Sanger Human Cell Atlasing-project (HCA)

Eerdere methoden voor het kwantificeren van de moleculaire toestanden van cellen omvatten microarray en standaard RNA-seq-analyse op een weefselsectie (RNA-seq is een techniek om naar de activiteit van alle genen in een cel te kijken). Deze methoden schatten de activiteit van een bepaald gen door het signaal van miljoenen cellen te middelen. Gegeven de heterogeniteit van celpopulaties (dat wil zeggen hoe uniform ze zijn), gaat het meten van de gemiddelde waarden van signalen voorbij aan de interne interacties en verschillen binnen een celpopulatie die cruciaal kunnen zijn voor het behouden van de normale weefselfunctie en het vergemakkelijken van ziekteprogressie.

Het Sanger Human Cell Atlasing-project zal verschillende genomische benaderingen toepassen die in één experiment genoombrede informatie zullen opleveren. Dit project heeft tot doel de single-cell genomica en high-throughput, zeer multiplex ruimtelijke genexpressieprofileringsbenaderingen op te schalen. In combinatie met krachtige computationele methoden zal deze strategie een alomvattende en systematische referentiekaart van menselijke cellen opleveren, die een fundamentele blauwdruk van celtoestanden oplevert voor zowel fundamenteel biologisch onderzoek als de klinische praktijk.