Analisi della carica virale del virus SARS-CoV-2 nei siti del naso rispetto alla bocca

Studio sperimentale su campioni biologici anonimizzati (tampone nasale e buccale).

Lo studio sarà condotto su pazienti ricoverati presso IRCCS Ospedale Sacro Cuore Don Calabria o operatori sanitari o loro familiari, risultati positivi al SARS-CoV-2 mediante test molecolare o antigenico, eseguito su tampone nasofaringeo, secondo la diagnostica attuale .

Tra i familiari saranno inclusi anche i bambini >4 anni. La ragione per includere bambini e soggetti giovani si basa su dati che indicano che sembrano essere altamente sensibili all'infezione da Omicron e che il loro stato di vaccinazione potrebbe influenzare la carica virale. I tamponi nasali e orali sono scarsamente invasivi e potrebbero essere ben tollerati anche dai bambini.

Entro 7 giorni dalla diagnosi, ai soggetti verrà richiesto di campionare altri due campioni, ovvero tampone nasale e tampone orale, che verranno testati per la presenza di SARS-CoV-2 RNA. I risultati, espressi come soglia del ciclo, saranno poi confrontati per analizzare le cariche virali dai due diversi siti.

Inoltre, un'aliquota sarà retrotrascritta in cDNA e sequenziata mediante Next Generation Sequencing (NGS) per ottenere l'intera sequenza del genoma del virus o valutata mediante RT-PCR per la determinazione della variante.