Composition and Collection Feasibility of Gut Microbiota in Children With and Without Obesity
Przegląd badań
Status
Status
Warunki
Warunki
Typ studiów
Typ studiów
Zapisy (Oczekiwany)
Zapisy
Kontakty i lokalizacje
Lokalizacje studiów
-
-
Illinois
-
Peoria, Illinois, Stany Zjednoczone, 61637
- University of Illinois College of Medicine at Peoria
-
-
Kryteria uczestnictwa
Kryteria kwalifikacji
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
Akceptuje zdrowych ochotników
Płeć kwalifikująca się do nauki
Metoda próbkowania
Badana populacja
Opis
Inclusion Criteria:
1) patients aged 5-12 years
Exclusion Criteria:
- patient who have received either oral or parenteral antibiotics in the last 3 months
- patients who have a diagnosed immunodeficiency
- patients who are on medications that modulate the immune system including systemic prednisone and biologics
- patients who have a gastrointestinal condition which is known to alter the gut flora such as inflammatory bowel disease, chronic diarrhea, celiac disease and eosinophilic gastroenteritis diseases
- patients who have taken proton pump inhibitors in the last 3 months
- patients who have taken probiotics in the last 6 months.
Plan studiów
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
Liczba grup / kohort
Kohorty i interwencje
Grupa / KohortaGrupa / Kohorta |
|---|
|
Healthy Weight
Participants with BMI < 95th percentile
|
|
Obese
Participants with BMI > or = 95th percentile
|
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Microbiota Composition
Ramy czasowe: Over 2 years
|
High-throughput sequencing targeting the 16S rRNA gene will be used to detect and identify bacteria in fecal samples.
DNA extraction and library preparation will be performed at the University of Illinois College of Medicine at Peoria, and libraries will be subjected to 16S rDNA sequencing (approximately 10k reads will be obtained per sample) on a MiSeq instrument.
Using 10k reads per sample provides stable patterns for human stool microbiota.
The 16S data will provide information about the presence and abundance of bacteria, and will be analyzed with Qiime, an open source bioinformatics package.
|
Over 2 years
|
|
Short Chain Fatty Acid Content
Ramy czasowe: Over 2 years
|
Gas Chromatography will be used to measure SCFA amounts, specifically acetate, butyrate, proprionate.
Preserved aliquot samples will be analyzed on Agilent GC/MS system (6890GC/5973 MS with 7683B autosampler) with gas chromatography performed on a ZB-WAX (30 m×0.32 mm I.D., 0.25um film thickness) capillary column (Phenomenex, Torrance, CA).
The inlet and MSD interface temperatures will both be 250°C, with the ion source temperature adjusted to 230°C.
The helium carrier gas will be kept at a constant flow rate of 3.2 ml/min.
The temperature program is: initial 2-min isothermal heating at 80°C, followed by an oven temperature increase of 20°C/min to 110°C, then 10°C/min to 130°C, and then 35°C/min to 255°C.
Mass spectra will again be recorded in the m/z 50-300 scanning range.
|
Over 2 years
|
|
Specimen Quality
Ramy czasowe: Over 2 years
|
Technical factors, which may affect microbial compositions (such as times of specimen collection, home freezer storage removal, shipping, and arrival) will be recorded as independent variables.
To estimate and minimize the effect of technical variables, principal component analysis will be used and the study will follow the International Human Microbiome Standards
|
Over 2 years
|
Współpracownicy i badacze
Sponsor
Sponsor
Daty zapisu na studia
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
Rozpoczęcie studiów
Zakończenie podstawowe (Rzeczywisty)
Zakończenie podstawowe
Ukończenie studiów (Oczekiwany)
Ukończenie studiów
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)
Pierwszy wysłany
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
Ostatnia wysłana aktualizacja
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia weryfikacja
Ostatnia weryfikacja
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Dodatkowe istotne warunki MeSH
Inne numery identyfikacyjne badania
Inne numery identyfikacyjne badania
- 1001223
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .