SSAT 054: Czynniki niegenetyczne w patogenezie IBD u bliźniąt

Wstęp: Nieswoiste zapalenia jelit (IBD), choroba Leśniowskiego-Crohna (CD) i wrzodziejące zapalenie jelita grubego (UC) są wyniszczającymi chorobami o złożonej etiologii. Największym czynnikiem ryzyka rozwoju IBD jest krewny pierwszego stopnia dotknięty chorobą. Jednak gdy u bliźniaka jednojajowego zdiagnozowano IBD, u drugiego bliźniaka choroba rozwija się tylko w 20-55% przypadków.

Ostatnie badania sugerują, że mikroflora, ekosystem bakterii w jelitach, może wywoływać choroby u podatnych osób. Innym ważnym obszarem badawczym są zmiany epigenomu w strukturze i regulacji naszego genomu, które zachodzą przez całe nasze życie. Wiadomo, że rodzeństwo osób cierpiących na chorobę Leśniowskiego-Crohna ma zmiany w układzie odpornościowym charakterystyczne dla choroby Leśniowskiego-Crohna. Nie wiadomo jednak, czy zmiany te wynikają z podobieństwa genetycznego, czy też ze wspólnego środowiska. Porównanie bliźniąt jedno- i dwuzygotycznych wyjaśnia względne znaczenie czynników genetycznych i środowiskowych.

Główny cel: Badanie eksploracyjne mające na celu zbadanie różnic między epigenomem, mikrobiomem i immunologią czynnościową u bliźniąt niezgodnych z chorobą zapalną jelit.

Projekt badania: wieloośrodkowe podstawowe badanie naukowe z udziałem ludzi

Planowana wielkość próby: 200 osób, których dane dotyczą (100 par bliźniaczych)

Metodologia:

A) Identyfikacja par bliźniąt, z których jedna lub obie mają nieswoiste zapalenie jelit poprzez:

1. Rejestr IBD Nixon Twin i Multiplex.
2. Reklama par bliźniąt za pośrednictwem strony internetowej BSG i biuletynów/grup wsparcia pacjentów/portalów społecznościowych/plakatów kliniki.
3. Identyfikacja według ośrodków badawczych B) Uzyskanie formalnej pisemnej zgody C) Pobranie krwi, kału i moczu.

D) Przeprowadzona zostanie następująca analiza:

• Ekstrakcja DNA epigenetyczna (z krwi), a następnie analiza metylacji i konwersja wodorosiarczanów za pomocą testu beadchip 450 Illumina
• Immunologia funkcjonalna (krew) - cytometria przepływowa komórek CD3, CD4 i CD8. (Londynskie pary bliźniaków niezgodne z chorobą Leśniowskiego-Crohna)
• Sekwencjonowanie genu 16S rRNA (kał) - bakteryjnego DNA
• Profilowanie metaboliczne (mocz i stolec) – przy użyciu magnetycznego rezonansu jądrowego (NMR) i spektrometrii mas E) Zbieranie informacji dotyczących historii diety w ciągu ostatnich 72 godzin Czas trwania badania: 2 lata (pojedyncza wizyta).