Badanie medycyny precyzyjnej
Platforma medycyny spersonalizowanej i precyzyjnej opartej na sekwencjonowaniu nowotworów w leczeniu szpiczaka mnogiego
Przegląd badań
Status
Status
Warunki
Warunki
Typ studiów
Typ studiów
Zapisy (Rzeczywisty)
Zapisy
Kontakty i lokalizacje
Kontakt w sprawie studiów
Kontakt w sprawie studiów
- Nazwa: Katherine Vandris
- E-mail: katherine.vandris@mssm.edu
Kopia zapasowa kontaktu do badania
- Nazwa: Cesar Rodriguez Valdes, MD, PhD
- Numer telefonu: (212) 241-7873
- E-mail: Cesar.Rodriguez@mssm.edu
Lokalizacje studiów
-
-
New York
-
New York, New York, Stany Zjednoczone, 10029
- Mount Sinai Health System
-
-
Kryteria uczestnictwa
Kryteria kwalifikacji
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
- Dorosły
- Starszy dorosły
Akceptuje zdrowych ochotników
Metoda próbkowania
Badana populacja
Opis
Kryteria przyjęcia:
- W momencie rejestracji pacjenci muszą mieć ukończone 18 lat.
- Uczestnik musi mieć ustaloną diagnozę nawrotu szpiczaka mnogiego w oparciu o kryteria IMWG, chcieć uczestniczyć i być w stanie wyrazić zgodę
- Uczestnik musi mieć lekarza prowadzącego, który wyrazi zgodę na udział w badaniu
- W ramach standardowego leczenia uczestnik zostanie poddany biopsji szpiku kostnego lub biopsji guza.
- Pacjenci muszą wyrazić chęć udziału w tym badaniu i móc podpisać świadomą zgodę.
- Uczestnicy nie biorą udziału w żadnym interwencyjnym badaniu klinicznym z zastosowaniem terapii systemowej ukierunkowanej na kontrolę MM.
Kryteria wyłączenia
- Znana diagnoza: amyloidoza AL, makroglobulinemia Waldenstroma, POEMS lub choroba Castlemana.
- Rozpoznanie raka innego niż szpiczak lub rak skóry (płaskonabłonkowy lub podstawnokomórkowy), który jest w toku lub był leczony w ciągu ostatnich 2 lat.
- Próbka guza jest nieodpowiednia lub niedostępna do analizy (np. z powodu niewystarczającej liczby komórek nowotworowych).
- Pacjent nie będzie otrzymywał ogólnoustrojowej chemioterapii/immunoterapii ukierunkowanej na MM przez kolejne 2 miesiące od wykonania biopsji guza.
Plan studiów
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
Liczba grup / kohort
Kohorty i interwencje
Grupa / KohortaGrupa / Kohorta |
|---|
|
Uczestnicy ze szpiczakiem mnogim
Uczestnicy, którzy zostaną poddani biopsji guza w celu leczenia szpiczaka mnogiego (MM)
|
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Całkowita liczba somatycznych wariantów pojedynczego nukleotydu (SNV) na pacjenta
Ramy czasowe: Koniec badania po 30 miesiącach
|
Liczba zmian genetycznych stwierdzonych w genomie w wyniku sekwencjonowania genetycznego i porównania z najczęstszą sekwencją genetyczną.
Dany wariant może opisywać zmianę łagodną, patogenną lub o nieznanym znaczeniu.
|
Koniec badania po 30 miesiącach
|
Miary wyników drugorzędnych
Miary wyników drugorzędnych
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Całkowita liczba wstawek somatycznych (INS) na pacjenta
Ramy czasowe: Koniec badania po 30 miesiącach
|
Całkowita liczba wstawek somatycznych (INS) na pacjenta.
Liczba przypadków, w których nukleotydy zostały błędnie dodane do genomu, określona na podstawie sekwencjonowania genetycznego i porównania z najczęstszą sekwencją genetyczną.
|
Koniec badania po 30 miesiącach
|
|
Całkowita liczba delecji somatycznych (DEL) na pacjenta
Ramy czasowe: Koniec badania po 30 miesiącach
|
Liczba przypadków, w których nukleotydy błędnie pominięto w genomie, określona na podstawie sekwencjonowania genetycznego i porównania z najczęstszą sekwencją genetyczną.
|
Koniec badania po 30 miesiącach
|
|
Liczba SNV na megabazę genomu MM
Ramy czasowe: Koniec badania po 30 miesiącach
|
Liczba zmian genetycznych wykrytych w komórkach nowotworu MM poprzez sekwencjonowanie i porównanie z najczęstszą sekwencją genetyczną.
|
Koniec badania po 30 miesiącach
|
|
Liczba INS na megabazę genomu MM
Ramy czasowe: Koniec badania po 30 miesiącach
|
Liczba przypadków, w których nukleotydy zostały błędnie dodane do genomu nowotworu MM, w przeliczeniu na długość DNA, określona na podstawie sekwencjonowania genetycznego i porównania z najczęstszą sekwencją genetyczną.
|
Koniec badania po 30 miesiącach
|
|
Liczba DEL na megabazę genomu MM
Ramy czasowe: Koniec badania po 30 miesiącach
|
Liczba przypadków, w których nukleotydy błędnie pominięto w genomie guza MM, w przeliczeniu na długość DNA, określoną na podstawie sekwencjonowania genetycznego i porównania z najczęstszą sekwencją genetyczną.
|
Koniec badania po 30 miesiącach
|
|
Liczba mutacji na megabazę wśród podgrup MM
Ramy czasowe: Koniec badania po 30 miesiącach
|
Liczba zmian genetycznych wykrywalnych u > 1 % lub < 1 % populacji, na długość DNA, w podgrupach szpiczaka mnogiego (MM), określona na podstawie sekwencjonowania genetycznego i porównania z najczęstszą sekwencją genetyczną.
|
Koniec badania po 30 miesiącach
|
|
Liczba mutacji na megabazę wśród regionów genomowych dla wszystkich MM i podgrup mutacyjnych
Ramy czasowe: Koniec badania po 30 miesiącach
|
Liczba zmian genetycznych wykrywalnych u > 1 % lub < 1 % populacji, na długość DNA, według regionu genetycznego (tj. promotora, regionu kodującego i sekwencji terminacyjnej), dla wszystkich MM i podgrup mutacyjnych, określona na podstawie genów sekwencjonowanie i porównanie z najpowszechniejszą sekwencją genetyczną.
|
Koniec badania po 30 miesiącach
|
|
Zidentyfikowano mutacje genów
Ramy czasowe: Koniec badania po 30 miesiącach
|
Liczba i rodzaj zmian genetycznych wykrywalnych u > 1 % lub < 1 % zidentyfikowanej populacji, jak określono na podstawie sekwencjonowania genetycznego i porównania z najczęstszą sekwencją genetyczną.
|
Koniec badania po 30 miesiącach
|
|
Wykryto nieprawidłowości chromosomalne
Ramy czasowe: Koniec badania po 30 miesiącach
|
. Liczba i rodzaje zidentyfikowanych nieprawidłowości chromosomowych, określone na podstawie sekwencjonowania genetycznego i porównania z najczęstszą sekwencją genetyczną.
|
Koniec badania po 30 miesiącach
|
|
Zidentyfikowano sygnatury molekularne
Ramy czasowe: Koniec badania po 30 miesiącach
|
Liczba i rodzaj zidentyfikowanych zestawów cech biomolekularnych, które mogą być przydatne w przewidywaniu przebiegu choroby lub odpowiedzi na interwencję terapeutyczną u pacjentów ze szpiczakiem szpiczastym i innymi nowotworami, jak określono na podstawie sekwencjonowania, zmienności zestawu genów i ukierunkowanej analizy leku.
|
Koniec badania po 30 miesiącach
|
|
Zidentyfikowano ustalone markery prognostyczne
Ramy czasowe: Koniec badania po 30 miesiącach
|
Liczba i rodzaj ustalonych zidentyfikowanych markerów prognostycznych.
Ocena cech biologicznych, o których wiadomo, że są przydatne w przewidywaniu przebiegu choroby lub odpowiedzi na interwencję terapeutyczną u pacjentów ze MM i innymi nowotworami, jak określono na podstawie sekwencjonowania i porównania z bazami danych znanych markerów prognostycznych.
|
Koniec badania po 30 miesiącach
|
|
Warianty somatyczne zidentyfikowane jako cele leków zatwierdzonych przez FDA (dane dotyczące wariantów farmakogenomicznych)
Ramy czasowe: Koniec badania po 30 miesiącach
|
Liczba i rodzaj zmian genetycznych wykrytych w genomie, które można leczyć za pomocą terapii zatwierdzonych przez FDA, określona na podstawie sekwencjonowania i porównania z bazami danych dotyczącymi znanych celów i powiązanych leków zatwierdzonych przez FDA.
|
Koniec badania po 30 miesiącach
|
|
Zidentyfikowano warianty kluczowych sterowników wykorzystujących technologię sieciową
Ramy czasowe: Koniec badania po 30 miesiącach
|
Liczba i rodzaj mutacji, o których wiadomo, że prowadzą do transformacji, wzrostu i rozprzestrzeniania się komórek nowotworowych w organizmie, określone na podstawie sekwencjonowania genetycznego i porównania z najczęstszą sekwencją genetyczną oraz z bazami danych znanych mutacji powodujących raka.
Mutacje te zostaną sklasyfikowane w następujący sposób: te, które są znanymi celami leków zatwierdzonych przez FDA, te, które mogą być celami leków w opracowaniu, które nie są jeszcze zatwierdzone przez FDA, oraz te, które mogą służyć jako cele dla nowych terapii.
|
Koniec badania po 30 miesiącach
|
|
Zidentyfikowano różnice w transkrypcie
Ramy czasowe: Koniec badania po 30 miesiącach
|
Liczba i rodzaj odmian transkryptomu zidentyfikowanych jako potencjalne w opracowaniu nowych środków terapeutycznych (białka wyrażane na powierzchni komórki, które wydają się podatne na opracowanie szczepionek), określone na podstawie sekwencjonowania, modelowania sieci i profilowania transkryptomu nowotworu.
|
Koniec badania po 30 miesiącach
|
|
Mutacje linii zarodkowej zidentyfikowane w genach predyspozycji do raka
Ramy czasowe: Koniec badania po 30 miesiącach
|
Liczba i rodzaj mutacji linii zarodkowej zidentyfikowanych w genach predyspozycji do raka, jak określono na podstawie sekwencjonowania genomu i porównania z najczęstszą sekwencją genetyczną.
|
Koniec badania po 30 miesiącach
|
|
Dostępne są leki zatwierdzone przez FDA, które blokują enzymy wytwarzane w zidentyfikowanych szlakach
Ramy czasowe: Koniec badania po 30 miesiącach
|
Liczba i rodzaj dostępnych leków zatwierdzonych przez FDA, które blokują enzymy wytwarzane w tych szlakach, zidentyfikowanych poprzez porównanie wyników genomu i transkryptomii z bazami danych dotyczącymi znanych leków zatwierdzonych przez FDA i powiązanych celów.
|
Koniec badania po 30 miesiącach
|
|
Leczenie zalecane na podstawie potoku obliczeniowego na podstawie stanu klinicznego i genetycznego pacjenta
Ramy czasowe: Koniec badania po 30 miesiącach
|
Lista zalecanych metod leczenia ustalona na podstawie sekwencjonowania, analizy mikrośrodowiska guza i analizy obliczeniowej.
|
Koniec badania po 30 miesiącach
|
|
Profil sekwencjonowania całego egzomu linii zarodkowej
Ramy czasowe: Koniec badania po 30 miesiącach
|
Wyniki sekwencjonowania całego egzomu genomu linii zarodkowej.
|
Koniec badania po 30 miesiącach
|
|
Profil sekwencjonowania całego egzomu genomu nowotworu
Ramy czasowe: Koniec badania po 30 miesiącach
|
Wyniki sekwencjonowania całego egzonu genomu nowotworu.
|
Koniec badania po 30 miesiącach
|
|
Profil transkryptomu nowotworu
Ramy czasowe: Koniec badania po 30 miesiącach
|
Wyniki sekwencjonowania RNA transkryptomu nowotworu.
|
Koniec badania po 30 miesiącach
|
|
Profil sekwencjonowania pojedynczych komórek
Ramy czasowe: Koniec badania po 30 miesiącach
|
Wyniki analizy sekwencjonowania pojedynczych komórek.
|
Koniec badania po 30 miesiącach
|
|
Profil cytometryczny
Ramy czasowe: Koniec badania po 30 miesiącach
|
Wyniki analizy cytometrii według czasu przelotu (CyTOF).
|
Koniec badania po 30 miesiącach
|
|
Powiązane ścieżki sygnalizacyjne
Ramy czasowe: Koniec badania po 30 miesiącach
|
Ścieżki sygnalizacyjne związane z każdą mutacją genu, nieprawidłowością chromosomalną i sygnaturą molekularną, tj. starzeniem się, wadliwą naprawą DNA i kompleksem edycyjnym apolipoproteiny B (APOBEC)/aktywnością deaminazy indukowaną aktywacją, zidentyfikowanymi w Celu 1, jak określono za pomocą analizy sekwencjonowania i obliczeniowej.
|
Koniec badania po 30 miesiącach
|
|
Enzymy powiązane z każdym zidentyfikowanym szlakiem sygnałowym
Ramy czasowe: Koniec badania po 30 miesiącach
|
Enzymy powiązane z każdym szlakiem sygnałowym zidentyfikowanym na podstawie analizy sekwencjonowania i obliczeniowej.
|
Koniec badania po 30 miesiącach
|
|
Ulepszanie zaleceń dotyczących leczenia nowotworów na podstawie sekwencjonowania poprzez uczenie maszynowe
Ramy czasowe: Koniec badania po 30 miesiącach
|
Wykorzystanie obliczeń sztucznej inteligencji do wdrażania zalecanych terapii opartych na sekwencjonowaniu nowotworów i poprawy dokładności przewidywania leczenia, aby umożliwić lepszą interpretację danych dotyczących sekwencjonowania nowotworów i postęp w opracowywaniu spersonalizowanych i precyzyjnych terapii przeciwnowotworowych.
Postęp będzie mierzony poprzez śledzenie precyzji i dokładności uczenia maszynowego oraz ocenę uzyskanych danych za pomocą analizy statystycznej.
|
Koniec badania po 30 miesiącach
|
Współpracownicy i badacze
Sponsor
Sponsor
Współpracownicy
Współpracownicy
Śledczy
Śledczy
- Główny śledczy: Cesar Rodriguez Valdes, MD, PhD, Icahn School of Medicine at Mount Sinai
Daty zapisu na studia
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
Rozpoczęcie studiów
Zakończenie podstawowe (Rzeczywisty)
Zakończenie podstawowe
Ukończenie studiów (Rzeczywisty)
Ukończenie studiów
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)
Pierwszy wysłany
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
Ostatnia wysłana aktualizacja
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia weryfikacja
Ostatnia weryfikacja
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Dodatkowe istotne warunki MeSH
- Choroby naczyniowe
- Choroby układu krążenia
- Nowotwory
- Choroby układu odpornościowego
- Nowotwory według typu histologicznego
- Choroby hematologiczne
- Zaburzenia limfoproliferacyjne
- Zaburzenia immunoproliferacyjne
- Nowotwory, komórki plazmatyczne
- Zaburzenia hemostatyczne
- Paraproteinemie
- Zaburzenia białek krwi
- Zaburzenia krwotoczne
- Choroby hemowe i limfatyczne
- Szpiczak mnogi
Inne numery identyfikacyjne badania
Inne numery identyfikacyjne badania
- STUDY-23-00503
- GCO 19-0175 (Inny numer grantu/finansowania: Icahn School of Medicine at Mount Sinai)
- 5R01CA244899 (Grant/umowa NIH USA)
Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)
Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?
Opis planu IPD
Ramy czasowe udostępniania IPD
Kryteria dostępu do udostępniania IPD
Typ informacji pomocniczych dotyczących udostępniania IPD
- SOK ROŚLINNY
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
produkt wyprodukowany i wyeksportowany z USA
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .