Wieloośrodkowe badanie mające na celu walidację niPGT-A (niPGT-A)
Prospektywne, obserwacyjne, wieloośrodkowe, międzynarodowe badanie mające na celu walidację nieinwazyjnego preimplantacyjnego testu genetycznego na aneuploidię zarodka w zużytym podłożu hodowlanym (niPGT-A).
Nieprawidłowa liczba chromosomów lub aneuploidia jest powszechna w embrionach ludzkich. Odpowiada za ponad połowę wszystkich poronień i jest główną przyczyną wrodzonych wad wrodzonych. Poza tym opisano, że aneuploidia może również wpływać na implantację zarodka. Dlatego wybór zarodków, które mają największe szanse na zagnieżdżenie się i wyrośnięcie na zdrowe dziecko, jest jednym z najważniejszych kroków w dziedzinie wspomaganego rozrodu.
Ostatnie postępy w technologiach genetycznych, takie jak sekwencjonowanie nowej generacji (NGS), umożliwiły wykrywanie aneuploidii z większą czułością. Zastosowanie tej techniki do biopsji trofektodermy, pobranych z zarodków przed przeniesieniem do macicy, dostarczyło wglądu w kliniczny wpływ statusu chromosomalnego. Ten proces badania przesiewowego zarodków w celu upewnienia się, że mają one odpowiednią liczbę chromosomów i poszukiwania wszelkich nieprawidłowości strukturalnych w chromosomach, nazywa się genetycznym badaniem przedimplantacyjnym w kierunku aneuploidii (PGT-A). Wymaga specjalnego sprzętu i przeszkolonego personelu, co zwiększy koszty i ryzyko, dlatego jako alternatywę poszukuje się technik nieinwazyjnych. Te nieinwazyjne procedury zostały zbadane przez niektóre grupy analizujące zużytą pożywkę hodowlaną, w której zarodek jest inkubowany do czasu przeniesienia lub zamrożenia. W codziennej rutynie pożywka ta jest odrzucana po zakończeniu hodowli zarodka, ale zgłaszano, że zawiera śladowe ilości DNA bez komórek embrionalnych (cfDNA), które może reprezentować obciążenie genetyczne zarodka. Jednak w tej chwili istnieje duża zmienność wyników między badaniami, przy czym odsetek zgodnych wyników między mediami a biopsją trofektodermy wynosi od 3,5 do 85,7%.
Dlatego głównym celem tego projektu jest walidacja nowej nieinwazyjnej metody oznaczania PGT-A (niPGT-A), opartej na udoskonalonym pobieraniu i analizie pożywek hodowlanych w celu uzyskania wyższych wskaźników czułości i specyficzności oraz zmniejszenia efektu niektórych wewnętrznych trudności, takich jak niski wkład cfDNA zarodka, mozaicyzm i zanieczyszczenie przez matkę.
Przegląd badań
Status
Interwencja / Leczenie
Szczegółowy opis
Embriony ludzkie mają wyższy wskaźnik aneuploidii (20-80%) niż inne gatunki. Znaczna część tych zarodków aneuploidalnych ma zdolność do osiągnięcia stadium blastocysty. Jednakże, w zależności od typu aneuploidii, niektóre z nich nie zagnieżdżą się w macicy, podczas gdy inne zagnieżdżą się, ale nie będą w stanie przeprowadzić wczesnego rozwoju embrionalnego (poronienie) lub, bardzo rzadko, zakończą się żywo urodzonymi dziećmi z określonymi nieprawidłowościami. Dlatego ważna jest identyfikacja zarodków aneuploidalnych. Ważna jest identyfikacja zarodków zagrożonych chromosomami aneuploidalnymi u pacjentek z zaawansowanym wiekiem matki (AMA), nawracającymi niepowodzeniami implantacji (RIF) lub nawracającymi poronieniami (RM).
Identyfikacja aneuploidii jest szczególnie ważna w przypadku zarodków pacjentów z wyższym ryzykiem aneuploidii, takich jak zaawansowany wiek matki (AMA), nawracające niepowodzenia implantacji (RIF) lub nawracające poronienia (RM). Dlatego normalna morfologia i rozwój zarodka zależą od dopełnienia chromosomów.
Technika PGT-A analizuje pełną zawartość chromosomów pojedynczej komórki z wysoką czułością i swoistością, ale wymaga inwazyjnej biopsji w celu uzyskania materiału embrionalnego do analizy genetycznej. Zatem nieinwazyjne metody, które zastąpiłyby istniejącą inwazyjną metodę testowania, byłyby przydatne w poprawie bezpieczeństwa matki i płodu.
Ostatnio w dziedzinie badań genetycznych poczyniono wiele postępów w badaniach. DNA wolne od komórek (cfDNA) obserwowano w pożywkach do hodowli zużytych zarodków. Pochodzenie cfDNA na etapie blastocysty można przypisać zdarzeniom apoptotycznym, które mogą wystąpić podczas normalnego rozwoju. To zachęciło różne grupy badawcze do przeprowadzenia analizy zużytych pożywek.
Początkowo przeprowadzono różne badania w celu wykrycia specyficznych genów związanych z zaburzeniami monogenowymi (MTHFR9, HBA1/HBA210, SRY11). Ostatnio opracowano nieinwazyjną metodę PGT-A, z bardzo zmiennymi wynikami współczynnika zgodności (3,5%, 59,1%, i 85,7%, 30,6%). Status chromosomalny zarodka z DNA obecnego w zużytej pożywce hodowlanej porównano ze statusem uzyskanym zgodnie ze standardowym protokołem z biopsją trofektodermy. Różnica w zgłoszonych wynikach może być związana z różnymi zastosowanymi metodologiami, ponieważ zastosowano różne metody amplifikacji i wykrywania – aCGH lub NGS. Co więcej, wskaźniki zgodności były definiowane inaczej w każdym badaniu, tj. Wyniki aneuploidalne w zużytych pożywkach hodowlanych i biopsja trofektodermy można uznać za zgodne, mimo że nie wykazano tych samych aneuploidalnych chromosomów.
Wpływ warunków hodowli na skuteczność podejścia nieinwazyjnego został zbadany przez Hammonda i in. (2016). Odkryli, że poziom zanieczyszczenia DNA (DNA mitochondrialnego i jądrowego) był stale bardzo niski w kontrolach pożywek z trzech różnych rodzajów pożywek komercyjnych, które nie były narażone na kontakt z embrionami. Uważa się, że obserwowany niski wyjściowy poziom zanieczyszczenia DNA pochodzi z dodatku białka w pożywce hodowlanej.
Wreszcie, na PGT-A mogą mieć wpływ dwa istotne czynniki: zanieczyszczenie matczynym DNA z komórek ziarnistych (MCC) i mozaicyzm.
Aby poprawić wyniki programów IVF (In vitro Fertilization), istnieje potrzeba identyfikacji zarodka o największym potencjale implantacyjnym. Analiza chromosomów zarodków pozwala na selekcję zarodków euploidalnych, które mają wyższy wskaźnik powodzenia implantacji.
Opracowanie nieinwazyjnego protokołu PGT-A poprawi obecne metodologie stosowane do identyfikacji zarodków euploidalnych, unikając szkodliwego wpływu biopsji na zarodek i zmniejszając koszty ekonomiczne.
Wstępnie oszacowana wielkość próby obliczona na 3245 zarodków (każdy zarodek jest uważany za podmiot w badaniu), biorąc pod uwagę odsetek rezygnacji wynoszący 30%.
Dane zostaną pogrupowane i przeanalizowane w Igenomix w trzech punktach czasowych badania: po przetworzeniu 25 zarodków z każdego ośrodka (w celu oceny wdrożenia metodologii), po przetworzeniu 30% próbek (jako tymczasowe sprawdzić wyniki) oraz na koniec badania do ostatecznej analizy, w tym obserwacji wyniku klinicznego.
Po analizie pośredniej przeprowadzonej przy 30% rekrutacji, całkowita wielkość próby została ponownie obliczona jako 2620 próbek, biorąc pod uwagę wskaźnik rezygnacji wynoszący 5% zgodnie ze wskaźnikiem rezygnacji zaobserwowanym podczas analizy pośredniej. Wyniki tymczasowej analizy opublikowane w Rubio et al., AJOG 2020.
Typ studiów
Zapisy (Rzeczywisty)
Kontakty i lokalizacje
Lokalizacje studiów
-
-
-
Buenos Aires, Argentyna, C1425DGQ
- Pregna Medicina Reproductiva
-
-
-
-
Porto Alegre
-
Boa Vista, Porto Alegre, Brazylia, 91330-002
- Nilo Frantz - Centro de Reprodução Humana
-
-
-
-
-
Madrid, Hiszpania, 28036
- ProcreaTec
-
-
-
-
-
Istanbul, Indyk, 07720
- Bahçeci Group
-
-
-
-
Cdmx
-
Mexico City, Cdmx, Meksyk, 05120
- NASCERE
-
-
-
-
-
Lima, Peru, 15036
- Inmater - Clínica de Fertilidad
-
-
-
-
California
-
San Diego, California, Stany Zjednoczone, 92130
- San Diego Fertility Center
-
-
Massachusetts
-
Boston, Massachusetts, Stany Zjednoczone, 02109
- Boston IVF Fertility Clinic
-
-
Washington
-
Arlington, Washington, Stany Zjednoczone, 22203
- Dominion Fertility
-
-
-
-
Roma
-
Rome, Roma, Włochy, 00197
- Genera Rome
-
-
Kryteria uczestnictwa
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
Akceptuje zdrowych ochotników
Metoda próbkowania
Badana populacja
Opis
Kryteria przyjęcia:
- Przypadki PGT-A z biopsją trofektodermy i SET dla dowolnych wskazań medycznych oraz podpisanym pisemnym formularzem świadomej zgody zatwierdzonym przez EC/IRB po należytym poinformowaniu o charakterze badań i dobrowolnej zgodzie na udział w badaniu.
- Dozwolone jest ICSI (Intra Cytoplazmic Sperm Injection), IVF (In Vitro Fertilization) lub ICSI/IVF wykonywane na świeżych oocytach od par.
Uwaga: nasienie dawcy jest dozwolone.
- Dozwolone są tylko świeże oocyty.
- Dozwolony jest świeży i odroczony transfer zarodków. Uwaga: W przypadku odroczonego transferu zarodków zarodki muszą być poddawane witryfikacji zawsze po biopsji blastocysty.
- Wiek: 20-44 lata (włącznie).
Kryteria wyłączenia:
- Znany nieprawidłowy kariotyp członka pary.
- Wykluczone są przypadki przedimplantacyjnego badania genetycznego w kierunku chorób monogenowych (PGT-M) lub genetycznego badania przedimplantacyjnego w kierunku przegrupowań strukturalnych (PGT-SR).
Plan studiów
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
- Modele obserwacyjne: Inny
- Perspektywy czasowe: Spodziewany
Kohorty i interwencje
Grupa / Kohorta |
Interwencja / Leczenie |
|---|---|
|
Zarodki przechodzące PGT-A / niPGT-A
Zarodki od pacjentów IVF w wieku od 20 do 44 lat, poddawanych PGT-A z dowolnego wskazania medycznego, z własnymi cyklami dawstwa oocytów lub komórek jajowych oraz z transferem pojedynczego zarodka (SET)
|
PGT-A zostanie przeprowadzone zgodnie ze zwykłą praktyką kliniczną: Próbki biopsji trophektodermy z blastocyst są analizowane przez NGS w celu wykrycia liczbowych nieprawidłowości chromosomalnych.
Nieinwazyjny preimplantacyjny test genetyczny w kierunku aneuploidii zarodków analizujący zużyte podłoża hodowlane, w których zarodek jest inkubowany do czasu witryfikacji.
To podłoże zawiera śladowe ilości embrionalnego DNA bezkomórkowego (cfDNA), które może reprezentować obciążenie genetyczne zarodka.
|
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Status chromosomalny zarodków
Ramy czasowe: 6 do 7 dni rozwoju zarodka
|
Zgodność wyników analizy liczby i struktury chromosomów między biopsją a zużytymi mediami blastocysty.
|
6 do 7 dni rozwoju zarodka
|
Miary wyników drugorzędnych
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Żywy wskaźnik urodzeń
Ramy czasowe: 40 tygodni
|
Liczba dzieci urodzonych na transfer zarodka
|
40 tygodni
|
|
Wskaźnik ciąż
Ramy czasowe: 20 tygodni
|
Liczba ciąż na transfer zarodka
|
20 tygodni
|
|
Wskaźnik poronień klinicznych
Ramy czasowe: 20 tygodni
|
Liczba poronień klinicznych na całkowitą liczbę ciąż
|
20 tygodni
|
|
Analiza produktów poczęcia (POC)
Ramy czasowe: Do 20 tygodni
|
Tkanka łożyska i/lub płodu, która pozostaje w macicy po samoistnej utracie ciąży
|
Do 20 tygodni
|
Współpracownicy i badacze
Sponsor
Śledczy
- Krzesło do nauki: Carlos Simón, MD PhD, Igenomix
- Główny śledczy: Carmen Rubio, BSc PhD, Igenomix
Daty zapisu na studia
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
Zakończenie podstawowe (Rzeczywisty)
Ukończenie studiów (Rzeczywisty)
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia weryfikacja
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Słowa kluczowe
Dodatkowe istotne warunki MeSH
Inne numery identyfikacyjne badania
- IGX1-NIP-CS-18-02-SUB1
Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)
Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .