Sanger Human Cell Atlasing Project (HCA)

Tidligere metoder for å kvantifisere molekylære tilstander av celler inkluderte mikroarray og standard RNA-seq-analyse på et vevssnitt (RNA-seq er en teknikk for å se på aktiviteten til alle genene i en celle). Disse metodene estimerer aktiviteten til et gitt gen ved å beregne et gjennomsnitt av signalet fra millioner av celler. Gitt heterogeniteten til cellepopulasjoner (dvs. hvor ensartede de er), overser måling av middelverdiene til signaler de interne interaksjonene og forskjellene i en cellepopulasjon som kan være avgjørende for å opprettholde normal vevsfunksjon og lette sykdomsprogresjon.

Sanger Human Cell Atlasing-prosjektet vil ta i bruk ulike genomiske tilnærminger som vil gi genom-omfattende informasjon i et enkelt eksperiment. Dette prosjektet tar sikte på å oppskalere enkeltcelle-genomikken og høykapasitets svært multiplekse romlige genekspresjonsprofileringstilnærminger. Sammen med kraftige beregningsmetoder vil denne strategien produsere et omfattende og systematisk referansekart over menneskelige celler, og gi en grunnleggende blåkopi av celletilstander for både grunnleggende biologisk forskning og klinisk praksis.