Sanger Human Cell Atlasing Project (HCA)

Tidigare metoder för att kvantifiera molekylära tillstånd hos celler inkluderade mikroarray och standard RNA-seq-analys på ett vävnadssnitt (RNA-seq är en teknik för att titta på aktiviteten hos alla gener i en cell). Dessa metoder uppskattar aktiviteten av en given gen genom att beräkna ett medelvärde av signalen från miljontals celler. Med tanke på heterogeniteten hos cellpopulationer (dvs hur enhetliga de är), förbiser mätning av medelvärdena för signaler de interna interaktionerna och skillnaderna inom en cellpopulation som kan vara avgörande för att bibehålla normal vävnadsfunktion och underlätta sjukdomsprogression.

Sanger Human Cell Atlasing-projektet kommer att anta olika genomiska tillvägagångssätt som kommer att tillhandahålla genomomfattande information i ett enda experiment. Detta projekt syftar till att skala upp enkelcellsgenomiken och högkapacitets- och höggradigt multiplexa tillvägagångssätt för rumslig genuttrycksprofilering. Tillsammans med kraftfulla beräkningsmetoder kommer denna strategi att producera en omfattande och systematisk referenskarta över mänskliga celler, vilket ger en grundläggande ritning av celltillstånd för både grundläggande biologisk forskning och klinisk praxis.