Composition and Collection Feasibility of Gut Microbiota in Children With and Without Obesity
Studieöversikt
Status
Status
Betingelser
Betingelser
Studietyp
Studietyp
Inskrivning (Förväntat)
Inskrivning
Kontakter och platser
Studieorter
-
-
Illinois
-
Peoria, Illinois, Förenta staterna, 61637
- University of Illinois College of Medicine at Peoria
-
-
Deltagandekriterier
Urvalskriterier
Urvalskriterier
Åldrar som är berättigade till studier
Tar emot friska volontärer
Kön som är behöriga för studier
Testmetod
Studera befolkning
Beskrivning
Inclusion Criteria:
1) patients aged 5-12 years
Exclusion Criteria:
- patient who have received either oral or parenteral antibiotics in the last 3 months
- patients who have a diagnosed immunodeficiency
- patients who are on medications that modulate the immune system including systemic prednisone and biologics
- patients who have a gastrointestinal condition which is known to alter the gut flora such as inflammatory bowel disease, chronic diarrhea, celiac disease and eosinophilic gastroenteritis diseases
- patients who have taken proton pump inhibitors in the last 3 months
- patients who have taken probiotics in the last 6 months.
Studieplan
Hur är studien utformad?
Designdetaljer
Antal grupper/kohorter
Kohorter och interventioner
Grupp / KohortGrupp / Kohort |
|---|
|
Healthy Weight
Participants with BMI < 95th percentile
|
|
Obese
Participants with BMI > or = 95th percentile
|
Vad mäter studien?
Primära resultatmått
Primära resultatmått
Resultatmått |
Åtgärdsbeskrivning |
Tidsram |
|---|---|---|
|
Microbiota Composition
Tidsram: Over 2 years
|
High-throughput sequencing targeting the 16S rRNA gene will be used to detect and identify bacteria in fecal samples.
DNA extraction and library preparation will be performed at the University of Illinois College of Medicine at Peoria, and libraries will be subjected to 16S rDNA sequencing (approximately 10k reads will be obtained per sample) on a MiSeq instrument.
Using 10k reads per sample provides stable patterns for human stool microbiota.
The 16S data will provide information about the presence and abundance of bacteria, and will be analyzed with Qiime, an open source bioinformatics package.
|
Over 2 years
|
|
Short Chain Fatty Acid Content
Tidsram: Over 2 years
|
Gas Chromatography will be used to measure SCFA amounts, specifically acetate, butyrate, proprionate.
Preserved aliquot samples will be analyzed on Agilent GC/MS system (6890GC/5973 MS with 7683B autosampler) with gas chromatography performed on a ZB-WAX (30 m×0.32 mm I.D., 0.25um film thickness) capillary column (Phenomenex, Torrance, CA).
The inlet and MSD interface temperatures will both be 250°C, with the ion source temperature adjusted to 230°C.
The helium carrier gas will be kept at a constant flow rate of 3.2 ml/min.
The temperature program is: initial 2-min isothermal heating at 80°C, followed by an oven temperature increase of 20°C/min to 110°C, then 10°C/min to 130°C, and then 35°C/min to 255°C.
Mass spectra will again be recorded in the m/z 50-300 scanning range.
|
Over 2 years
|
|
Specimen Quality
Tidsram: Over 2 years
|
Technical factors, which may affect microbial compositions (such as times of specimen collection, home freezer storage removal, shipping, and arrival) will be recorded as independent variables.
To estimate and minimize the effect of technical variables, principal component analysis will be used and the study will follow the International Human Microbiome Standards
|
Over 2 years
|
Samarbetspartners och utredare
Sponsor
Sponsor
Studieavstämningsdatum
Studera stora datum
Studiestart (Faktisk)
Studiestart
Primärt slutförande (Faktisk)
Primärt slutförande
Avslutad studie (Förväntat)
Avslutad studie
Studieregistreringsdatum
Först inskickad
Först inskickad
Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna
Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna
Första postat (Faktisk)
Första postat
Uppdateringar av studier
Senaste uppdatering publicerad (Faktisk)
Senaste uppdatering publicerad
Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna
Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna
Senast verifierad
Senast verifierad
Mer information
Termer relaterade till denna studie
Ytterligare relevanta MeSH-villkor
Andra studie-ID-nummer
Andra studie-ID-nummer
- 1001223
Läkemedels- och apparatinformation, studiedokument
Studerar en amerikansk FDA-reglerad läkemedelsprodukt
Studerar en amerikansk FDA-reglerad produktprodukt
Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .