Mapowanie genetyczne aterogennych fenotypów lipoprotein

TŁO:

Fenotyp ALP B (ALP-B), charakteryzujący się przewagą małych, gęstych cząstek LDL, co określono metodą elektroforezy w żelu gradientowym, wiąże się ze zwiększonym ryzykiem zawału mięśnia sercowego i konstelacją aterogennych zmian lipidów i apolipoprotein (apo). Na podstawie złożonej analizy segregacji wydaje się, że na ALP-B wpływa pojedynczy główny locus genetyczny z dominującym sposobem dziedziczenia i wspólną częstością alleli. Projekt ten miał na celu zidentyfikowanie nowego genu odpowiedzialnego za podatność na chorobę niedokrwienną serca.

NARRACJA PROJEKTOWA:

Badacze zidentyfikowali, zgromadzili i zbudowali repozytorium unieśmiertelnionych linii komórkowych oraz pomiarów lipidów i apo pochodzących od członków rodzin mających związek z ALP. Przetestowali geny związane z metabolizmem lipoprotein jako potencjalnymi genami ALP i wykorzystali wysoce pouczające sondy DNA do przeszukania genomu pod kątem powiązań z genem ALP. Udoskonalili także model dziedziczenia fenotypów ALP i przetestowali interakcje genetyczno-środowiskowe. Do repozytorium zrekrutowano czterdzieści rodzin informacyjnych. Rodziny zostały zidentyfikowane na podstawie dwóch źródeł probantów: byłych uczestników badania diety obniżającej poziom cholesterolu oraz pacjentów obserwowanych w klinikach lipidowych na University of Washington. Każdy uczestniczący członek rodziny wypełnił kwestionariusz historii medycznej i dostarczył próbkę krwi do określenia fenotypu ALP, do badań DNA oraz do pomiarów lipidów i apo. Badania powiązań i analizy wyniku LOD rozpoczęto od podejścia genu kandydującego i kontynuowano przy użyciu sond DNA, które ujawniły polimorfizmy długości fragmentów restrykcyjnych (RFLP) w celu przeszukania genomu pod kątem powiązań z genem ALP. Po znalezieniu powiązania informacje o genotypie ALP wykorzystano do udoskonalenia modelu statystycznego opisującego dziedziczenie fenotypów ALP oraz do oceny interakcji genetyczno-środowiskowych obejmujących poziomy lipidów i apo oraz czynniki środowiskowe i behawioralne.