Étude multicentrique pour valider niPGT-A (niPGT-A)

Les embryons humains ont des taux d'aneuploïdie plus élevés (20 à 80 %) que les autres espèces. Une proportion considérable de ces embryons aneuploïdes ont la capacité d'atteindre le stade de blastocyste. Cependant, selon le type d'aneuploïdie, certaines ne s'implanteront pas dans l'utérus, tandis que d'autres s'implanteront mais seront incapables de réaliser un développement embryonnaire précoce (fausse couche), ou très rarement, entraîneront des enfants nés vivants avec des anomalies spécifiques. Il est donc important d'identifier les embryons aneuploïdes Il est important d'identifier les embryons à risque pour les chromosomes aneuploïdes chez les patientes présentant un âge maternel avancé (AMA), un échec d'implantation récurrent (RIF) ou une fausse couche récurrente (RM).

L'identification des aneuploïdies est particulièrement importante chez les embryons de patients présentant un risque d'aneuploïdie plus élevé, tels que ceux présentant un âge maternel avancé (AMA), un échec d'implantation récurrent (RIF) ou une fausse couche récurrente (RM). Par conséquent, la morphologie et le développement normaux de l'embryon dépendent du complément chromosomique.

La technique PGT-A analyse le contenu chromosomique complet d'une seule cellule avec une sensibilité et une spécificité élevées, mais nécessite une biopsie invasive pour obtenir du matériel embryonnaire pour l'analyse génétique. Ainsi, des méthodes non invasives pour remplacer la méthode de test invasive existante seraient utiles dans l'amélioration de la sécurité maternelle et fœtale.

Récemment, il y a eu de nombreuses avancées dans la recherche dans le domaine des tests génétiques. De l'ADN acellulaire (cfDNA) a été observé dans des milieux de culture d'embryons épuisés. L'origine du cfDNA au stade de blastocyste pourrait être attribuée à des événements apoptotiques pouvant survenir au cours du développement normal. Cela a encouragé différents groupes de recherche à effectuer des analyses des milieux de culture usés.

Diverses études ont d'abord été menées pour détecter des gènes spécifiques associés à des troubles monogéniques (MTHFR9, HBA1/HBA210, SRY11). Récemment, la PGT-A non invasive a été développée, avec des résultats très variables sur le taux de concordance (3,5 %, 59,1 %, et 85,7 %, 30,6 %). Le statut chromosomique de l'embryon à partir de l'ADN présent dans le milieu de culture usé a été comparé à celui obtenu selon le protocole standard utilisant la biopsie du trophectoderme. La différence dans les résultats rapportés peut être liée aux différentes méthodologies appliquées car différentes méthodes d'amplification et de détection -aCGH ou NGS- ont été utilisées. De plus, les taux de concordance ont été définis différemment dans chaque étude, c'est-à-dire que les résultats aneuploïdes dans les milieux de culture usés et la biopsie du trophectoderme pouvaient être considérés comme concordants malgré le fait de ne pas montrer les mêmes chromosomes aneuploïdes.

L'impact des conditions de culture sur l'efficacité de l'approche non invasive a été étudié par Hammond et al, (2016). Ils ont constaté qu'il y avait constamment un très faible niveau de contamination par l'ADN (ADN mitochondrial et nucléaire) dans les témoins de milieux, provenant de trois types différents de milieux commerciaux, qui n'avaient pas été exposés à des embryons. On pense que le faible niveau de base de contamination de l'ADN observé provient du supplément protéique du milieu de culture.

Enfin, il pourrait y avoir une influence de deux facteurs pertinents sur le PGT-A : la contamination par l'ADN maternel des cellules de la granulosa (MCC) et le mosaïcisme.

Pour améliorer les résultats des programmes de FIV (fécondation in vitro), il est nécessaire d'identifier l'embryon ayant le potentiel d'implantation le plus élevé. L'analyse chromosomique des embryons permet la sélection d'embryons euploïdes, qui ont un taux de réussite d'implantation plus élevé.

Le développement d'un protocole PGT-A non invasif améliorera les méthodologies actuelles utilisées pour identifier ces embryons euploïdes en évitant l'effet néfaste de la biopsie sur l'embryon et en diminuant le coût économique.

La taille initiale estimée de l'échantillon calculée était de 3245 embryons (chaque embryon est considéré comme un sujet dans l'étude), en considérant un taux d'abandon de 30 %.

Les données seront regroupées et analysées chez Igenomix à trois moments de l'étude : une fois que 25 embryons de chaque centre auront été traités (pour évaluer la mise en œuvre de la méthodologie), après que 30 % des échantillons auront été traités (en attendant vérifier les résultats) et à la fin de l'étude pour l'analyse finale incluant le suivi du résultat clinique.

Après l'analyse intermédiaire réalisée à 30% de recrutement, la taille totale de l'échantillon a été recalculée à 2620 échantillons, en considérant un taux d'abandon de 5% selon le taux d'abandon observé lors de l'analyse intermédiaire. Résultats de l'analyse intermédiaire publiée dans Rubio et al., AJOG 2020.