Эта страница была переведена автоматически, точность перевода не гарантируется. Пожалуйста, обратитесь к английской версии для исходного текста.

Внедрение национального биобанка PD с WGS и функциональной оценкой полигенного наследования с помощью технологии iPSC

25 марта 2026 г. обновлено: Vania Broccoli, IRCCS San Raffaele

Внедрение национального биобанка генетической, спорадической и продромальной болезни Паркинсона с полногеномным анализом и функциональной оценкой полигенного наследования с помощью технологии iPSC

Генетическая сложность и гетерогенность спорадических форм болезни Паркинсона (БП) создают серьезную проблему для распутывания их непосредственных молекулярных причин. Для продвижения этого исследования мы планируем координировать наши местные биорепозитории биологических образцов БП, создавая стандартизированный и интегрированный национальный ресурс. В этой связи мы планируем собрать больше образцов от дополнительных спорадических случаев болезни Паркинсона и расширить выборку пациентов с поведенческим заболеванием быстрого сна. Мы планируем масштабную кампанию по секвенированию всего генома, включающую около 200 пациентов, для выявления редких геномных вариантов, вероятно связанных с этими заболеваниями. Кроме того, мы стандартизируем производство и контроль качества линий ИПСК, чтобы сделать их доступными для научного сообщества. Наконец, мы объединим технологию иПСК и редактирование генов, чтобы функционально оценить относительное влияние редких вариантов в кодирующих областях, унаследованных вместе как полигенный признак, ранее идентифицированный в отдельных спорадических случаях БП.

Обзор исследования

Статус

Рекрутинг

Условия

Вмешательство/лечение

Подробное описание

Проект представляет собой многоцентровое обсервационное исследование. Участвующие учреждения:

Больница IRCCS Сан-Раффаэле, Милан, Италия (координатор, операционное отделение (OU1)) IRCCS INM Neuromed, Pozzilli, (IS) Италия (операционное отделение (OU2)) IRCCS, Сан-Раффаэле, Рим, (операционное отделение (OU3)) Проект использует преимущества наличие большой коллекции образцов ПД (~800) ПД от знакомых и спорадических случаев, набранных в ИРЦКС «Нейромед», для которых мы уже собрали и сохранили клиническую информацию, генетические данные, а также мононуклеары ДНК, сыворотки, плазмы и периферической крови ( РВМС) для всей исследуемой когорты.

Деятельность ИРЦКС ИВМ Нейромед:

  1. стандартизация клинической отчетности, сбора образцов, хранения и идентификации между центрами;
  2. набор 100 пациентов с БП, 30 пациентов с РБД и 100 здоровых лиц (жен/мужей пациентов) во время плановых амбулаторных посещений этих пациентов;
  3. полногеномное секвенирование (WGS) и биоинформатический анализ (в сотрудничестве с OU1) выбранной когорты пациентов с БП (200 образцов), отрицательных на наличие мутаций/вариантов в генах-кандидатах на БП;
  4. WGS-анализ пациентов с продромальным расстройством поведения во время быстрого сна (RBD) в качестве модели для выявления раннего биомаркера БП;
  5. разработка инновационного протокола для ранней диагностики БП, основанного на совместном наследовании нескольких редких вредных вариантов в генах БП;
  6. создание индуцированных плюрипотентных клеточных линий (ИПСК) путем перепрограммирования РВМС от пациентов с БП и знакомых здоровых доноров.

После подписания информированного согласия пациенты будут оцениваться на предмет прогрессирования заболевания (Stadio di Hoehn and Yahr, MDS-UPDRS часть III, тест MOCA, отсутствие двигательных симптомов, терапия и возникновение LID, расстройство поведения во сне). У каждого пациента и контроля будет проведен забор периферической крови для выделения ДНК, плазмы, сыворотки, РВМС. Для подмножества пациентов будут созданы индуцированные плюрипотентные стволовые клетки (ИПСК), начиная с РВМС.

Подход к секвенированию всего генома будет использоваться для выявления новых ассоциированных вариантов.

Будет запланирован обширный вычислительный анализ для сопоставления SNP с регуляторными областями, контролирующими экспрессию выбранных генов. Эти усилия предоставят первоначальные знания для определения связи между конкретными геномными SNP и их комбинациями со спорадическими БП. Это усилие имеет решающее значение для улучшения нашего понимания генетических корней БП и соответствует аналогичным текущим международным исследованиям, с которыми мы будем стремиться координировать свои действия. Успех этого исследования предоставит средства для разработки предиктивного генетического тестирования и консультирования пациентов с БП и их семей.

Для увеличения мощности анализ данных будет проанализирован, включая данные WES когорты из 800 пациентов с БП и 300 здоровых субъектов, уже имеющихся в IRCCS INM Neuromed.

Тип исследования

Наблюдательный

Регистрация (Оцененный)

230

Контакты и местонахождение

В этом разделе приведены контактные данные лиц, проводящих исследование, и информация о том, где проводится это исследование.

Контакты исследования

  • Имя: Vania Broccoli, PhD
  • Номер телефона: +39 0226434616
  • Электронная почта: broccoli.vania@hsr.it

Места учебы

  • Италия
    • Italy
      • Milan, Italy, Италия, 20132
        • Рекрутинг
        • IRCCS San Raffaele
        • Контакт:
          • Vania Broccoli, PhD
          • Номер телефона: 0226434616
          • Электронная почта: broccoli.vania@hsr.it

Критерии участия

Исследователи ищут людей, которые соответствуют определенному описанию, называемому критериям приемлемости. Некоторыми примерами этих критериев являются общее состояние здоровья человека или предшествующее лечение.

Критерии приемлемости

Возраст, подходящий для обучения

18 лет и старше (Взрослый, Пожилой взрослый)

Принимает здоровых добровольцев

Да

Метод выборки

Вероятностная выборка

Исследуемая популяция

В исследование включены 100 пациентов с БП, 30 RBD и 100 человек из контрольной группы того же возраста/пола. Все пациенты с БП будут диагностированы в IRCCS Neuromed и будут находиться под наблюдением (не менее 3 лет) на предмет прогрессирования заболевания.

Описание

Критерии включения пациентов с БП:

  • Наличие не менее 2 из 4 основных признаков (тремор, ригидность, брадикинезия, асимметричное начало), один из которых должен быть тремором или брадикинезией;
  • Отсутствие атипичных симптомов, таких как: i) ранняя постуральная неустойчивость, явления замирания, когнитивные нарушения, галлюцинации, патологические непроизвольные движения, паралич вертикального взора; ii) подтвержденные причины вторичного паркинсонизма (очаговые поражения, лекарственные препараты, токсические вещества);
  • Документально подтвержденный ответ на применение леводопы или агонистов дофамина (или отсутствие адекватной терапевтической попытки с применением леводопы или агонистов дофамина).

Критерии включения пациентов с RBD:

• Субъекты, страдающие идиопатическим RBD, которые будут отобраны в соответствии с самыми последними критериями международной классификации нарушений сна (ICSD-3).

Критерий исключения:

  • ранее существовавшие психические заболевания;
  • Нейродегенеративные неврологические заболевания, такие как рассеянный склероз, боковой амиотрофический склероз, болезнь Альцгеймера, нервно-мышечные патологии, эпилепсия;
  • диагностика деменции;
  • депрессия;
  • длительный прием анксиолитиков, антидепрессантов, нейролептиков, снотворных, когнитивных стимуляторов

Учебный план

В этом разделе представлена ​​подробная информация о плане исследования, в том числе о том, как планируется исследование и что оно измеряет.

Как устроено исследование?

Детали дизайна

Что измеряет исследование?

Первичные показатели результатов

Мера результата
Мера Описание
Временное ограничение
моторные и немоторные симптомы пациентов с БП и RBD будут оцениваться с помощью MDS-UPDRS
Временное ограничение: 2 года
MDS-UPDRS состоит из четырех частей, а именно: I: немоторный опыт повседневной жизни; II: Моторные переживания повседневной жизни; III: Моторное обследование; IV: Моторные осложнения. Двадцать вопросов заполняются пациентом/лицом, осуществляющим уход.
2 года
клиническая оценка нарушений сна у пациентов с БП и СД
Временное ограничение: 2 года
наличие нарушений сна будет оцениваться Мюнхенским скринингом на парасомнию (MUPS)
2 года
клиническая оценка нарушений сна у пациентов с БП и ДКР методом полисомнографии
Временное ограничение: 2 года
Микроструктура сна будет оцениваться путем анализа чередующегося циклического паттерна (CAP), маркера нестабильности медленного сна.
2 года
клиническая оценка когнитивных нарушений у пациентов с БП и синдромом рефрактерного расстройства по шкале теста MoCA
Временное ограничение: 2 года
Монреальский когнитивный тест (MoCA) — это тест, используемый медицинскими работниками для оценки людей с потерей памяти или другими симптомами снижения когнитивных функций. MoCA содержит 30 вопросов и проверяет различные типы когнитивных или мыслительных способностей. К ним относятся: ориентация, кратковременная память/отсроченная память, исполнительная функция/зрительно-пространственные способности, тест рисования часов.
2 года
клиническая оценка леводопа-индуцированной дискинезии (LID) у пациентов с БП
Временное ограничение: 2 года
Возникновение LID будет связано с дозировкой леводопы и временем терапии.
2 года
ассоциация с фенотипическим проявлением БП
Временное ограничение: 2 года
Наличие одного или нескольких вариантов будет проверено на связь с фенотипическими проявлениями БП (моторные, немоторные и когнитивные признаки, а также возраст начала заболевания, изменения LID и нейровизуализации) для оценки влияния бремени вариантов на прогрессирование и прогноз. болезни
2 года
двигательные симптомы пациентов с БП и RBD будут оцениваться по шкале Хена и Яра (HY)
Временное ограничение: 2 года
Шкала Хена и Яра будет использоваться для измерения прогрессирования симптомов болезни Паркинсона и уровня инвалидности. Он включает стадии с 1 по 5: Стадия 1. Только одностороннее поражение, обычно с минимальными функциональными нарушениями или без них; Стадия 2 = Двустороннее заболевание без нарушения равновесия; Стадия 3 = двустороннее заболевание от легкой до умеренной степени; некоторая постуральная нестабильность; физически независимым. Стадия 4 = тяжелая инвалидность; все еще может ходить или стоять без посторонней помощи. Стадия 5 = Прикован к инвалидной коляске или прикован к постели без посторонней помощи.
2 года
идентификация вариантов/мутаций
Временное ограничение: 2 года
количество множественных редких (минорная частота аллеля, MAF<0,01) вредные (миссенс, бессмысленные, сдвиг рамки считывания и сплайсинг) варианты в генах БП будут подсчитываться у пациентов с БП и неродственных здоровых субъектов. Исследование ассоциации случай-контроль позволит оценить риск БП
2 года

Соавторы и исследователи

Здесь вы найдете людей и организации, участвующие в этом исследовании.

Спонсор

IRCCS San Raffaele

Следователи

  • Главный следователь: Vania Broccoli, PhD, IRCCS San Raffaele

Даты записи исследования

Эти даты отслеживают ход отправки отчетов об исследованиях и сводных результатов на сайт ClinicalTrials.gov. Записи исследований и сообщаемые результаты проверяются Национальной медицинской библиотекой (NLM), чтобы убедиться, что они соответствуют определенным стандартам контроля качества, прежде чем публиковать их на общедоступном веб-сайте.

Изучение основных дат

Начало исследования (Действительный)

30 октября 2023 г.

Первичное завершение (Действительный)

4 марта 2026 г.

Завершение исследования (Оцененный)

1 декабря 2026 г.

Даты регистрации исследования

Первый отправленный

30 января 2023 г.

Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества

8 февраля 2023 г.

Первый опубликованный (Действительный)

10 февраля 2023 г.

Обновления учебных записей

Последнее опубликованное обновление (Действительный)

30 марта 2026 г.

Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества

25 марта 2026 г.

Последняя проверка

1 марта 2026 г.

Дополнительная информация

Термины, связанные с этим исследованием

Дополнительные соответствующие термины MeSH

Другие идентификационные номера исследования

  • PNRR-MAD-2022-12375960

Планирование данных отдельных участников (IPD)

Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?

НЕ РЕШЕНО

Описание плана IPD

генетические данные

Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы

Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.

Нет

Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.

Нет

Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .

Подписаться