRCCS Sacro Cuore Don Calabria-sjukhuset eller sjukvårdspersonal eller deras familjemedlemmar, som testade positivt för SARS-CoV-2 genom antingen ett molekylärt eller antigentest, utfört på nasofaryngeal pinne, enligt aktuell diagnostik .

Bland familjemedlemmarna kommer även barn >4 år att inkluderas. Anledningen till att barn och unga försökspersoner inkluderas är baserat på data som tyder på att de verkar vara mycket känsliga för Omicron-infektion och att deras vaccinationsstatus kan påverka virusmängden. Näsan och munpinnen är dåligt invasiva och de kan tolereras väl även av barn.

Inom 7 dagar från diagnos kommer försökspersonerna att uppmanas att ta prover på ytterligare två prover, dvs. nasal pinnprover och munpinne, som kommer att testas för närvaron av SARS-CoV-2 RNA. Resultaten, uttryckta som cykeltröskel, kommer sedan att jämföras för att analysera virusmängder från de två olika platserna.

Dessutom kommer en alikvot att retrotranskriberas till cDNA och sekvenseras med Next Generation Sequencing (NGS) för att erhålla virusets hela genomsekvens eller utvärderas med RT-PCR för variantbestämning.