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Impacto do sistema de perfusão pulmonar ex vivo no microbioma dos enxertos pulmonares e sua reação inflamatória. (ExBioma)

31 de janeiro de 2024 atualizado por: Irene Bello, Vall d'Hebron Institute Research

Sabe-se que as interações do microbioma do enxerto e do receptor são capazes de modular respostas imunes, induzindo resiliência ou exacerbação de diversos processos inflamatórios ou fibróticos, portanto variações no microbioma pulmonar estão associadas a alterações imunológicas no pulmão transplantado.

O objetivo principal é compreender o impacto de novos sistemas de condicionamento e melhoria de enxertos pulmonares subótimos com perfusão ex vivo (EVLP) no microbioma pulmonar e sua associação com inflamação tecidual.

A hipótese é que a manipulação de enxertos pulmonares e a perfusão com antibióticos de amplo espectro durante o condicionamento EVLP alteram o microbioma pulmonar, condicionando um ambiente menos pró-inflamatório.

A metodologia: Este é um estudo observacional prospectivo unicêntrico. Serão incluídos no estudo 7 doadores consecutivos com morte cerebral que não atendam aos critérios para serem doadores de pulmão. Serão realizados:

  • P1. Detecção: Doador sem critérios para ser doador de pulmão ou rejeitado por todas as equipes de transplante.
  • P2. Extração.
  • P3. Preservação a frio: O pulmão esquerdo será preservado a frio
  • P4. Conservação EVLP: O pulmão direito será preparado e condicionado por 3 horas usando EVLP

As seguintes amostras serão coletadas em dois momentos:

  • T0: No final da extração
  • Lavado broncoalveolar (LBA): Antes do pinçamento traqueal, o LBA será retirado do brônquio principal esquerdo por meio de broncoscopia. O LBA será realizado no pulmão direito pouco antes do início do P4.
  • Biópsia pulmonar: Será realizada biópsia pulmonar do lobo inferior de ambos os enxertos
  • Líquido de preservação ou Líquido de perfusão: 20 mL de líquido de preservação que fica em contato com o enxerto esquerdo antes do armazenamento, como controle de esterilidade (P3) e 20 mL de líquido de perfusão antes do condicionamento, como controle de esterilidade (P4).
  • T1: Ao final dos protocolos de conservação (P3 ou P4).
  • B.A.L.
  • Biópsia pulmonar: lobo inferior esquerdo.
  • Líquido de preservação ou Líquido de infusão: 20 mL de líquido de preservação que esteja em contato com o enxerto esquerdo ou 20 mL de líquido de perfusão.

Devido à manipulação dos enxertos durante a extração e utilização da técnica, que envolve a extubação do doador e posterior intubação dos enxertos, além da perfusão por no mínimo 3 horas com antibióticos, o uso da EVLP poderia alterar o microbioma do enxertos. Essa alteração poderá impactar na obtenção de órgãos viáveis ​​para transplante, tanto no pós-operatório imediato como nos resultados em longo prazo. Não existem estudos que analisem a alteração do microbioma após o condicionamento com EVLP ou sua relação com parâmetros inflamatórios.

Visão geral do estudo

Status

Recrutamento

Condições

Intervenção / Tratamento

Descrição detalhada

COLETA E ARMAZENAMENTO DE AMOSTRAS

  • BAL:
  • Técnica: O broncoscópio será inserido no segmento 6, serão instiladas alíquotas de soro fisiológico estéril. O procedimento será repetido nos segmentos 3 e 5, no caso do pulmão direito, e no segmento 6 e língula no pulmão esquerdo. 20-30 cc de BAL serão completados para cada enxerto.
  • Armazenamento: As amostras serão congeladas imediatamente após a coleta e transferidas para o laboratório com acumulador de frio para garantir que não descongelem.
  • Análise: O microbioma pulmonar será analisado.
  • Biópsia pulmonar:
  • Técnica: Será realizada biópsia pulmonar de no mínimo 2cm3 com sutura automática inabsorvível.
  • Armazenamento: As amostras serão preservadas em solução reagente de estabilização de RNA (QIAGEN), que permite que as amostras sejam mantidas em temperatura ambiente até serem congeladas, evitando a degradação do RNA.
  • Análise: Sequenciamento de RNA de transcrição de sinais inflamatórios.
  • Solução líquida de perfusão ex vivo:
  • Técnica: Coleta de amostras estéreis com seringa de 20 cc.
  • Armazenamento: As amostras serão congeladas imediatamente após a coleta e transferidas para o laboratório com acumulador de frio para garantir que não descongelem.
  • Análise: análise do microbioma
  • Solução líquida de preservação:
  • Técnica: Coleta de amostras estéreis com seringa de 20 cc.
  • Armazenamento: As amostras serão congeladas imediatamente após a coleta e transferidas para o laboratório com acumulador de frio para garantir que não descongelem.
  • Análise: análise de microbioma e citocinas

Todas as amostras serão armazenadas em freezer a -80

- Análise do microbioma Para análise da diversidade microbiana, a região variável V4 do gene 16S será amplificada a partir do DNA bacteriano por PCR. Os amplicons serão sequenciados usando a tecnologia Illumina (MiSeq). As amostras serão processadas e mais de 10.000 sequências de 300 pb por sequência por amostra serão geradas.

Análise de expressão gênica A extração de RNA será realizada utilizando o kit comercial RNeasy Mini Kit (QIAGEN). A análise da expressão gênica será realizada por PCR quantitativo (qPCR) usando o painel TransplantRejection pré-projetado da SignArray (AnyGenes®, Paris, França) que inclui 84 ​​genes que foram descritos como relacionados à resposta imune na rejeição de transplantes. São eles: Genes incluídos no painel: CX3CR1, ICAM1, ITGA2, ITGAE, ITGAM, PECAM1, THBS1, THBS2, VCAM1, COL1A2, CCR5, CCR7, CD40, CD40LG, CD80, CD86, CTLA4, CXCR3, STAT4, TGFB1, CD44 , CTGF, MMP1, MMP2, MMP7, MMP9, BMP7, CCL11, CCL2, CCL3, CCL4, CCL5, CSF2, CXCL10, IFNG, IL10, IL12A, IL13, IL16, IL1B, IL2, IL2RA, IL3, IL32, IL4, IL5 , IL6, IL8, TNF, TGFB2, TGFB3, TIMP1, VEGFA, MS4A1, CXCL11, CXCL9, CXCR4, ADAM17, C3, CASP1, CASP3, CASP8, CCR2, CCR3, CD14, CD28, CD8A, FAS, FASLG, FCGR1A, GZMA , GZMB, NFKB1, NOS2, PRF1, PSMB9, STAT1, STAT6, TAP1, TLR3, TLR4, TLR9, TNFAIP3, TNFSF10.

- Análise de citocinas A determinação de citocinas no fluido de perfusão será realizada utilizando imunoensaios baseados na tecnologia Luminex™ xMAP™ (perfil multi-analítico) que permitem a quantificação e detecção simultânea de diferentes proteínas secretadas (citocinas, quimiocinas, fatores de crescimento, etc. .) Usaremos painéis projetados especificamente para os produtos genéticos de interesse.

Os níveis de citocinas são medidos utilizando um imunoensaio baseado na tecnologia Luminex™ xMAP™ que permite a análise multiparamétrica das diferentes citocinas. Para tal, é desenhado um painel personalizado de citocinas com base na literatura publicada sobre o efeito das estatinas na produção de citocinas e outras quimiocinas pró-inflamatórias a nível sistémico, bem como em evidências bibliográficas sobre as citocinas envolvidas no transplante pulmonar. As citocinas analisadas no painel desenhado para esse fim são IFN gama, IL-1 beta, IL-6, IL-8 (CXCL8), IL-18, IP-10 (CXCL10), MCP-1 (CCL2), MIP- 1 alfa (CCL3), TNF alfa, VEGF-D (Custom Procartaplex Multiplex Panel, Invitrogen, ThermoFisher Scientific, MA, EUA). A análise imunológica será realizada utilizando o software Invitrogen ProcartaPlex Analyst 1.0, fornecido com os reagentes.

- Análise bioinformática das sequências Para obtenção da composição microbiana de cada amostra utilizaremos o software QIIME. QIIME é um pipeline de software que utiliza informações filogenéticas e técnicas estatísticas multivariadas para comparar comunidades microbianas e determinar, por exemplo, se elas são estatisticamente diferentes. O programa também identifica as espécies que mais contribuem para essas diferenças e descobre padrões de diversos tipos que caracterizam grupos específicos de amostras.

Tipo de estudo

Intervencional

Inscrição (Estimado)

7

Estágio

  • Não aplicável

Contactos e Locais

Esta seção fornece os detalhes de contato para aqueles que conduzem o estudo e informações sobre onde este estudo está sendo realizado.

Contato de estudo

Estude backup de contato

Locais de estudo

Critérios de participação

Os pesquisadores procuram pessoas que se encaixem em uma determinada descrição, chamada de critérios de elegibilidade. Alguns exemplos desses critérios são a condição geral de saúde de uma pessoa ou tratamentos anteriores.

Critérios de elegibilidade

Idades elegíveis para estudo

  • Adulto
  • Adulto mais velho

Aceita Voluntários Saudáveis

Não

Descrição

Critério de inclusão:

  • doadores com morte encefálica e doadores após morte cardiocirculatória rejeitados para transplante de pulmão

Critério de exclusão:

  • Pneumonia unilateral
  • Falta de consentimento da família do doador.

Plano de estudo

Esta seção fornece detalhes do plano de estudo, incluindo como o estudo é projetado e o que o estudo está medindo.

Como o estudo é projetado?

Detalhes do projeto

  • Finalidade Principal: Tratamento
  • Alocação: Não randomizado
  • Modelo Intervencional: Atribuição Paralela
  • Mascaramento: Nenhum (rótulo aberto)

Armas e Intervenções

Grupo de Participantes / Braço
Intervenção / Tratamento
Experimental: EVLP
O pulmão direito será perfundido por 3h com EVLP
Comparador Ativo: Preservação a frio
O pulmão esquerdo será preservado a frio conforme protocolo usual

O que o estudo está medindo?

Medidas de resultados primários

Medida de resultado
Descrição da medida
Prazo
Alteração nas unidades taxonômicas operacionais individuais (OTUs) no parênquima pulmonar após perfusão pulmonar exvivo durante 3 horas
Prazo: Após 3 horas de perfusão em perfusão pulmonar ex vivo
Analisar o microbioma pulmonar e a diversidade alfa antes do uso da perfusão pulmonar exvivo e depois de comparar as amostras micrológicas
Após 3 horas de perfusão em perfusão pulmonar ex vivo
Analisando com PCR quantitativo a expressão genética de 84 genes relacionados à resposta imune em transplante pulmonar após perfusão pulmonar durante 3h em sistema de perfusão pulmonar exvivo.
Prazo: Após 3 horas de perfusão em perfusão pulmonar ex vivo
Analisar com PCR quantitativo a expressão genética de 84 genes relacionados à resposta imune no transplante pulmonar: CX3CR1, ICAM1, ITGA2, ITGAE, ITGAM, PECAM1, THBS1, THBS2, VCAM1, COL1A2, CCR5, CCR7, CD40, CD40LG, CD80, CD86 , CTLA4, CXCR3, STAT4, TGFB1, CD44, CTGF, MMP1, MMP2, MMP7, MMP9, BMP7, CCL11, CCL2, CCL3, CCL4, CCL5, CSF2, CXCL10, IFNG, IL10, IL12A, IL13, IL16, IL1B, IL2 , IL2RA, IL3, IL32, IL4, IL5, IL6, IL8, TNF, TGFB2, TGFB3, TIMP1, VEGFA, MS4A1, CXCL11, CXCL9, CXCR4, ADAM17, C3, CASP1, CASP3, CASP8, CCR2, CCR3, CD14, CD28 , CD8A, FAS, FASLG, FCGR1A, GZMA, GZMB, NFKB1, NOS2, PRF1, PSMB9, STAT1, STAT6, TAP1, TLR3, TLR4, TLR9, TNFAIP3, TNFSF10 em amostras pulmonares antes do uso de perfusão pulmonar exvivo e após, comparando eles
Após 3 horas de perfusão em perfusão pulmonar ex vivo
Analisar a concentração de citocinas inflamatórias após perfusão pulmonar exvivo
Prazo: Após 3 horas de perfusão em perfusão pulmonar ex vivo
Analise a concentração de citocinas inflamatórias: IFN gama, IL-1 beta, IL-6, IL-8 (CXCL8), IL-18, IP-10 (CXCL10), MCP-1 (CCL2), MIP-1 alfa (CCL3) ), TNF alfa, VEGF-D, pela técnica Luminex xMAP, em solução de perfusão antes e após o uso da perfusão pulmonar exvivo e comparando-os
Após 3 horas de perfusão em perfusão pulmonar ex vivo
Mudança nas unidades taxonômicas operacionais individuais (OTUs) no parênquima pulmonar após armazenamento refrigerado
Prazo: Após 3 horas de armazenamento refrigerado
Analisar o microbioma pulmonar e a diversidade alfa antes e depois do armazenamento refrigerado e comparar as amostras micrológicas.
Após 3 horas de armazenamento refrigerado
Análise da concentração de citocinas inflamatórias após armazenamento refrigerado
Prazo: Após 3 horas de armazenamento refrigerado
Analise a concentração de citocinas inflamatórias: IFN gama, IL-1 beta, IL-6, IL-8 (CXCL8), IL-18, IP-10 (CXCL10), MCP-1 (CCL2), MIP-1 alfa (CCL3) ), TNF alfa, VEGF-D, pela técnica Luminex xMAP, em solução de perfusão antes e após o armazenamento refrigerado e comparando-os
Após 3 horas de armazenamento refrigerado
Análise com PCR quantitativo da expressão genética de 84 genes relacionados à resposta imune em transplante pulmonar após armazenamento refrigerado
Prazo: Após 3 horas de armazenamento refrigerado
Analisar com PCR quantitativo a expressão genética de 84 genes relacionados à resposta imune no transplante pulmonar: CX3CR1, ICAM1, ITGA2, ITGAE, ITGAM, PECAM1, THBS1, THBS2, VCAM1, COL1A2, CCR5, CCR7, CD40, CD40LG, CD80, CD86 , CTLA4, CXCR3, STAT4, TGFB1, CD44, CTGF, MMP1, MMP2, MMP7, MMP9, BMP7, CCL11, CCL2, CCL3, CCL4, CCL5, CSF2, CXCL10, IFNG, IL10, IL12A, IL13, IL16, IL1B, IL2 , IL2RA, IL3, IL32, IL4, IL5, IL6, IL8, TNF, TGFB2, TGFB3, TIMP1, VEGFA, MS4A1, CXCL11, CXCL9, CXCR4, ADAM17, C3, CASP1, CASP3, CASP8, CCR2, CCR3, CD14, CD28 , CD8A, FAS, FASLG, FCGR1A, GZMA, GZMB, NFKB1, NOS2, PRF1, PSMB9, STAT1, STAT6, TAP1, TLR3, TLR4, TLR9, TNFAIP3, TNFSF10 em amostras de pulmão antes e depois do armazenamento refrigerado, comparando-as
Após 3 horas de armazenamento refrigerado

Colaboradores e Investigadores

É aqui que você encontrará pessoas e organizações envolvidas com este estudo.

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Colaboradores

Investigadores

  • Diretor de estudo: Irene Bello Rodríguez, Professor, Hospital Clinic of Barcelona

Datas de registro do estudo

Essas datas acompanham o progresso do registro do estudo e os envios de resumo dos resultados para ClinicalTrials.gov. Os registros do estudo e os resultados relatados são revisados ​​pela National Library of Medicine (NLM) para garantir que atendam aos padrões específicos de controle de qualidade antes de serem publicados no site público.

Datas Principais do Estudo

Início do estudo (Real)

1 de junho de 2021

Conclusão Primária (Estimado)

1 de abril de 2024

Conclusão do estudo (Estimado)

1 de junho de 2024

Datas de inscrição no estudo

Enviado pela primeira vez

23 de dezembro de 2023

Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ

31 de janeiro de 2024

Primeira postagem (Estimado)

9 de fevereiro de 2024

Atualizações de registro de estudo

Última Atualização Postada (Estimado)

9 de fevereiro de 2024

Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade

31 de janeiro de 2024

Última verificação

1 de janeiro de 2024

Mais Informações

Termos relacionados a este estudo

Termos MeSH relevantes adicionais

Outros números de identificação do estudo

  • ExBioma

Plano para dados de participantes individuais (IPD)

Planeja compartilhar dados de participantes individuais (IPD)?

NÃO

Informações sobre medicamentos e dispositivos, documentos de estudo

Estuda um medicamento regulamentado pela FDA dos EUA

Não

Estuda um produto de dispositivo regulamentado pela FDA dos EUA

Não

Essas informações foram obtidas diretamente do site clinicaltrials.gov sem nenhuma alteração. Se você tiver alguma solicitação para alterar, remover ou atualizar os detalhes do seu estudo, entre em contato com register@clinicaltrials.gov. Assim que uma alteração for implementada em clinicaltrials.gov, ela também será atualizada automaticamente em nosso site .