Utvikling av en plattform for klinisk implementering av presisjons onkologi i de sentrale sørlige regionene i Italia (Coesit)

Prosjektet vil begynne med en teknologisk oppgradering av laboratoriene og standardiseringen av sekvenseringsprosedyrer og bioinformatikkanalyser, som involverer alle institusjoner som deltar i initiativet. Deretter vil det opprettes en delt database som integrerer sekvenseringsdata og klinikopatologisk informasjon. Dette vil muliggjøre forskningsprosjekter som tar sikte på å utvide kunnskapen om de genetiske endringene av svulster hos pasienter fra sentrale sørlige Italia og identifisere prognostiske og prediktive biomarkører som støtter implementering av presisjon og personlig medisin.

Forbedring av genomiske laboratorier, deling av analytiske prosedyrer og bioinformatikkprotokoller, og utviklingen av en felles database med sekvensering og klinikopatologiske data vil tjene som essensielle verktøy for å utdype spesifikk kunnskap om de genomiske egenskapene til svulster hos pasienter fra Sør -Italia. Dette vil lette klinisk implementering av presisjon og personlig medisin basert på genomisk analyse.

Studien er multisentrisk og observasjonell. Arten av dataene som er inkludert vil være både retrospektiv og potensiell, som beskrevet nedenfor:

1. Prospektiv innsamling av klinikkopatologisk informasjon, inkludert livsstilsfaktorer og eksponering for miljømessige og yrkesmessige kreftfremkallende stoffer, samt CGP (omfattende genomisk profilering) data oppnådd gjennom målrettede sekvenseringsteknikker. Disse dataene vil bli generert innen klinisk praksis eller lokale genomiske screeningprogrammer, med pasientens informerte samtykke.
2. Analyse av korrelasjonen mellom tumor heterogenitet-spesifikt genomiske biomarkører og terapi-respons hos alle påmeldte pasienter som ikke reagerte på målrettet terapi administrert i henhold til gjeldende kliniske retningslinjer.
3. Retrospektiv innsamling av klinikkopatologisk informasjon og CGP -data fra caseserier tilgjengelig i COESIT Center -biobanker for identifisering av nye biomarkører. Spesifikke understudier vil bli foreslått med endringer i hovedstudien beskrevet her.
4. Innsamling av informasjon om kimlinjeforandringer hos personer som er utsatt for bryst- og gastrisk kreft, som allerede er analysert innenfor godkjente protokoller, med motivets informerte samtykke for datainneslutning i Coesit -plattformen.