Wdrażanie krajowego biobanku PD z WGS i funkcjonalną oceną dziedziczenia poligenicznego za pomocą technologii iPSC
Wdrażanie krajowego biobanku genetycznej, sporadycznej i prodromicznej choroby Parkinsona wraz z analizą całego genomu i funkcjonalną oceną dziedziczenia poligenicznego za pomocą technologii iPSC
Przegląd badań
Status
Interwencja / Leczenie
Szczegółowy opis
Projekt jest wieloośrodkowym badaniem obserwacyjnym. Zaangażowane instytucje to:
IRCCS Hospital San Raffaele, Mediolan Włochy (koordynator Jednostka Operacyjna (OU1)) IRCCS INM Neuromed, Pozzilli, (IS) Włochy (Jednostka Operacyjna (OU2)) IRCCS San Raffaele Roma, (Jednostka Operacyjna (OU3)) Projekt wykorzystuje dostępność dużej kolekcji próbek PD (~800) PD ze znanych i sporadycznych przypadków, rekrutowanych w IRCCS Neuromed, dla których już zebraliśmy i przechowywaliśmy informacje kliniczne, dane genetyczne, a także jednojądrzaste komórki DNA, surowicy, osocza i krwi obwodowej ( PBMC) dla całej badanej kohorty.
Działalność IRCCS INM Neuromed to:
- standaryzacja raportowania klinicznego, pobierania próbek, przechowywania i identyfikacji pomiędzy ośrodkami;
- zrekrutowanie 100 pacjentów z ChP, 30 pacjentów z RBD i 100 osób zdrowych (żon/mężów pacjentów) do przeprowadzenia w ramach planowych wizyt ambulatoryjnych dla tych pacjentów;
- sekwencjonowanie całego genomu (WGS) i analiza bioinformatyczna (we współpracy z OU1) wybranej kohorty pacjentów z PD (200 próbek), negatywnych pod względem mutacji/wariantów w genach kandydatów na PD;
- Analiza WGS pacjentów z objawami prodromalnymi zaburzeń zachowania podczas snu REM (RBD) jako model do identyfikacji wczesnego biomarkera PD;
- opracowanie innowacyjnego protokołu wczesnej diagnostyki PD opartego na współdziedziczeniu wielu rzadkich szkodliwych wariantów genów PD;
- generowanie indukowanych pluripotencjalnych linii komórkowych (iPSC) poprzez przeprogramowanie PBMC od pacjentów z PD i znajomych zdrowych dawców.
Po podpisaniu świadomej zgody pacjenci będą oceniani pod kątem progresji choroby (Stadio di Hoehn i Yahr, MDS-UPDRS część III, test MOCA, brak objawów ruchowych, terapia i występowanie LID, zaburzenia snu). Każdy pacjent i grupa kontrolna zostaną poddani pobraniu próbek krwi obwodowej w celu izolacji DNA, osocza, surowicy, PBMC. Dla podzbioru pacjentów indukowane pluripotencjalne komórki macierzyste (iPSC) będą generowane począwszy od PBMC.
Podejście polegające na sekwencjonowaniu całego genomu zostanie wykorzystane do zidentyfikowania nowych powiązanych wariantów.
Zaplanowana zostanie szeroko zakrojona analiza obliczeniowa w celu zmapowania SNP do regionów regulatorowych kontrolujących ekspresję wybranych genów. Wysiłek ten zapewni wstępną wiedzę do opracowania powiązania między poszczególnymi genomowymi SNP i ich kombinacjami ze sporadyczną PD. To przedsięwzięcie ma kluczowe znaczenie dla pogłębienia naszej wiedzy na temat genetycznych korzeni PD i jest zgodne z analogicznymi trwającymi badaniami międzynarodowymi, z którymi będziemy dążyć do koordynacji. Sukces tych badań zapewni środki do opracowania predykcyjnych testów genetycznych i poradnictwa dla pacjentów z PD i ich rodzin.
Aby zwiększyć moc analizy, zostaną przeanalizowane dane, w tym dane WES kohorty 800 pacjentów z PD i 300 zdrowych osób, które są już dostępne w IRCCS INM Neuromed.
Typ studiów
Zapisy (Szacowany)
Kontakty i lokalizacje
Kontakt w sprawie studiów
- Nazwa: Vania Broccoli, PhD
- Numer telefonu: +39 0226434616
- E-mail: broccoli.vania@hsr.it
Lokalizacje studiów
-
-
Italy
-
Milan, Italy, Włochy, 20132
- Rekrutacyjny
- IRCCS San Raffaele
-
Kontakt:
- Vania Broccoli, PhD
- Numer telefonu: 0226434616
- E-mail: broccoli.vania@hsr.it
-
-
Kryteria uczestnictwa
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
Akceptuje zdrowych ochotników
Metoda próbkowania
Badana populacja
Opis
Kryteria włączenia Pacjenci z PD:
- Obecność co najmniej 2 z 4 głównych objawów (drżenie, sztywność, spowolnienie ruchowe, początek asymetrii), z których jednym musi być drżenie lub spowolnienie ruchowe;
- Brak nietypowych objawów, takich jak: i) wczesna niestabilność postawy, zjawisko zamrożenia, upośledzenie funkcji poznawczych, omamy, patologiczne ruchy mimowolne, porażenie wzroku w pionie; ii) potwierdzone przyczyny parkinsonizmu wtórnego (zmiany ogniskowe, leki, substancje toksyczne);
- Udokumentowana odpowiedź na zastosowanie L-dopy lub agonistów dopaminy (lub brak odpowiedniej próby terapeutycznej z zastosowaniem L-dopy lub agonistów dopaminy).
Kryteria włączenia Pacjenci z RBD:
• Osoby dotknięte idiopatycznym RBD, które zostaną wybrane zgodnie z najnowszymi kryteriami międzynarodowej klasyfikacji zaburzeń snu (ICSD-3).
Kryteria wyłączenia:
- istniejące wcześniej stany psychiczne;
- Neurodegeneracyjne choroby neurologiczne, takie jak stwardnienie rozsiane, stwardnienie zanikowe boczne, choroba Alzheimera, patologie nerwowo-mięśniowe, padaczka;
- diagnoza demencji;
- depresja;
- długotrwałe przyjmowanie leków przeciwlękowych, przeciwdepresyjnych, przeciwpsychotycznych, nasennych, pobudzających funkcje poznawcze
Plan studiów
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
objawy motoryczne i niemotoryczne pacjentów z PD i RBD zostaną ocenione za pomocą MDS-UPDRS
Ramy czasowe: 2 lata
|
MDS-UPDRS składa się z czterech części, a mianowicie: I: Niemotoryczne doświadczenia życia codziennego; II: Doświadczenia motoryczne życia codziennego; III: Badanie motoryczne; IV: Komplikacje ruchowe.
Pacjent/opiekun wypełnia dwadzieścia pytań
|
2 lata
|
|
ocena kliniczna zaburzeń snu u pacjentów z PD i RBD
Ramy czasowe: 2 lata
|
obecność zaburzeń snu zostanie oceniona przez Munich Parasomnia Screening (MUPS)
|
2 lata
|
|
Kliniczna ocena zaburzeń snu u pacjentów z PD i RBD za pomocą polisomnografii
Ramy czasowe: 2 lata
|
Mikrostruktura snu zostanie oceniona poprzez analizę naprzemiennego wzoru cyklicznego (CAP), markera niestabilności snu NREM.
|
2 lata
|
|
kliniczna ocena zaburzeń funkcji poznawczych pacjentów z PD i RBD za pomocą wyniku testu MoCA
Ramy czasowe: 2 lata
|
Montrealska ocena poznawcza (MoCA) to test stosowany przez pracowników służby zdrowia do oceny osób z utratą pamięci lub innymi objawami pogorszenia funkcji poznawczych.
MoCA zawiera 30 pytań i sprawdza różne rodzaje zdolności poznawczych lub myślenia.
Należą do nich: orientacja, pamięć krótkotrwała/przypominanie opóźnione, funkcje wykonawcze/zdolność wzrokowo-przestrzenna, test rysowania zegara.
|
2 lata
|
|
ocena kliniczna dyskinezy indukowanej lewodopą (LID) u pacjentów z ChP
Ramy czasowe: 2 lata
|
Wystąpienie LID będzie związane z dawką lewodopy i czasem trwania terapii
|
2 lata
|
|
związek z fenotypową manifestacją PD
Ramy czasowe: 2 lata
|
Obecność jednego lub więcej wariantów zostanie przetestowana pod kątem związku z fenotypowymi objawami PD (objawy motoryczne, niemotoryczne i poznawcze, a także wiek zachorowania, LID i zmiany neuroobrazowe) w celu oceny wpływu obciążenia wariantami na progresję i rokowanie choroby
|
2 lata
|
|
objawy motoryczne pacjentów z PD i RBD będą oceniane za pomocą skali Hoehna i Yahra (HY).
Ramy czasowe: 2 lata
|
Skala Hoehna i Yahra zostanie wykorzystana do pomiaru postępu objawów choroby Parkinsona i stopnia niepełnosprawności.
Obejmuje etapy od 1 do 5: Etap 1. Tylko jednostronne zajęcie, zwykle z minimalnym upośledzeniem czynnościowym lub bez niego; Stopień 2 = choroba obustronna, bez zaburzeń równowagi; Etap 3 = łagodna do umiarkowanej choroba obustronna; pewna niestabilność postawy; fizycznie niezależny.
Etap 4 = Ciężka niepełnosprawność; nadal może chodzić lub stać bez pomocy.
Etap 5 = Przykuty do wózka inwalidzkiego lub przykuty do łóżka, chyba że jest wspomagany.
|
2 lata
|
|
identyfikacja wariantów/mutacji
Ramy czasowe: 2 lata
|
liczba rzadkich wielokrotności (częstość mniejszych alleli, MAF <0,01)
szkodliwe (zmiana sensu, nonsens, zmiana ramki odczytu i splicing) warianty genów PD będą liczone u pacjentów z PD i niespokrewnionych zdrowych osobników.
Badanie asocjacji kliniczno-kontrolnej oceni ryzyko PD
|
2 lata
|
Współpracownicy i badacze
Sponsor
Śledczy
- Główny śledczy: Vania Broccoli, PhD, IRCCS San Raffaele
Daty zapisu na studia
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
Zakończenie podstawowe (Rzeczywisty)
Ukończenie studiów (Szacowany)
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia weryfikacja
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Dodatkowe istotne warunki MeSH
- Synukleinopatie
- Choroby mózgu
- Choroby ośrodkowego układu nerwowego
- Choroby Układu Nerwowego
- Zaburzenia psychiczne
- Choroby neurodegeneracyjne
- Zaburzenia snu i czuwania
- Zaburzenia ruchowe
- Zaburzenia Parkinsona
- Choroby jąder podstawy
- Parasomnie
- Parasomnie snu REM
- Choroba Parkinsona
- Zaburzenia zachowania podczas snu REM
- Techniki śledcze
- Techniki genetyczne
- Analiza sekwencji
- Analiza sekwencji, DNA
- Sekwencjonowanie całego genomu
Inne numery identyfikacyjne badania
- PNRR-MAD-2022-12375960
Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)
Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?
Opis planu IPD
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .